Basic Information

Symbol
ANOS1
RNA class
mRNA
Alias
Anosmin 1 Anosmin-1 KALIG-1 WFDC19 ADMLX KAL1 KAL WAP Four-Disulfide Core Domain 19 Kallmann Syndrome Interval Gene 1 Adhesion Molecule-Like X-Linked Kallmann Syndrome Protein Kallmann Syndrome-1 Sequence (Anosmin-1) Adhesion Molecule-Like, X-Linked Kallmann Syndrome 1 Sequence KALIG1 HH1 HHA KMS
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_000216.4
Sequence length
6265.0 nt
GC content
0.3974

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1698.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1821.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1686.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(.(((((((..(((((((.((((.((((.(((((.(((((.((((((((((.(.(..((.(((((((.((((((((((((...((...((...))..))...))))...)))))))).))))))).)).).).))))).)))))))))).((((((((((.(((((.(((((((((((....)).))))))))).))))).)))))).).))))))))))))...))).).)))).)))..))))))))((((..((((((((((((((((....)).)))((((((((((((((((((...(((((((....(((((((((((((..(((.((..((.((.(((.(......).))).))))...)))))..)))))))))))))(((((((....((((....((((.(((((.(((...(((((.....))))))))))))).)))).....))))....))))))).......(((..((((((.(((.(((((.(((((((((((((((...(((((((((.....(((((.....((((..((((....))))..))))..(((((.((((((((.......(((...((((((((((((((((...((((((((.......))).)).)))...)))))).........(((((....((((.(........)))))....)))))...(((((.(((..(((((.((((((..(((((((....)))))))...((.((((.(((...........((((((.........))))))...))).)))).))((((((((((((......((((......))))......(..((((.....))))..).......(((.....)))..)))))...)))))))..(((((......)))))...))))))..)))))))).)))))..))))..))))))...))).......)).))))))..))))))))))....))).))))))...)))..........((((((((........))))))))......((((.....))))))))))))))))))))).))).))))))..)))..))))))))))))).((.(((.((.....)).))).))......)))))..)))))))..((.((((((((.(..((((((((((((....((((((...))))))((((........((((((((((.........))))))))))))))((((((((((((((((((((((((...(((((...............))))).)))).((((((..........(((((((............((((((............((((..((((..((.((.(((.....)))..)))).))))..))))...........(((...(((.((((...))))...)))..)))(((((((((((..........((((....))))((((((..((((((.((((((..((.((...............))))..)))).)).))))))..)))))).....((((((.(((....(((...)))..))).))))))((((........(((((((......((.....))......))))))).....))))...))))))))))).....))))))..(((((.((((...)))).)))))))))))).))))))..((((.(((((((((((....((((((....((((.........))))))))))...))))))))...((((.(((((((.((((.(......).))))...))))))).))))))).))))....)))).))))))....((((((((((..((((...((((.(((((((((((((...((((((((....((((.((((((((.((((((...((((((((((((((((((...(.((((...((((.....(.(((...((((((....((((((.....((..(((((((((...(((((((.....((((((..(((((((((..((.............))..))))..)))))..)))))))))))))..((((...))))...((((.(((.......(((..((((((..(((......)))(((.(((((........)).))).)))...((((((....)))))))))))))))...(((....)))))))))).))))))))).)).)))))).....))))))))).)))))........)))))...)).)))))).(((((((.((((......(((.(((((((((((((((((((((((((.((((((((........)))))))).((.........)).((((((((((....(((.(.....).)))...))))))))))((((.((((((.......((((.(((.....))).)))).((((......)))).(((((....)))))((((..........)))).(((.....)))..............)))))).)))).((((((((((((((((((((((...((........((((((..........))))))...((((((((((..(((((((....(((((...((((.(((.......))).)))).)))))..)))))))..))))))))))..........((((..((((....))))..)))).........(((((...)))))((.......))....((((((((.((((.........)))).))))))))...((.((((.((((.((((((((.((.