Basic Information

Symbol
KCTD12
RNA class
mRNA
Alias
Potassium Channel Tetramerization Domain Containing 12 PFET1 Predominantly Fetal Expressed T1 Domain KIAA1778 C13orf2 Potassium Channel Tetramerisation Domain Containing 12 BTB/POZ Domain-Containing Protein KCTD12 Chromosome 13 Open Reading Frame 2 Testicular Tissue Protein Li 100 PFETIN Pfetin
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_138444.4
Sequence length
6231.0 nt
GC content
0.4365

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1930.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2051.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1543.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((((((((((((((..(((((((((.((((.((((..(((....)))..).)))..))))..)))).)))))..)).)))))).))))))))(((.(((.(((((((((((((.((..(((((((((.((((((((((((.((.(..(((.(((((..(.(((..((((..((((((((((..(((((((.(((((((.(.(.(.(((((.(.((((((....((((((..(((.(((((...........)))))..))))))))).((((.(((....(((.(((..(((.((((((((((.(((.((((((((.((........)).)))))))).)).).))))))...))))...)))...))).)))..))).))))..(((((((.(((((((.(((((((.((((.(((.(....((((((..(((((..((((.(((((..((....))((((((((.(((((..(((.(((((.....))))))))..))))).)))).))))..((((........))))....)))))))))(((((((.((.((((((((..........)).).))))))))))))))(.((((((.(.((((...(((((.....))))))))).).)))))).))))))..))))))).))))))).))))))).....))))))).)))).))).)))))).).))))).)).).))))))).))))))).....))))))))))))))....))).).)).))).))).).)).))))))))......(.(((.((((.(((((.((((......))))))))).)))).))).)....(((((((........))))))).)))).))))...))))).)).))))).)))))))).))))))......((((((((((..(((((((((.(((((..(((....)))))))).......)))))))))(((.(((..((((((.....((((.((((((((................(((((.............)))))(((((........))))).........((((((.(((((((.((.((((.((((...(((((((((.(((..(((((....((((.(.((((.(((.((.((((......)))).))..))).))))).))))....)))).)..))).)))).)))))....))))...)))).)).)))))))))))))))))))))..))))......))))))....))).)))))))))))))))).(((.((((.((((((((.((((((((((((((((((((((((((....................)))))))))))).).)))....((((((..(((((((((...........(((....)))..(((((((((.(..((((..(((...((....)).))).))))..).)))))))))....((((((((((((..(((((((.(((((((.(((((((((..(((((((...((((..(((((((((.(((...((((...)))).)))))))))))).))))........((((...(((.........)))...))))(((((((...)))))))....((((((((((...))))))))))....((((((.(((((.....)))))))))))..((((...(((((.....((((((.((((.(((((......(((((...(((((((((.((.((((.........)))).)).))))))))))))))))))).)))).))))))....))))))).)))))))))....(((((((((((.....))))).....))))))......))))).))))......)))))))((((((((((((((((((((............((((.(((..((((((.......))))))....)))...))))((((....)))).(((((.((((..((((((.((((..((((..((....))..))))....))))))))))..)))).))).))))))))))).(((.(((((((.(((((((.....((((((.((((..(((((.(((((......))).)).))).))...)))).)))))).....))))).)).)))))....))..)))((((((((.......))))).)))........)))))).)))))......))))))).)))))))))))))))))))))...)))).)))))))))))).)))))(((...(((((((((...(((((((...(.(((((.(((((((....((((.(((......................))).))))....))))))).).)))).)....(((((..((((((((((((.....)))......(((((...........)))))(((((((.....))))))))))))))))..)))))...........((((((.(.((((....))))...).))))))....(((((..((.....))..)))))(((.......)))........((((((((.((((..(((((((((.....)))).))))).............................((((((.((........))))))))..((((.(((((.......((((..((((.((((((((((((((((.............)))))...)))))))))))))))...((((.(....))))).(((((....)))))...(((((........)))))......))))....((((..