Basic Information

Symbol
KCNJ15
RNA class
mRNA
Alias
Potassium Inwardly Rectifying Channel Subfamily J Member 15 Kir4.2 Kir1.3 IRKK Potassium Channel, Inwardly Rectifying Subfamily J Member 15 ATP-Sensitive Inward Rectifier Potassium Channel 15 Inward Rectifier K(+) Channel Kir1.3 Inward Rectifier K(+) Channel Kir4.2 Potassium Inwardly-Rectifying Channel, Subfamily J, Member 15 Potassium Voltage-Gated Channel Subfamily J Member 15 Inward Rectifier K+ Channel KIR4.2 KCNJ14
Location (GRCh38)
21:38155549-38307357
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_170736.3
Sequence length
8407.0 nt
GC content
0.3990

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2394.94 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2561.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2282.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001276435.2 NCBI
AGGUGUUUGGAGAGCCCGGACUGGAUGCCCACUAGAAUCCUGUGCUGUG… 8538 nt 0.4022
NM_001276436.2 NCBI
AGGUGUUUGGAGAGCCCGGACUGGAUGCCCACUAGAAUCCUGUGCUGUG… 8541 nt 0.4005
NM_001276437.2 NCBI
AUACAUUCAGCAGCUGAUGGGCAUUUGGGUUGCAUCCACUUUUUGGCUG… 8392 nt 0.3992
NM_001276438.2 NCBI
AUACAUUCAGCAGCUGAUGGGCAUUUGGGUUGCAUCCACUUUUUGGCUG… 8310 nt 0.3982
NM_001276439.2 NCBI
AUACAUUCAGCAGCUGAUGGGCAUUUGGGUUGCAUCCACUUUUUGGCUG… 8450 nt 0.3992
NM_002243.5 NCBI
AGGUGUUUGGAGAGCCCGGACUGGAUGCCCACUAGAAUCCUGUGCUGUG… 8399 nt 0.4000
NM_170736.3 NCBI
AGUUCCUCCAGGUAAUUCUUACUCAAACUUGUACCAACUUGUUUUUGAC… 8407 nt 0.3990
NM_170737.3 NCBI
AGAUCUCUGGGAUCUUCAGCUGAGAUUGGGCCCCAGCACCUGGACUCAA… 8262 nt 0.3991
Summary

Potassium channels are present in most mammalian cells, where they participate in a wide range of physiologic responses. The protein encoded by this gene is an integral membrane protein and inward-rectifier type potassium channel. The encoded protein has a greater tendency to allow potassium to flow into a cell rather than out of a cell. Eight transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2013]

Forensic Context

A study in human traumatic brain injury (TBI) patients identified the KCNJ15 as a top five upregulated mRNA with a log2(fold change) of 8.25194 in brain contusion tissues compared to adjacent tissues, indicating its potential role in TBI pathology [Zhang et al. DOI:10.097/WNR.0000000000001756].