((.....(((((((....(((((((......(((((((((...)))))))))(((((((........((((((..........(((((.((.......((((........)))).......)).)))))...........))))))...((.......)).((((.(..((((((((((((.......((((..(((.(.(((((.((.......((((((....(((((((.((((((((.(((((((((((..((((((((.....))))))))(((((((((..(((.....(((((((((((((((......((((((..(....)..)))))).........((((.............))))(((((((...((((.....)))).)))))))....((((((((((((.........))))))))))))........)))))..)))))))))).....(((((((((....)))))))))..)))..))))))))).(((((((((.(((.(((((((((.(((...((((...((((((..((((......((((.(((..((((((((((((.......((((.(((.((((((((((((((....)))))))))))))).))).)))).......)))))..)))))))..))).))))(((((((((.((.(((....(((((....)))))...(((((((...)))))))...))).)))))).....))))).....(((..........)))))))..))).)))))))))))))))))))...)))..)))))))))..(((((((((.((((((((((.................((((((((((.(((((....((((.((((.((..........)).)))).))))...))))).))))))))))((((((((((..(((((.(((..((((((((((.......)))))).....))))..))).((((.....)))).((......)).(((((((....)))))))..(((((....(((((((......)))))))...))))))))))..))))))))))............)))))))))).....((((((((..(((.(((.....))).)))..))))))))....((((.((((((((((..((..(((((.....................(((((...(((((((.((........)).)))))))...)))))))))))))))))...((((((((((((((((((......))))))(((((.........(((((....((((((.....))))))))))).......))))).......))))))..)))))).......))))))))).(((((((.............((((((....)))))).....(((((...)))))..(((((((.........)))))))........)))))))......))))))))).........((((((((........))))))))((((((..((((((.(((((...)))))))))))))))))))))))))))).)))).....(((..((((((((........))))))))..))).....)))).))))))).....)).)))).......)))))))))))..))))...))))))))))))..).))))....)))))))......)))))))..)))))))........(((((((...((((((.((((((..........)))))).)))))))))))))......(((.......)))..........)))).))))))))((((..(.((((.((((....((.((((((....((.(((..((((..(((.(((((...))))).)))..))))..))).)).......)))))).))....)))).)))).)..)))))))).)))).))...))...)))))))))))))))..)))))))..((((((......))))))........(((((....))))))))))))...........)))))........))))).)).....)))))))))....))))(((((((((((.......(((((((.......................)))))))...((((((((...(((.(((((((((((((((....)))..(((((((....(((..........)))........)))))))..((((.......)))).))))))).))))).))).....))))))))....))))))))))).......)))))))...........(((((.((((((.((((.....))))..)))))).....)))))...((((((......)))))).............))))))))))))))))...)))))).))))))))))).)))...))))))...(((..(((((........(((((...(((((((((((.........((((.((((..((((((........))))))...................)))).)))))))))..)))))).)))))....)))))..))))))))))..........)))).))))..)))))))))).(((((((..(((..(((((.........))))).))).))))))).....((((.........))))......))))).....))))).........(((......)))))))))))))))..).))))))))))(((((((..((((.......))))..)).)))))........((((((.(((.(((((.((((......(((((.......(((((..(((((((((..((((((.((((....)))).)).....))))..)))))))))..))))).......)))))))))))))))))))))))...(((((((((..((((....(((......)))....)))).)))))))))...........((.(((.((((((......))).))).))).))))).))))))))))))(((((..(((.((((((...((((((..(((.((((((.(((((((....))))))))))))).)))..))))))...(((((.((((((((((..((...............(((((((((((((((((...((((.(((..((......)).)))..)))).....(((.((((...)).)).)))..((((((....(((.(((((.......))))).)))....))))))..))).)))))).))))))))..)).)))))))))).)))))....((((((....))))))..............)))))).))).)))))..(((((...............)))))........((((((.((..(((...)))..)).)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{.