((((....((((((((((.....(((...((((.((((.(((((((...(((((((((.((((...((((......(.((((((((.((((((((.(((.............))).))))))))......)))))))).).....((((((.((.((.....))))))))))((((...))))..(((((....)))))..))))..)))).)))))))))..(((((.......)))))((((((.((.((((...((((((((((....))))........((((((.....(((.((.........)).)))....))))))..))))))...)))).)).))))))........................((.((((((((.......(((((((...)))))))......)))))))).))..(((((..............))))))))......))))))))))))...))).....)))).))))))..))))..))))((((((...))))))((((((...........))))))((((((((((.((.((((((((((((.....(((((......)))))))))))((((((........))))))((((......))))..((.((.((((((((((((((((((..((((((((.(((((.((((....((((((((.......)))).))))....))))..))))))))).....))))............(((((.......))))).((((((((((((((...((((((.(..(((((.((.((((..(((((.((..((((((..(((((....((((((....)))))).....)))))((((..((((......))))..)))).......((((((((((...(((((((.....)))))))...)))))...)).)))....(((.((((((((((((((((((...(((((..(((..(((.(((((.....((((......))))......(((((((.((((((((..((.((........))))(((((((....((((........)))).)))))))...)))......))))))))))))((((((..((((((........))))))...))))))(((........)))(((((.......)))))))))).))).)))..)))))..........(((((((..((((.................)))).......(((..(((((.((((....)))))))))..)))(((((....)))))............(((((((((......(((((((.......((((((.(((((....(((((.....)))))))))).)))))))))))))......(((((......)))))........................(((.....)))(((((((((.((((.......)))).)))))..))))((.((((((((((......(((((((...((((.((((.(..((((..((((((((((((.((((..((................)).))))...))......)))))))))).........((((((..((((...))))..))))))............))))..).))))...............((((((((((((((.((((((...((((.......(((((..........((((((((((((((((((......................))))....)))).))))))))))......((.((((((........)))))).))......((((((((((((...........))))).)))))))...........((((((((.((((((.(((..((..((((((((.((..(((((((((((((((..((((((.(.((((......)))).).)))))).......(((((....)))))............(((((((((((((((....))))))))))............))))).)).))))))))))(((.......))).....(((((((........))))))).....((((((((....))))))))......((((((...))))))....)))..)).)))).))))..))..)))..))))))))))))))))))).......))))))))))..)).))))))))))))....)))).))))....))))))))))))).))..............))))))))))).)))))(((((((.....)))))))....)))))))))..)).))))))).)))..(((((((((((((((.........(((.....(((((.(((((.....(((...((((((.......)).)))).....)))......))))).)))))))))))))))))))))))...((((((((..((((......))))..))))))))))))))....))))))).)))).)).)))))..).))))))))))).)))))))))(((((((((((((...(((((..((((.((((..(((((..........)))))..)))).)))).....))))))))))..))))).....))).........(((((((((.....))))))))).....((((((..((......))..))))))....))).))))).)))))))))).)).))..(((((...........)))))..)))))))).))))))))))..............))))).))))((((.(((((((....)))))))..)))).....)))).))))))))((((((((.(((((..........................((((((....))))))..........((((((.(((((((..(((((((......(((((((..((((((....)))))))))))))(((((((..(((.((((((((((((((...(((((((..((((........((((((........)).)))).....))))....))))))).........))))))))..)))))).)))....))))))).)))))))...((((((((((((.(((((....)))))....(((((((......(((......))).....))))))).((((((((((((...((((....(((((((.....((....)).....)))))))..)))).)))))...........))))))).))))))))))))(((((.((((....))))..)))))...)))))))..)))))).....))))).))))))))...))))))))))))))))..)))))).)))).))).............((((.....))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,.((((((((((((((((..(((((((((.((((.