Basic Information

Symbol
KCNB1
RNA class
mRNA
Alias
Potassium Voltage-Gated Channel Subfamily B Member 1 Kv2.1 Potassium Voltage-Gated Channel, Shab-Related Subfamily, Member 1 Voltage-Gated Potassium Channel Subunit Kv2.1 Delayed Rectifier Potassium Channel 1 DRK1 H-DRK1 DEE26
Location (GRCh38)
20:49293394-49484297
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004975.4
Sequence length
11871.0 nt
GC content
0.4797

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3829.78 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4051.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3512.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004975.4 NCBI
GCUUUCGCUUUCUGCCUCGCAGCCGUCGGGAUGGAGGUGAGAAGACGGC… 11871 nt 0.4797
Summary

Voltage-gated potassium (Kv) channels represent the most complex class of voltage-gated ion channels from both functional and structural standpoints. Their diverse functions include regulating neurotransmitter release, heart rate, insulin secretion, neuronal excitability, epithelial electrolyte transport, smooth muscle contraction, and cell volume. Four sequence-related potassium channel genes - shaker, shaw, shab, and shal - have been identified in Drosophila, and each has been shown to have human homolog(s). This gene encodes a member of the potassium channel, voltage-gated, shab-related subfamily. This member is a delayed rectifier potassium channel and its activity is modulated by some other family members. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in zebrafish demonstrated that the KCNB1 transcript, a potassium voltage-gated channel member, increased in abundance within 0.3 hours postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].