(((((((..(((((((.((((.((((.(((((.(((((.((((((((((.(..,,((.(((((((.(((((((({(((,..((...{,...,}..))...))}),..)))))))).))))))).)).),},)))))},))))))))).((((((((((.(((((.(((((((((((....)).))))))))).))))).)))))).).)))))))))))).,,))).).)))).)))..)))))))|((((..(((((((((((((({(,...|},))}((((((((((((((((((...(((((((....(((((((((((((..(((,{(..((.((.(((.{......,.))).))))..,,})))..)))))))))))))(((((((.(,,((((....((((.(((((,{({,((((((....,}))))))))))))).)))).....)))),}..))))))).......(((,.((((((.(((.(((((.(((((((((((((((...(((((((((.,{,,((({{.,...{{{{..{|||,,,,)}}},,}}}}|.(((((.((((((({,{,....(({...((((((((((((((((...((((((((.,.....})).)).))}..,)))))).......,.(((((....((((.(........)))))....))))).,.(((((.(((..(((((.((((((..{((((({...,}}||}}|,.,((.{(({.{(({{,........((((((.{{...,}.)))))).,.|||.,}}}.,}((((((((((({....|||||{......)))),,.,..||.,||||,,,,},||,.,....,..,{{,,,..})}..}))))...))}))))}}{|||{...,,,)}))),..))))))..)))))))).)))))..})))..))))))...)))...,...)),))))))..))))))))))..,,)))}})))))...)))....,,,,,,((((((((........))))))))......{(((.....)))}))))))))))))))))).))).)))))),.)))..))))))))))))},((.(((.((.....)).))).}),,....})))),,)))))))..{{.((((((((.(..((((((((((((....((((((...)))))){(((........((((((((((.........))))))))))}}|}((((((((((((,{{..{((((,,.{(({{..}}},)}}}},,,.....{{{{.((,.................}|,}}}}.......(((((((,((.............}},))))))).{(({((,,{((({...{{{.{{{{{{{{{..|{.,..}}}}})}.{(((((.{((({,(((((,{,....((({.(((......,,|||.}}}}.....{(((....)))}..,,,})))))))),)))))}.))).}|}{((((((((({.,.,,,|,,|,||.{{{{||{||..{{{{({...{{((((,(,(((,.,,{{,...,},,,|}|,||||||((((..,,,...(((({((,,,...((,,,..}|,.....}}}}})}....,))}}..{({{|||||||{{{{.{{{{{..,,(((((,((((,..,}}},)))))....{(((....))))|(((((((((((((((....((((((....((((.........))))))))))...))))))}}...,,||}}|||||{.((({.,.,,,|,|||||||,.,},||||,||||||,.,|))}..}}}}},,,{(((((,.,,||||||,,.|||||||{{|{{{{||{{{|{|,{{{|,.{{{({{{{,...{{{{.,,,,,,,{,,,,,..{{.{{{{{,,{{{{{||||{||,,|,,{,....(({{.....(.(((...((((((....{(({({,....{{..(((((((((...(((((((.....((((((..(((((((((..((.............))..))))}.}))))..)))))))))))))..((({...})))...((((.(((.......{((..((((((.,{{....|,,,|,.,,....,,,|{{,.,,,..,}}}}}},..{(((((....)))))})))))))))...(((....)))))))))).))))))))).)).))))))....,))))))))).,)))},,,....,))))},,}))}||||||.,...})))|||......}}}})))).}))))...}}||}}}}}||||,{||||||{..,,,,|.))))}}},...}}}..}||,}}||||,||||||}.,.{|,.,.....},)})},.)))))),,))))))}))))))},})},,|(({.{((.....)}}.}}}}.((((......)))).,{(((.,..}}}},,((({(((({{{,,||||,((,.....,,,....,,,.,............,.||.{((({((((((((({{{{{{{{...{{.,,.,||}||||||.}}}.{{{....}}}....((((((((((..(((((((....(((((...((((.(((.......))).)))).)))))..)))))))..))))))))))..........((({..((({....}}}}..})))...,.....,{((((((.{((,.........)))}))|||,,(((.((((,,,{{{....,,,.||,|||,,...}|.,,........}))))}})),..}}}....(((((((....(((((((.....{(((({{{((...|}}})))||(((((,,.....,{{{(,..,,...,,.{|{{(,((,|,...,,}},}}}||.||,|,|||,.,,,,............,,,,,}},|,|}}}}}}.{{..,.,,,}}.((((.(..((((((((((((.......((((..(({,(.((({{{((.......((((((.,..(((((((.((((((((.(((((((((((,(((((((((.....))))))))|((((((((..((({{{{{((,,,,|||||||||,.....{(((((..{....)..)))))}..,,,....{{{{.............}}}}(((((({...((((.....)))).})))))}..{,((((((((((((.........))))))))))))}.....,,}}}}|||||||}|||||{{,..(((((((((....)))))))))..))}..))))))))}.(((((((((.{((.(({((((((((((..,((({,..{(((((..((((...,,,((((,(((..((((((((((((.......((((.(((.((((((((((((((....)))))))))))))).))).)))).......)))}},})))))))..)))..}||{((((((((.