Basic Information

Symbol
ANXA11
RNA class
mRNA
Alias
Annexin A11 Annexin XI ANX11 Calcyclin-Associated Annexin 50 56 KDa Autoantigen Annexin-11 CAP-50 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein IBMWMA ALS23 CAP50
Location (GRCh38)
10:80150889-80205583
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_145868.2
Sequence length
6734.0 nt
GC content
0.5247

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2458.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2581.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1510.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001157.3 NCBI
GGAGUUUUCCGCCCGGCGCUGACGGCUGCUGCGCCCGCGGCUCCCCAGU… 6685 nt 0.5249
NM_001278407.2 NCBI
ACUAACCGACGCACACGGGGCUGGAGAGGACUUAGGAAAUGCCCACCCC… 6830 nt 0.5261
NM_001278408.2 NCBI
CUCUGUUCUCUGCGCUGGGCAUGGAGUGGAGCUGUGAGGCCGAGCCCCU… 7307 nt 0.5162
NM_001278409.2 NCBI
GGAGUUUUCCGCCCGGCGCUGACGGCUGCUGCGCCCGCGGCUCCCCAGU… 7003 nt 0.5263
NM_145868.2 NCBI
GGAGUUUUCCGCCCGGCGCUGACGGCUGCUGCGCCCGCGGCUCCCCAGU… 6734 nt 0.5247
NM_145869.2 NCBI
GGAGUUUUCCGCCCGGCGCUGACGGCUGCUGCGCCCGCGGCUCCCCAGU… 6930 nt 0.5218
Summary

This gene encodes a member of the annexin family, a group of calcium-dependent phospholipid-binding proteins. Annexins have unique N-terminal domains and conserved C-terminal domains, which contain calcium-dependent phospholipid-binding sites. The encoded protein is a 56-kD antigen recognized by sera from patients with various autoimmune diseases. Several transcript variants encoding two different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Dec 2015]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the ANXA11 is a member of a brain gene co-expression module associated with voluntary alcohol consumption [Saba et al. DOI:10.1111/Gbb.12698]. Concurrently, research in a murine deep vein thrombosis model established that the ANXA11 exhibits a time-dependent expression pattern, with its protein level peaking at 14 days post-thrombosis, supporting its utility as a biomarker for thrombus age estimation in forensic pathology [Huang et al. DOI:10.007/s12024-024-00818-3].