Basic Information

Symbol
KIAA1244
RNA class
mRNA
Alias
ARFGEF Family Member 3 KIAA1244 BIG3 Brefeldin A-Inhibited Guanine Nucleotide-Exchange Protein 3 DJ171N11.1 PPP1R33 C6orf92 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 33 Chromosome 6 Open Reading Frame 92 A7322
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_020340.5
Sequence length
14859.0 nt
GC content
0.4576

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4675.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((..(((((((.(((((((..(((((((((((((((.(((((((..(((((((((..(((((.(((..(((.((...))))))))..((.((((((((..........))))))))))))))))))))))))..)))).....(((.....))).((((..((((..(((((....(((.(((((......((((((((....((((((..(((.(.((((((((((...)))))).(((((.((((....)))).))))).((((.((.....))..))))....))))).)))))))))...))))))))..............(((((((......)).)))))((((((((((((.((((((((........)))))))).....(((((...(((..(((((((((.((...)).))).))))))..)))....)))))..(((((.(((((((.(((.(....(((....)))....))))))))))).))))).)))))).)))....)))...(((((((((((.(((((((((..(((((..(((.((....((((((........)))))).....)).)))..)))))..)))).......((((((.(((((....(((((.....)))))((((((.(......)))))))(((((.(((((.((....(((...))).....(((((((((((((((((...(((((....((((.(((((((((((...)))))).....))))).))))....)).)))))))))).(((((((((((.((.((...............)).)))))))))))))....((((((((.......((((((...(((...............)))....)))))))))))))).))))...))))))......)))))))))).))...((((((..((((.....)))).))))))...............))))).)).))))(((((((((.((((((((((....(..(((((((((((((((((((((((((........)).)))))).))))))).....(((((((.(((((.(((((...(((((((.((..............))))))))))))))((((.((((((((....))))))))..))))..(((((.(((((.(((.(((((..((((((...............))))))..)))))......(((......))).((((((.(((((....))).)).))))))..(((...(((((((.(.(((...........(((((((((...((((...((((.....))))))))..)))))).)))........((((...))))(((((.......))))).....(.((((((........)))))).)))).).)))))))))).((((((....))))))(((((.((....)).)))))))).))))).)))))(((((((((.(((.....))).)))).)))))..((((((...((.(((((((((((((.(((.....(((..((((.(((.......))).))))(((((((((((.((((.(((.((((........((((((((((((((((......(((((((.....((((((((((.(((((......))))).((.....))((((((..((((..((((((.((((((...((((((.....)))))).............)))))...).).)))))..)))).))))))..((((..((((((...(((.(((((.((((.((((((((....((((.((((((.(..(((..(((....)))..)))..).))))))........(((((.(((....))))))))....((((((.((.(((.(((...((.((.((.......)).)).)).))).))).))...))))))(((((((((((.....)))))).))))).)))).((((....(((((.((((((..(((..(((((...((((((.(.((((....))))...).)))))).......)))))..)))..))))))........)))))))))...)))))))))))).))))).)))((((.((((...(((((((((((.(((.(((((((((((((....))))..)))))..((((.........))))..(((((.(((((........))))).))))).)))).))).))..)))))))))...))))(((((....))).))....(((((.......)))))....)))))))))))))).))))))))))..(((((.((((.........))))....)))))....)))))))..)))))....))))))))))).....(((((((.((((((.((.(((((((...)))).(((((....)))))...(((((.(((((((((.((((((((((.(((((((((((.(((.((((((..(((((...(((....)))))))....(((((((((((.((..((((.((((.((((((((((..((((........)))).((((((((((...(((((((.......))).)))).((((((((((((..(.(((((.....))))).)(.(((((((.(((((((..(((.((.......)).)))..)).)))))....))))))).))))))).))))))(((...(((((((...(((((....((..(((((.((....)))))))((((.((............)).))))(((((....))))).((((((((((...))).))))))).))....))))).)))))))..)))......(((.(((((((((((((((.(((.(((((....))))).(((((((..((((....(((......)))....)))))))))))(((..((..((((((((.((((((.((((.....................((.((((((((...(((((...((((((((...(((...)))....(((((((((.....(((((((....(((.(((((.(((((((((....)))))).)))..