Basic Information

Symbol
KCNH3
RNA class
mRNA
Alias
Potassium Voltage-Gated Channel Subfamily H Member 3 BEC1 Kv12.2 Elk2 Potassium Voltage-Gated Channel, Subfamily H (Eag-Related), Member 3 Voltage-Gated Inwardly Rectifying Potassium Channel KCNH3 Voltage-Gated Potassium Channel Subunit Kv12.2 Ether-A-Go-Go-Like Potassium Channel 2 Brain-Specific Eag-Like Channel 1 ELK Channel 2 Potassium Channel, Voltage Gated Eag Related Subfamily H, Member 3 Ether-A-Go-Go K(+) Channel Family Member KIAA1282 ELK2
Location (GRCh38)
12:49539028-49558337
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012284.3
Sequence length
4023.0 nt
GC content
0.6527

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1887.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1953.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1074.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001314030.2 NCBI
AGGCUGCAGCUUCUCCCCGACAGACGGAGGGAGCUGCCGAGAGCCGGCG… 4019 nt 0.6529
NM_012284.3 NCBI
AGGCUGCAGCUUCUCCCCGACAGACGGAGGGAGCUGCCGAGAGCCGGCG… 4023 nt 0.6527
Summary

The protein encoded by this gene is a voltage-gated potassium channel alpha subunit predominantly expressed in the forebrain. Studies in mice have found that cognitive function increases when this gene is knocked out. In humans, the encoded protein has been shown to be capable of binding glycoprotein 120 of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) envelope. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

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