Basic Information

Symbol
ABCG2
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily G Member 2 (JR Blood Group) BCRP ABCP MXR EST157481 CD338 ATP-Binding Cassette, Sub-Family G (WHITE), Member 2 (Junior Blood Group) Broad Substrate Specificity ATP-Binding Cassette Transporter ABCG2 ATP Binding Cassette Subfamily G Member 2 (Junior Blood Group) Placenta-Specific ATP-Binding Cassette Transporter Mitoxantrone Resistance-Associated Protein Breast Cancer Resistance Protein Urate Exporter CDw338 BCRP1 Broad Substrate Specificity ATP-Binding Cassette Transporter ABCG2 Isoform 1 (Junior Blood Group) Multi Drug Resistance Efflux Transport ATP-Binding Cassette Sub-Family G (WHITE) Member 2 ATP-Binding Cassette, Sub-Family G (WHITE), Member 2 ATP-Binding Cassette Sub-Family G Member 2 ATPbinding Cassette Transporter ABCG2 ATP-Binding Cassette Transporter G2 Placenta Specific MDR Protein ABC Transporter CD338 Antigen EC 7.6.2.2 CDw388 UAQTL1 ABC15 GOUT1 MXR-1 BMDP MXR1 MRX
Location (GRCh38)
4:88090150-88231818
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004827.3
Sequence length
4206.0 nt
GC content
0.3918

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1082.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1169.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1145.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001257386.2 NCBI
UUACAUCAGGGUUAAAAAAGCACAGGAAGUUUACGCACAGAGCAAAGCC… 4580 nt 0.3930
NM_001348985.1 NCBI
UUACAUCAGGGUUAAAAAAGCACAGGAAGUUUACGCACAGAGCAAAGCC… 4728 nt 0.3945
NM_001348986.1 NCBI
GUCAGCGCUGCCUGAGCUCGUCCCCUGGAUGUCCGGGUCUCCCCAGGCG… 4240 nt 0.4066
NM_001348987.1 NCBI
GUCAGCGCUGCCUGAGCUCGUCCCCUGGAUGUCCGGGUCUCCCCAGGCG… 4425 nt 0.4095
NM_001348988.1 NCBI
GUCAGCGCUGCCUGAGCUCGUCCCCUGGAUGUCCGGGUCUCCCCAGGCG… 4625 nt 0.4158
NM_001348989.2 NCBI
GUGACUGGGCAACCUGUGCGUCAGCGUCCCCGGUGCUUCGGCGCUCCGG… 4038 nt 0.3898
NM_004827.3 NCBI
AGUGCCCGCCACUCCCACUGAGAUUGAGAGACGCGGCAAGGAGGCAGCC… 4206 nt 0.3918
Summary

The membrane-associated protein encoded by this gene is included in the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the White subfamily. Alternatively referred to as a breast cancer resistance protein, this protein functions as a xenobiotic transporter which may play a major role in multi-drug resistance. It likely serves as a cellular defense mechanism in response to mitoxantrone and anthracycline exposure. Significant expression of this protein has been observed in the placenta, which may suggest a potential role for this molecule in placenta tissue. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2012] CIViC Summary for ABCG2 Gene

Forensic Context

A review of RNA-Seq studies in post-mortem human brains identified the ABCG2 as a gene with altered expression in the dorsolateral prefrontal cortex of subjects with bipolar disorder, where it is implicated in processes of neuroplasticity [Wu et al. DOI:10.1111/Pcn.12550].