Basic Information

Symbol
KCNK6
RNA class
mRNA
Alias
Potassium Two Pore Domain Channel Subfamily K Member 6 K2p6.1 TWIK-2 Potassium Channel, Two Pore Domain Subfamily K, Member 6 Inward Rectifying Potassium Channel Protein TWIK-2 Potassium Channel Subfamily K Member 6 TWIK-Originated Similarity Sequence TWIK2 TOSS TWIK-Originated Sodium Similarity Sequence Potassium Channel, Subfamily K, Member 6 K2P6.1 Potassium Channel KCNK8
Location (GRCh38)
19:38319845-38332076
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004823.3
Sequence length
5721.0 nt
GC content
0.5392

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2262.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2353.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1249.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004823.3 NCBI
GCCGCGCCUGUAGCACUCCCGGAACUGGAACUAGGUGCCAGACGGUCCG… 5721 nt 0.5392
Summary

This gene encodes one of the members of the superfamily of potassium channel proteins containing two pore-forming P domains. This channel protein, considered an open rectifier, is widely expressed. It is stimulated by arachidonic acid, and inhibited by internal acidification and volatile anaesthetics. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that spinal nerve ligation induced significant whole-transcriptome changes in injured dorsal root ganglia, with the potassium channel gene Kcnk6 being upregulated 3.84-fold six days post-injury, as identified by strand-specific RNA sequencing and validated through quantitative real-time PCR [Wu et al. DOI:10.1177/1744806916629048].