((((((.(..(((((((.(((.((((.....((.((((((.((((.(((((...(((..((((((((..((((((((((.......))))))))))((((((((((((........))))))....))))))...(((......))).......)))..((((((.((((((.((....)).)))))).).)))))..((((..(((((((.((((((..(((.((...)).))).((((((((((((...))))(((((....)))))...))))))))((.(((.((((...)))).))).))..((.((((((((....)))))))).))))))))..)))))))..)))))))))..))).....)))))..)).)).)))))).)).((((....))))..)))).))))))..(((.(((((((.((....))..(((.((.((((((((((.....)))))))))).)).)))..))))))).)))...((((.......))))((((((.(((.(((((...)))))))).)))))).))))).)))))).......))))).)))..)))))))((.(((......))).))...((.((((((........)))))).))))))))))))))))).)).)))))...)))).)))))))))).....)))))).)).))))))..)).))).((((((((...(((((......)))))......)))))).)).....((((......))))((((.(((.....(((((........)))))....)))))))..))).))))).)).)))))))).))).....))))))))))..(((...)))..)))))))....))).)))).))))..)).))))))))))).)...))))))))))))).)))))))(((((((..(((((((....))).....)))).)))))))(((.((..(((((((.........((((((((((.((((((.....(((((((((..((.((((.(((.((((..((.(((((((((((((((....((((((((((((.....((((((.((((((((.(((((.....))))).))........)).))))(((((((((.((((...(.(((.((.(.((((((....))))....))))).)))))))).))...)))))))((((((((......))))).))).((((((.(((((((((((...(........)...)))..)))))))......).)))))).......))).)))..)))))))))..)))...)))))((((.(((..((.(((..(((.(((((.((((((.............))))..)).)))))....(((((((((((.....(((((((((((....))))))).)))))))))))).))).....)))))))).))))))).....(((...))).)))))))))).))..)))).))).))))))..))))))))).)))))).))))).)))))..))))))))).))).(((....(((((((...)))))))....))).(((((....))))).((((....))))...)).)))))))).))))))))))))))(((.(((((((((((((.((((((((...................((((.(...((((((........))))))...).))))))))))))))))((((((....))))))....)))))...)))).)))))).)).))))))))))))).((((.((((.(((((((((((((((...((.(((((.........))))).))..)))))))))....))))))..))))..))))...........(((((.(((.((((((((((((((((...(..((((((((((.((....))(((((.((((((((........))))))))...)))))))))....))))))..)..))))..((((........)))).)))))))))))).)))..)))))..(((((((((((.((.......(((..(((((((((((((((((((((.((((((((((....))))))).(((.(.((((....((....((((((.(........).))))))....))....)))).).)))...((((((((.((.(((.((......((((((...(((((...)))))...))))))....)).)))((((((...))))))...............((((.(((((((.......))))))).((((((((.(((.((.((((..((((((((((.(((..((((.......))..))..))).))))))))))........((((((((...)))))..))).)))))).)))..))))))))..(((((((.((.(((.........((((((...(((..(((.............)))..))).)))))).(((((.(((((................((((.((...))..)))).....((((((...))))))...))))).)))))((.((((((..((..((.((((((....)))))).))..))..)))))).)).....)))..)))))))))..))))....)).))))))))(((((((..((((((.........)))))).)))))))......))))))))))))))).(((((....((((((.((....(((((((((..((((.......))))))))..)))))(((..((((((((..((...((((....))))))))))).))).)))(((((..(((.((((((((((((((...((((.((.((((.(((((.(((((((((((((....((((......(((((((((.((((...........)))))))))).....)))....)))).)))))).....))))))))))))..(((((((((.....)))).....))))).......))))....)))))).))))))).)))))))))).))))).................)))))))).....)))))..))))))))).(((((...........(.((((...((((......)))).....)))).).....)))))...)))........)).))).))))))))....)))).))).)))).)))))))..))))(((..(((((((((.........((((...((((............)))).)))))))).))))).))).))).....))).))))))).))))))))...))))))))))).))..))))).))))))))))..).....))))))).))))).....)))))))......))))).))))).)))))).))))).)))....))))).))))))))..)))))).)))))))))))).((.((((..(((....)))..)))).))...........(((((((((((((((((((((.((((((((((((..(((((...))))).((((.((((..(((((.((....(((((((.((.........)).).)))))))))))))))))))))