Basic Information

Symbol
KCNA2
RNA class
mRNA
Alias
Potassium Voltage-Gated Channel Subfamily A Member 2 Kv1.2 HK4 Potassium Voltage-Gated Channel, Shaker-Related Subfamily, Member 2 Voltage-Gated Potassium Channel Subunit Kv1.2 Voltage-Gated Potassium Channel HBK5 Voltage-Gated K(+) Channel HuKIV NGK1 Potassium Channel, Voltage Gated Shaker Related Subfamily A, Member 2 Voltage-Gated Potassium Channel Protein Kv1.2 EC 3.6.1.27 EC 6.1.1 EIEE32 DEE32 HUKIV HBK5 RBK2 MK2
Location (GRCh38)
1:110519837-110631474
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004974.4
Sequence length
11829.0 nt
GC content
0.4656

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3841.07 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4051.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3327.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001204269.2 NCBI
AGCGCCAAGACUUCUGCAGGAGAGCCUCCGCUGGGCUUUCAAGUUGGCA… 1925 nt 0.5112
NM_004974.4 NCBI
AUUCUGUGCUCCCUGCCGAGGAGAUGUGAGGGAUUUUCUCUUGGGGGAG… 11829 nt 0.4656
Summary

Potassium channels represent the most complex class of voltage-gated ion channels from both functional and structural standpoints. Their diverse functions include regulating neurotransmitter release, heart rate, insulin secretion, neuronal excitability, epithelial electrolyte transport, smooth muscle contraction, and cell volume. Four sequence-related potassium channel genes - shaker, shaw, shab, and shal - have been identified in Drosophila, and each has been shown to have human homolog(s). This gene encodes a member of the potassium channel, voltage-gated, shaker-related subfamily. This member contains six membrane-spanning domains with a shaker-type repeat in the fourth segment. It belongs to the delayed rectifier class, members of which allow nerve cells to efficiently repolarize following an action potential. The coding region of this gene is intronless, and the gene is clustered with genes KCNA3 and KCNA10 on chromosome 1. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the KCNA2 was significantly downregulated in injured dorsal root ganglia following spinal nerve ligation, a change validated by quantitative real-time PCR [Wu et al. DOI:10.1177/1744806916629048]. In rats, the KCNA2 was identified as commonly upregulated in the prefrontal cortex of the SHR/NCrl strain, an animal model of hyperactivity, compared to control strains [Dela Pena et al. DOI:10.1111/Gbb.12388].