Basic Information

Symbol
ANO2
RNA class
mRNA
Alias
Anoctamin 2 C12orf3 TMEM16B Transmembrane Protein 16B (Eight Membrane-Spanning Domains) Anoctamin 2, Calcium Activated Chloride Channel Transmembrane Protein 16B Anoctamin-2 Chromosome 12 Open Reading Frame 3
Location (GRCh38)
12:5531869-5946232
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001364791.2
Sequence length
3683.0 nt
GC content
0.5148

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1221.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1292.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1301.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((.(((((...))))))))..((((((((..((((((((((....(((((.((((.((((...((((..((((..((((((.((.(((((((.(((((((((((.((((((...(((((((..(((.........(((((....)))))......))).)))))))))))))...))))).)))))(((((..((((..((((.((((....((((((((.......)).))))))(((((((((....(((((((.(((...(((...((((((((((..((.(((......))).)).)))).(((((((.(((((.((..(((((.(((.(((........((((..........((..(((.((((((((((((.((((((((((((((((((((.....(((....)))......((((((..(((((.(((((((((...((((((((((((.(.((((((((.......)))))))))))))).....((((((..(((((.((((..(..((((((((((.....((((((((((((...(((((((..((....(((.((((((....(((.........((((((.((((.(((..(((....)))..))))))).)))))))))...)))))).))).)).)))))))..)))...........(((.(((...((((.(((((..(((((((.(.((...((((((.(((((((..((((((((.((....))......((((((((((((((((..((.............((.(((.((.(((........))))).))).)).((((.........))))....(((...((((((((((..(((((.((((((..((..(((((.(...........).)))))))))))((((.(((((......((((.((..........)).))))..............((((........))))........((((((....((((((((((((.(((((((((((.(((....))).))).)))....((((.((..((((((....)))))).))))))...))))).))))..(((((....)))))..........))))))))..)))))))))))))))....((((((((((((....................))))))).)))))........)).)).)))...))))))))))....)))(((..((.(.(((.((((...(((...)))..))))))).).))..)))........)).))))).)).)))))).)))))))))))))))))).)))))).((....)))).).)))).)))..))))).......(((((..(((((((((.(((((((((.((.(((.(((.......))))))...)).))))))).(((((((((((.((((((.(.((.....))).)))))).((((........))))...(((.(((((.....................)))))..)))..)))..)))))).))..((((.....)))).....((((......)))).)).)))))))))..))))).....((((((((..(((....))))))))))))))).))).))).))))))))).........(((((((((((..........)))...)))))))).)))).))))))..)..))))....))))).)))))).....(((((((((((....(((((((((((..(((((.((....)).))))).....(((....))).....))).))))))))........)))).))))))).....)))).)))....))))))))).........((((((((..((((((.((.(((...)))..)).))))).)..))))))))...))))).))))))..........))))))........)))))))))).)))))))).(((((.......(((((((((((.((((((..((.((((.(((((((.((((((((((((((((((((((...((((.(((..((((((((....)))))))))))))))....))))............))))))...))))))..((((...((((...))))...)))).................))))))..))..)))))..)))).))......(((.(((.((((........)))).)))))))))))).....(((.....))).)))))))))))........)))))........)).))))))...)))..))...........)))).....))).))).)))))....))))))).)))))))))))))..))).))))).))))))))))))))....)))))))).))))..)))))..((((......))))(((((((..(((((...((((((.(((((((((((.(((((.((((.((....))..)))))))((((..((...........))...)))).(((((((((.....((((.......))))......((((.(((.........((((((((.........((((....))))))))))))))).)))).(((((((((...........((.((((((.....((.(((((..((....))..)))))))..)))))))).........))))))))).....)))))))))....((((..(((..(((((.....((((..((((.(((((..((.((.((((((....))))))..)).)).))))).))))...))))......)))))....)))..))))......)).)).)))))))....)).))))))(((((.....)))))...)))))..)))))))......).)))))))..)).))))))..))))..))))))))..)).))..)))))..))).(((((((.......(((....))).)))))))...))))))).((((((((((...(((((....))))).((((......)))).((((((((.((((((.((............((((((......)))))).............)).)))))).))).))))).))))))))))..((((.((.(((((.((((((((........((((((((((((.(((.....(((((((((..................))))).))))......))).))))...))))))))..))))))))))))))).)))).....(((((..(((....)))(((((((......))))))).((((((((...((.(........).))...)))))))).)))))((((((((.((.((((..((.......))(((((.(((((((..((((.(((....).)).))))...)).)))))..(((((.((((............)))).)))))((((((..((...(((((....((.......))......))))).))..)))))))))))...)))).)).))))))))(((((((....)))))))(.(((((....((((.......)))).))))))...))))))))..((((.(((((((....................)))))))