...((....))......)))))).)).))))...((((((.((((((((((((.((.(((((((((((((..((((((((((((.....(((((((((.........(((((((((.....((((((.((.....)).))))))........(((((((((.(((((((((((....))))))))....((((((((((........))))))))))(((((((((....((((...(((((.(((.(((((((((((((((((((((....)).))))))))........)))))))))))..........................((((((((((...((((.((((((.......((((.......))))........))))))))))..............((((((((....))))))))((((((..(((((((((...........((((((((((..((((((((.(((((((((((((((((((((.(((((....(((((((((.............((((((..((((((((((.(((....)))..........((((((((..((((((((((((((.(((((...(((((......))))).(((((((((.(((((.(...(((((...)))))...).)))))..(((((((((.((((.(...(((((((((..((....((((....))))....))..)))))))))))))).))))).)))).(.(((((((((........)).))))))).).))))))))).))))).))))))))..((((((....((.(((((((((((((.((((((....((.(((((......(((((((.(((((..((((((............))))))..)))...)).)))))))....(.(((......))).)..))))).))))).)))))))))).)))))).))..)))))).(((((((....)))).))).........))))))...))))))))(((((.(((((((((((.....))))....((((...............))))..))))))).))))).))))))))))..))))))............((((((((..(((....))).....(((((((((....))).))))))..........))))))))((((...(((((.......)))))....))))(((((.(((((...((((..(((.((((((((((((((...........(((((((.......))))))).....................(((((((......(((..................))).((((...)))).((((((..((((((((((..........(((........))).........))))))))))..)))))).))))))).......)))))))))))))).)))..))))...)))))..)))))))))))))).........((((((((.......((((............)))).........)))))))).(((.(((((.((((....((((((((..........((.((((((...(((((((...(((.((.......)).))).))))))))))))).))(((.((((....)))).))).(((((.(((.(((((.((((((.((......)).)))...)))))))).))).)))))...)))))))))))).)))))..)))..........))))).))))))))))..))))((((.....)))).)))))))...((((..(((((((....(((((((..((((((.((((.......)))))))))).)))))))...)))))))..))))..((((((((((((((((.(((..((((((..(((((....))))).......((((((.((((((((((((...)))))......((((((.((((((.....)))).))...))))))((.((((((((((((((.......((((.....))))((((..........)))).((((((...(((.((((......((((.(((((....((((.............))))))))))))))))))))....))))))........)))).(((..((((..((((((..(((((((((((((....((((((........))))))...)))).))))....))))).....))))))..)))).)))...................(((....)))...)))))))))).))))))..))).))))))....((((((......)))))).......(((............(((((....))))))))....))))))..))).)))))...)))))))))))))))))))..))))))))))...(((.....(((((..((((((((((((...........))))))))..)))).))))))))..)))))))))...(((((((((.(...........).))).))))))))))))...((((((((.(((...........((((((((..(((((((.......(((((...(((((..((((((......))))))....)))))...)))))..)))))))))))))))(((((((((((((((((((..((((((.((.(..(((((..(((.((((((((((((((....))).))).(((((.((((.(.............).)))).)))))..))))))))...))))))))..)))))))))..)))......((((.(((((((....(((((((((.....(((((((..(((((..((((...((((..((.(((((((...........((((((..(((((((((..((...................))..))))).))))..))))))(((((((((.(((((..((((((((((((..((((..((((....))))..))))...........))))..)))))))).............(((((((((((((..(((((((......((...((((((((((((..(((......))).))(((((((....)))))))....((((((...((((((.....)))))).))))))((((((((((((((.(((((.((.((((.(((((..((((((..(((.........)))..))))))..(((((............(((((.((((((.....(((((((((((.(((((.((((....((((((...........))))))...))))(((........)))...............(((((((.((((..(((........((((((.(((((....)))))..((((.((((....)))).))))...((((((.....))))))(((((.(((.(((.((.((((((....)))))).))...))).)))))))).(((.(((...))).)))......................).))))))))..)))).)))))))...((((........))))