Basic Information

Symbol
KCND3
RNA class
mRNA
Alias
Potassium Voltage-Gated Channel Subfamily D Member 3 KSHIVB Kv4.3 Potassium Voltage-Gated Channel, Shal-Related Subfamily, Member 3 Voltage-Gated Potassium Channel Subunit Kv4.3 A-Type Voltage-Gated Potassium Channel KCND3 SCA19 SCA22 Potassium Channel, Voltage Gated Shal Related Subfamily D, Member 3 Potassium Voltage-Gated Channel Long Sha1-Related Potassium Channel Kv4.3 Potassium Ionic Channel Kv4.3 Spinocerebellar Ataxia 22 Spinocerebellar Ataxia 19 Voltage-Gated K+ Channel BRGDA9 KCND3L KCND3S
Location (GRCh38)
1:111770662-111989668
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Sudden unexpected death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001378969.1
Sequence length
7619.0 nt
GC content
0.4814

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2465.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2605.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1823.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001378969.1 NCBI
AGCGAGCGAGACUGCGCUGGCGAGGAGGAGCCGCGCGAGCGGCGGCUGC… 7619 nt 0.4814
NM_001378970.1 NCBI
AGCGAGCGAGACUGCGCUGGCGAGGAGGAGCCGCGCGAGCGGCGGCUGC… 7562 nt 0.4814
NM_004980.5 NCBI
GCUCUUGGUGAGGGGACAAGGAGAGAAAUGGCUGAAAGUGGAAACCCGG… 7882 nt 0.4796
NM_172198.3 NCBI
GCUCUUGGUGAGGGGACAAGGAGAGAAAUGGCUGAAAGUGGAAACCCGG… 7825 nt 0.4795
Summary

Voltage-gated potassium (Kv) channels represent the most complex class of voltage-gated ion channels from both functional and structural standpoints. Their diverse functions include regulating neurotransmitter release, heart rate, insulin secretion, neuronal excitability, epithelial electrolyte transport, smooth muscle contraction, and cell volume. Four sequence-related potassium channel genes - shaker, shaw, shab, and shal - have been identified in Drosophila, and each has been shown to have human homolog(s). This gene encodes a member of the potassium channel, voltage-gated, shal-related subfamily, members of which form voltage-activated A-type potassium ion channels and are prominent in the repolarization phase of the action potential. This member includes two isoforms with different sizes, which are encoded by alternatively spliced transcript variants of this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the KCND3 gene as associated with cardiac arrhythmias and sudden unexpected death [Subbotina et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2018.10.006]. In mice, RNA sequencing analysis of a heart-specific double knockout model recapitulating myotonic dystrophy identified the KCND3 as a potassium channel gene, where it was noted as a top mis-spliced event in another model but was not found in the complete alternative splicing list from this specific study [Lee et al. DOI:10.1093/hmg/ddac108].