Basic Information

Symbol
KCNIP2
RNA class
mRNA
Alias
Potassium Voltage-Gated Channel Interacting Protein 2 KCHIP2 Cardiac Voltage-Gated Potassium Channel Modulatory Subunit A-Type Potassium Channel Modulatory Protein KCNIP2 Potassium Channel-Interacting Protein 2 Kv Channel-Interacting Protein 2 A-Type Potassium Channel Modulatory Protein 2 Kv Channel Interacting Protein 2 KChIP2
Location (GRCh38)
10:101825969-101843965
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_173191.3
Sequence length
2424.0 nt
GC content
0.5590

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-905.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -947.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 791.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014591.5 NCBI
AGCUCCGCUCUGCCUCCGGCUCUGCGCUCACCUGCUGCCUAGUGUUCCC… 2469 nt 0.5597
NM_173191.3 NCBI
AGCUCCGCUCUGCCUCCGGCUCUGCGCUCACCUGCUGCCUAGUGUUCCC… 2424 nt 0.5590
NM_173192.3 NCBI
AGCUCCGCUCUGCCUCCGGCUCUGCGCUCACCUGCUGCCUAGUGUUCCC… 2370 nt 0.5549
NM_173193.3 NCBI
AGCUCCGCUCUGCCUCCGGCUCUGCGCUCACCUGCUGCCUAGUGUUCCC… 2295 nt 0.5529
NM_173194.3 NCBI
GGAGCUUAGACGCCGAGCUCGCCGCCAAACCAUGAACCGAUGCCCCCGC… 2088 nt 0.5350
NM_173195.3 NCBI
AGCUCCGCUCUGCCUCCGGCUCUGCGCUCACCUGCUGCCUAGUGUUCCC… 2274 nt 0.5519
NM_173197.3 NCBI
AGCUCCGCUCUGCCUCCGGCUCUGCGCUCACCUGCUGCCUAGUGUUCCC… 787 nt 0.5934
Summary

This gene encodes a member of the family of voltage-gated potassium (Kv) channel-interacting proteins (KCNIPs), which belongs to the recoverin branch of the EF-hand superfamily. Members of the KCNIP family are small calcium binding proteins. They all have EF-hand-like domains, and differ from each other in the N-terminus. They are integral subunit components of native Kv4 channel complexes. They may regulate A-type currents, and hence neuronal excitability, in response to changes in intracellular calcium. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been identified from this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the KCNIP2 was identified in a complete alternative splicing list from a heart-specific double knockout model, which recapitulated myotonic dystrophy cardiac pathogenesis and sudden death, with findings compatible with another mouse model [Lee et al. DOI:10.1093/hmg/ddac108]. A study in rats demonstrated that in a model of acute right heart failure induced by pulmonary artery banding, the KCNIP2 was identified as a protein with more interactive evidence in the right ventricle versus left ventricle protein-protein interaction network [Cao et al. DOI:10.1177/2045894019879396].