..))))................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((,(((((((((,(((({(,.,,.|||||||{{,|,,,,,.}}}}},,.}}}})))))))))......((({(((,({{((((((,({.(((((((.|((({{{{{{|.{|((((...(((((((..(((..,.....{(((((....})))|,..,..))).)))))))||||||,,,|}}}|,|||||((({(..{(((..{{{{,||||.,},||||((((.......))))|||||{{(((((({,,,,{{{({{{.{{{.,,||,,|.{|||||||||..||,||,|||,,,,,,.||||}||,(((((((,{((((.((..((((({(({{{,....,...,||||}..{,,,.{{(,,,,,,|||||||(,((((((((,{((({{{{{((((((,....}|||},..|||{{{...,{||||}}((((,.{{{||||{{.,,|{{||||{{{||,|.((((((((.......))))))))}}}}}|,{{.{((((((,,((,({.((((,,(,.{{{{(({(((,,{,.{((((,((({(,.(((((.,..((((.((((((((..........)))))..))).)))).,)))))...||.|}},}|||((((({(((((((.....}||.,.,{({(({..{,,|...|||||,.,}},,,...,,.....,.||,..,{{||.|{{,||.||}|...,,.,,,,.((((((.(((((((..((((((((.((....))......((((((((((((((((...,.............,,.(((,((.({{........))))).})},||,,.{{|.,,.{{{.((((....((((((((((((((((..(((((.((((((..((..(((((.{......,,...)}))),,))))))((((.(((((......,(({((({,....,{{,|,,||,}........,}}.,,|||{.....,,,))}).,,,,,..((((((....((((((((((((.{((((((,,,(.(((....))),))),)),..,,((((.(,{{((((((....))))),.)),}}..,}))))).)))).,(((({....}))))}.........))))))))..)))))))))))))))....((((((((((((......,,.....,,.....)))))))}}))))........)).)).)))...))))))))))....{{.,....},,|.(((.((((...(({...}))..))))))))))))))))).))),,..}}.))))).)).))))))},))))))))))))))))).)))))).)))}})}}})))))},,.,...}))))).},|||||(||||||,((((({{,(((((((((.({.{{,,,(({{.{.....),))}}.)),))))))}.|||||||||||.{{{{{||},||,..,,}|||},,,,}}||,{,,......||||{{{||{{,||{{|,..,|,.,.{{{....||,..,|||..,||{.|||,.,,,,}}}))},|(({,...,||},..},.{{{{....,,|}|}|||.|||||||||{,}|}||.....(((((((({{(,....}))}))))))))..,{{{|,...,.|}}}}))))....{,,{.,((((((,((({{........}}}..,||||||}|,||||.}}}},,..}..}}|}.,,.)),}),)}}})).....||||{{{||||,,,}||||,||||||..||||{.((....)).)))})},}}},||,,,,,))}}},}))}}))})))}|,{{{{...||||{|||||||....)))}),)||,,{.}}}}||||}.......|}||{{{{||,,|,{{||}||,{||,..)),.,)).)))}}.),.))})))))}..})))),})))|||||.......))))}}........))))))))}},))))))))||||||||{{{{,|{{{|||...,,{{{|,,...||||}}}||||}||||||||||({{,{({,{({((((.,.((((.(((..((((((((....})))))))})})))}....}}}||,....,,,||.|},||},{{||,|||||((((...(((,...})))...))))....{|||{{{{{{{{{{{(({,,.|{{{.{{{{{..,..........,,|}}|||}||((..{{.{{.||.|,|||||},.||,{{{.{.{({,,,.,|}}||,}},{{|}}..,,}.}}.)))))))))))))}}}}.,||||||||.||||}|},,}},||.|||}|||||}}}||||,|||||..,.,,}}}}}.}}}}}}}}|||}|.||||.|}}|}}}})}}}}})))))}.,..|||||||}.}||}..}}}}}...,,,..|,,.}}}}|||||{{..{|{{|,,,|{{{{{,|||||||||,||{,|||,||{,,||,...}},.}})}},,,|{(,,{,.{{,.,,,...{|,,{||||,{((((((((,,,,.{{{{.,..,,}))}}.,,...((((.(((,........{((((((({{.,,,.,....,...,.)))))))))))))).)))).(((((((((.,{..,.....((.((((((,..,.((.(((((..((....))..)))))}}.,}))))}}}|||,,,,,.))))))))).....})))))))).,..,{{{|,{{{,,{|{{(|,,,,{{{{..{{((,(({{{..({,((.((((({..,.}))})),.}}.)).)}|||.}}}}...)})),,,,,,)))))||||||}..,,}}|,,.,.,,}}},,||||||....}},,,}|||{(({{.....))))}},,}}}))}}))},)))}}}},,),)))))))..}).))))))}))),))}))))}},},,|,.}|||{,((|,.,}}.||||,(({{,,,,,(((,...}}}.|||||||{{{,|{{||,.||||{||||||}}|((({....))))),|{{{.....,)))}.{{{|||||,|||{{(,((,.,....,,,{,((((((......)))))).............)),)))))).))),)))))}))})))}))}..||{||||,|,||||||||||((,,,...,.((((((((((((.(((.{{..(((((((((.{...........,..,.))))).))))....}}))).))))...)))))))),}))}}}))))))))))}}|||{{...{||||,,(((....)))(((((((......))))))).{{{{{||{..,,|,{,|,.....},)),.,)))))))),)})))}|{,,,,{.,|,||||..,|||,|,.,}.|||{(|{{{{{|{..,{||,|||.||,}.,}.)}}},,.}}.||}}|..{((((.((((.........,..)))).))))}((((({,,(,,,.(((((...,({.......}}......))))),},}}))))))))))),}}))),.},.)))))),.(((((((....))))))){.(((((....((((.......)))).)))))}...}})),},},,|||||{{,,,{|,,..{{{{{..,,,,.....,},}},,..,)))}}.,.}})),,.....

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001278596.3 NCBI
AGAAGCGCGCGGCCGCGGGCCGGCGGGGUCUGCGUCCACAUCAUGGCGA… 3698 nt 0.5154
NM_001278597.3 NCBI
CCAGGCUCCUUCUCUAUAAAGUGGGAUCUAUCAUGACCAGCCUACCUUA… 3716 nt 0.5086
NM_001364791.2 NCBI
AGAAGCGCGCGGCCGCGGGCCGGCGGGGUCUGCGUCCACAUCAUGGCGA… 3683 nt 0.5148
Summary

ANO2 belongs to a family of calcium-activated chloride channels (CaCCs) (reviewed by Hartzell et al., 2009 [PubMed 19015192]).[supplied by OMIM, Jan 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.