((((..(((....)))..).)))..)))).}}))).)))))..)).)))))),})))))))(((.(((.((((((((((((({(({(,,((((((((((.(,,(((((((((((..,(({{.,{{||{.{{(..{{{|..((((((((((..(((((((.(((((((.{.{.(.(((((.(.((((((....((((((..(((.(((((.,.....}...))))},.))))))))).,,,({(((....,||,,||{{((({((((((((((.(((.((((((((.((........)).)))))))).))}}.)))))}...,}||,,.|||{..||||||{.{|||{|,||,.(((({{({((((((({({,,{||}{|||}|||,|..,}||||||}}|||{|..,|||,}||||}}|},}}}}}((((((((.(((((..(((.(((((.....))))))))..))))).))))}}))}.,(((({.....,.,,,,.....,)))))).,{(((((.((.((((({((..........}).).)))))))))))))|(.((((((.{.((({..|(((((.....))))))})).}.)))))),)}))))}},|||}|{{|||||||{||},},)}}}.,),))),)}))})}),}.)))))).).))))).}).}.))))))).))))))).....))))))))))),,),,}.,},.,)))))})})))),),))))))))))..))))|,(((.((((.(((((.((((......))))))))).)))).))),),...(((((((,{{...}}))))))){|||,.,,,,..)))).,..,.))))),}))))))).)))))}....,.((((((((((..(((((((((.((((,..,,,.}}}},|||}}},,|,...)))))))))(((.(((..((((((....,((((.((((((((,...............((((({{.......)},,)}}))(((((........))))).........{(((({{(((((((.((.((((.((((...(((((((((.(((..(((((....((((.(.((((.(((.((.((((......)))).))..))).))))).))))..,.)))).)..))).))))},))))....))))...)))).)).)))))))))))))))))))))..)))).,....))))))....))).)))))))))))))|{{,(({,,,....{,(((((.((((((((({{(((((((((((((((....................)))))))))))).}.}}}...|{{|{({.,(((((((({......,....{((,,..}}}..{((((((((,|.,{{{{,,(((,,,((..,,|}.},,.,)))}),.)))))))))..{(((((((((((((,.(((((((.((((.(((((((..((({.{(((((((({((((..(((((((({{(((..,(,,.....))}.)))))))))))).))))((.(((({,({(((((.(,{{{,...,))),..(((((((((((...)))))}}.,,.((((((((((...))))))))))},..((((((.(((((.....))))))))))).,))))..}.))))).},)))))}),...,,{,..,}}.((((((..,........,..))))))..}))),,)))))))}...))))))))))){(({{({{{(({(({.,{{,.{{.{||{|{..,({,(((((({({(.((((,,,,,.....)))))}}}...((|.(((((,.,.((((....)))).)))))).,))......(((((((((((.,,,.........((((....}))).,,.......,,},,)))))).))))),,||||||.,..)))),{(((({((((..((((((.((((..((((..((....))..))))....))))))))))..)))}.|}))))),|,,,|},.|||}||,||,..|,||,||,..}|||||||}|||||,{((,{..,({{|{{{{.}||||||}}},}|,,|||||,}}||||{.{{,|||||.||.|||}}|,||||...,)))}},)))},.}..},,.)))))}}},))))))))},,.}}},,......))))))).)))))))))))))))))))))..,)))}.)))))))))))).)))))..,|{{{{{|||,,,,))}}}.}}}}...((((,..(((((((.(((((((.((,({,,,,,...,,,,.....,,.,,{{(((((({{{(({.,,.|||...{|{,..{{(((,,(((((((((,,......,|,,,...|{((((...........))))}{((((((.....))))))}))))))))).,)),}},|,||||....((((((.{.((((....))))...}.))))))....{{(((..((.....))..)))}}...(((((((((..((((..((.(((((({....}).)))))))....)))).))))))))),{{{,..{(((((((({,{{{(.....((((((.({........}}))))))......}}}}},.{{{{,.{{({,.{(((.((((((((((({{{{,...,,.,,....,)))))...}))))))))))||}}...{(((.{....}||||.{({{{.,,})}}})||,|...,|||..||||||||..,,,,||||.....{{{{{|,,,||,|,|{{(({.({{{{{{{|,..,,,.(((((((...,((((({{,,.{,(,{{{,.{{||||||,}.,,.{.((((((((.((((((((,{,,..,,.....,...}}}.)})))))}......)))))))).}....,|||{((.((.((.....)))))))))){|||,,,})}}.||||||....}))}},..)))))))))))))))))))))}|,||......,))})),}.....}))))))))}}|||},((((....))))........,{((((.,.,,{{,.{{......,,,}},))}....))))))}}).))))}}})).)}.))))))).))))))))))).(((((((((((.({.((((((((.......(((((((...)))))))......)))))))).}}..,{(({.,,,,,...,{{{,|,,}}||,{|||||..,.,,{{{{{.,,.(((((.....,,....))}||,..},,,},|{{((({.,,|}}|||((((((...........))))))|||(((((((.((.((((((((((((....,||{{{,,...{|}||},,,,,.{(((((........)))))|((((......)))),.((.((.((((((((((((((((((..((((((((.(((((.{,{({,,.((((((((.......))))