((.({{....({((,....,}))).,.(((((((...)))))))...}}}.}}}})),,,..}}))},,,,.{{{....,,,,},)},))))..})).)))))))))))))))))))...}}}..))))))))).,(((((((({.{(((((((({.{{{.,,||,.......,|{{{{((((,({({{...,{{{{.{{{{.{{...,,{,,,,|,.,}}|,|||,,|,||||},|||||||||{{((((({(((,.(({((,,.,||{|||,,||||..}}},},))))),,,}},,)),})}},{{||}}}..,)))}}}},..{{{{{(((((((....}))))))...,,,,..}}|||((({......))))))),,,))}})))))),.))))))}}}},...........}||||||}||.....((((((((..(((.(((.....))).)))..)))))))}...,{|||{||,||((({{,,({,.(((((...,||...,...}}},....||{{{...(((((((.((........)).)))))))..,))))))))))),))))),..(((((((((((({{((((......}}})}},{{,,......,,.{(({,...,((((((.....)))))))}}}}..,....}}}}}.,)}}..))))))..))))))..,,.{{|{|||}}},,((,{{{{,......,..,,.((((((....)))))).,...|||{,..,}}})}...,{{{{,.,,,,,,..,,})))}.....,,,}),)))))))}},))))))))}.........((((((((........))))))))((((((..((((((.(((((...)))))))))))))))))))))))))))).)))}.....(((..((((((((........))))))))..))).....)))).))))))),....)).)))).......)))))))))))..))))..,))))))))))))..).))))....},)))))......)))))))..)))))))..,.|}}}{{(((((,..,(((({.((((((..........)))))).))))))))))))|{,.{(((({.....,(((((..(((((..((((.{.....}.))))..))))).}.))).)})))))).}}}....,,||||,||,.|||||||,.,|||||}}...,,}}}}}}|}||||}.{{{.....}}}.,,,||.{{{{{.||,.....}},))))),})}}|,},}}}|,|},||}|}}}}}}))))})}.,))))}}}..{(((((......))))))......,.||{{{{{{{{,||{|,,||{{{,....}))))).,,))},...,,}}|,...,,.((((((.{((((({{{{{{.(((((((((({.....,,|{{{{,,...........,,,,,,......))))}}}{{.((((((((...(((.(((((((((((((((....)))..(((((((,...(({..........)))........)))))))..((((.......)))).))))))))))))).))).....)))))))).,,.})))))))))).,,.......,{{{,..|{{{{||......)}}||||},|||.....))))))}},))))),.))))))...((((((......)))))).......,},.,})))))))),)))..)),.}))))))))))))))))))))||||{|||,||,,,,,|}||,|||,.......{{(({,,,(((((({((((.....,,,.((((.((((,.((((((........)))))).,,................)))).))))})))}..)))))).)))}}...,|||{|,{{{,.,,,,||||{{{..,,,,,,,.,,,,..})))}}))))}||{||||..|||,.(((((.........))))).))).}||||||,....}}}))}}}},,,,)))},...})))))),....})))).,,......{({......)))))))))))))))..).}))))))}}},{{{{{{,,{{{{,,,....}}})..)}.}}})),,,,,...(((({{{(((.(((((.(((((......,(((.......,((((..(((((((((..((((,,.,(({....}})}.,}.....))))..))))))))).,))}}}.....,,)},,)))))))))))))))))))...(((((((((..{(((,.{,({,......}}.,,,,}))),))))))))).,...,,....((.(((.((({((|....,))).))).))).))))).)))))))))))){((({..(((.((((((...((((((..(((.((((((.(((((((....))))))))))))).)))..))))))...(((((.((((((((((...,...............(((((((((((((((((,,.((((.(((..{,......}}.)))..)))).....(((.((({...}).)).)))..,{{{(({{,.(((.(((((.......))))).))},}},)}))))}}),,.)))))).))))))))..,).)))))))))).)))))....((((((....))))))..............)))))).))).}}))},{((({{...,.......},,,)))},...,,...((((((.,{..{{,...}}}..}}.)))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUCGCGGCGUCUGCCUGGUCCUCAGCAGUGCAGCCCCGGCGCGGAGCA… 6265 nt 0.3974
Summary

Mutations in this gene cause the X-linked Kallmann syndrome. The encoded protein is similar in sequence to proteins known to function in neural cell adhesion and axonal migration. In addition, this cell surface protein is N-glycosylated and may have anti-protease activity. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in cynomolgus monkeys demonstrated that chronic exposure to methamphetamine and heroin downregulated hippocampal expression of the ANOS1 gene, while cocaine exposure upregulated it compared to controls, as validated by RT-qPCR [Choi et al. DOI:10.30773/pi.2022.0004].