Basic Information
Symbol
KCNJ4
RNA class
mRNA
Alias
Potassium Inwardly Rectifying Channel Subfamily J Member 4
HIRK2
HRK1
IRK3
HIR
Kir2.3
Inward Rectifier Potassium Channel 4
Inward Rectifier K(+) Channel Kir2.3
IRK-3
Potassium Inwardly-Rectifying Channel, Subfamily J, Member 4
Potassium Channel, Inwardly Rectifying Subfamily J, Member 4
Potassium Channel, Inwardly Rectifying Subfamily J Member 4
Potassium Voltage-Gated Channel Subfamily J Member 4
Hippocampal Inward Rectifier Potassium Channel
Hippocampal Inward Rectifier
Location (GRCh38)
22:38426327-38455639
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
MANE select
Transcript ID
NM_152868.3
Sequence length
2065.0 nt
GC content
0.6552
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-956.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-992.36 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
644.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GAGAAUUUCAACCAGAAAGAACAGCCAGUGCAAAGGCCCAGAGACAGGA… | 1903 nt | 0.6311 | |
| GGGAGCGGCGCGGGACGGCCGGGACGCGCGGAGACCCCAAGACCCACGC… | 2065 nt | 0.6552 |
Summary
Several different potassium channels are known to be involved with electrical signaling in the nervous system. One class is activated by depolarization whereas a second class is not. The latter are referred to as inwardly rectifying K+ channels, and they have a greater tendency to allow potassium to flow into the cell rather than out of it. This asymmetry in potassium ion conductance plays a key role in the excitability of muscle cells and neurons. The protein encoded by this gene is an integral membrane protein and member of the inward rectifier potassium channel family. The encoded protein has a small unitary conductance compared to other members of this protein family. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that the KCNJ4 was significantly downregulated (0.10-fold) in injured dorsal root ganglia following spinal nerve ligation, as identified through whole transcriptome RNA sequencing and validated by quantitative real-time PCR [Wu et al. DOI:10.1177/1744806916629048].