},)))...,))),..))))))))).....)))).........||.(((((.......))))).((((((((((((({..,((((((.(..(((((.((.((((..(((({,({.,(((((((((({,,.{{{((,{{{..},)))}))}}}},),)))|(((..((((......)))).,||||.....,}}|||,(((((...(((((((.....)))))))...)))))...,,........(((.((((((((((((((((((...(((((..(((..(((.(((((.....((((......))))......(((((((.(((((((...((,((........})}}(((((((....((((........)))).)))))))...}}}....,)))))))))))))((((((..((((((........))))))..}})))))(((........)))(((((.......)))))))))).))).)))..)))))..........(((((((..(({{..,...........,..}))).......(((..(((((.((((....)))))))))..)))(((((....)))))............(((((((((......((((((({,,...,(((({{.{{{{|},,,(((((.....)))))))))).}})))))))))))......(((((......)))))....{{,...,.,.,{,......,{{{.....))){{{{(((((.((((.......)))).)))))..,}}}{(.((((((((((,{,,{..,,,,...}}}|||{((((((({(({{({.({,{{{...,,,)}}.},,)),,))}),,,,,,.,,}|(((((.,{({{,,.,{{{{|,,.,|||,||.....((((((..((((...))))..)))))).......,|},}}.,.,.,,,...,},}}}}}}.,,,..((((((((((((((.((((((...{{((.......||,,,..........(((((((((({(((((((......................))))....)))}.))))))))))......((.((((((........)))))).))......((((((((((((...........))))).))))))),(({..{{{{{((((((((.((((((.{({..((..((((((({.({..(,{(((((({(((,{,((((((.,{,{..{|.||}.}}|||,..,,}))},,,,..(((((....))))).{||,.,,.,,,}))}}((((((((((....)))))))))).......,,,,{,,..}})),},})))},,|(((.......))))....(((((((........))))))).....((((((((....))))))))..,...{{|||{.,,}}}}},....,}}}})).)))).))))..))..})}..)))))))))))))),,,))}},..}}))),))))))..)),}))))))))))).)))))},.,{{{...})).}))))))))).)}..............))))))))))).)))))(((((((.....)))))))....))))))))}..,),))))))).)))..{((((((((((((((.........|{{.....(((((.(((((.....((({{.((((((.......))}})))..}},)))......))))).))))),,,)))))))))))))))...{((((((({.((((......))))}}}})))))),}}}}}...,))))))).)))).)).)))))..).))))))))))).))))))))){(((((({(((({..{(((({..((((.((((..(((((........,,)))))..)))).)))).....)))))))))).,))}}}..,,,}}}...,,....{((((((((.....)))))))))...,.((((((..((......))..)))))),}..))).))))).)))))))))).)).))..(((((..,........))))),})))))))).)))))))),,...,......)))}}}}}},.}||{{({,(((((((....)))))))..)},,,,},},.,,{{,..,}}}|,|||||||||||{,,,...,}},,..,...{{((((((({.,(((({{.((({,,,{{,.....,{(((((.(((((((..(((((((.{,.,,,(({(({.{((((((....)))))))}}}}}}((((((({.{((.{(((((((((((({...{({((({..{|||,.......{{,{{{......,.))}})}},..,.||||,,..})))))),}}}}....}))))))}..}))))).})),,.,)}))})).)))))))...((((((((((({.(((((,{{,,}|||,..,{{{{{(({{....,,,.,....})).,},.,,,,,}}.{{{{{{{,{{,....((({,..,({{((({.,,,,((,,..}}.....}}))))),,,..,))),,}.,}}}}..,..))))))),))))))))))))(((((.((({....})))..)))))...)))))))..)))))}..{{{||,,,.,),))))|,,{|,..|||||,,||,}))}.})))))))))))))))......,,.)))))))))))..,},}}}......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACUCGCCUGGAGCGCGCGGGCAAGGCGGGCGGAGCGCACUGGAACUCAA… 6231 nt 0.4365
Summary

Enables identical protein binding activity. Predicted to be involved in regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway. Predicted to be located in cell projection; plasma membrane; and synapse. Predicted to be part of receptor complex. Predicted to be active in GABA-ergic synapse; postsynaptic membrane; and presynaptic active zone membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans using subcutaneous adipose tissue transcriptomic data from the TwinsUK cohort demonstrated that the KCTD12 is part of a 38-gene obesity signature, where its expression had a positive coefficient of 0.0622 [Francesc Font-Clos et al. DOI:10.1088/1361-6579/aab85a].