Basic Information

Symbol
KERA
RNA class
mRNA
Alias
Keratocan SLRR2B Keratan Sulfate Proteoglycan Keratocan CNA2 KTN Keratocan Proteoglycan
Location (GRCh38)
12:91050491-91058024
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007035.4
Sequence length
2203.0 nt
GC content
0.3541

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-487.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -530.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 657.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007035.4 NCBI
AAUCCAUUACCAUGUACAAGCAGUGACCAAUAGAAAAGGAAGAAGAAGA… 2203 nt 0.3541
Summary

The protein encoded by this gene is a keratan sulfate proteoglycan that is involved in corneal transparency. Defects in this gene are a cause of autosomal recessive cornea plana 2 (CNA2).[provided by RefSeq, May 2010]

Forensic Context

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