....))))).))))))))))).......)))))).))))).....((((.(((.(.((((...))))).))).))))....((((((...))))))(((.......))).....(((((((.(((.((.((((((((..(((((...(((((.(((((..((........))..))))).)).)))....)))))..))))))))..))))).))))))).)))))..))))))))).)).)))))...(((....))).)))))).))))))...))(((((...............)))))..))))...))))))))......))))))).)))..)))))).))))..(((...)))((((.((((((((...(((..(......)..))).)))...))))).)))).......))))).)))).))))).)))))))..))..)))))))))))))..))))))).......))))......((((...(((.((((((.....)))))))))..))))((((((((((...........))))))))))..((((((((((.......((((.....))))..(((((((((((((..((((((((((...(.(((..((((((........(((((..(((...((((......(((((((......))))))).((.(((.....(((((.....)))))......)))))(((....))).........(((((((((((....)))))))))))(((((..((((((...(((((..(((..............)))..)))))...))))))..)).)))(((((((........((((((((..((((..............))))...))))))))........)))))))(((((........))))).(((.(((..(((((((.......))).))))..))).)))......)))))))..))))).(((((((((......))))))))).(((((...........)))))..............))))))......))))))))))))))..))))).)))))))))))))))))).......((.(((((...))))).))........((((((.((((....(((((....)))))........)))).))))))....)))))((((.((((((...((((....))))...)))))).))))...(((((..(((..((.......)).)))..)))))..))))))))))).))))))))))))((((.......))))((((((....(((........((((.((.....))))))........)))....))))))((((((.....)))).))...))))))))))))))))))))))))).((......))..........))))))))))))..).))))))))..))).))))))))).....(((((((..........................))))))).....((((((((((...(((((((((((.........))))).)))))).....(((((.((((((((.(.(((((((((((((((..((.(((((...............(((((((((((((.................))))))))......)))))(((((((((................)).)))))))....((((((((((...(((.((((.......)))).)))..))))))))))...))))).)).)))))..(((((((........)))))))........)))))))))).).))..)))))))))))(((((((....))))))).((......))....))))))))))((((.....))))....)))))))))................((.(((....))).))...(((((..(((.......))).)))))))))))))).....((((((((((((.(((((((((((((((((((...((((.(.((.((((((((((((..((((.....................(((((((((((((.......)))..))))))......)))).((((((....)))))).....)))).))))))).........)))))...)).).))))...)))))))))))))..((((((...................)))))).(((((.(((....)))...))).))..(((((((.((((.((....)).))))((((.((((..(((((......((((....)))).)))))))))))))..))))))).((((((.....((((..(((((.....)))))..))))....)))))))))))).)).)))).)))))).......))))......))))))))..))))))))).)))).)))))(((((((((((.((.(((((....))))).)))))...)))))))).........)))).)))))))))))............(((.((((....)))).))).......)))).))))))))))))).)))))))))))((((((((..(((((..(((((((((..(((((........((((((....((((.............))))...))))))(((((((..(((.....)))..))))))).............)))))))))).))))..)))))..........)))))))).((((((......))))))..))))....)))...)))))...........(((((.((((((....)))))))))))...(((((((((((((((((((((((.((.......(((((....))))).........(((((((((((.....)))..................(((((.(((((((((((.((((((((((...(((((.(((((.((((((((..........)))))))).)).))).)))))..)))))(((((....))).))............(((((((((...((((((((..(((((((((((((.(((.(((....(((((((..(((((......((((.....))))....((((((.((((((....(((((((......))))))).((...........)).....((((((......((((..((....))..))))......))))))......((((((....)))))))))))).))))))....))))).)))))))....))).))).((((((((((.......))))))))))((((((.((((((....................)))))).))))))((((((((....)))))))).........(((((((((((......(((((((..((......))..)))))))....))))))).))))..((((((..((.((..((..(.((.....)))..))..))))..))))))..(((((((((.((....)).))))))))).)))))))))))))(((((((((.(((((((..(((.......))).)))...)))).))))))))).....(((((.....(((...)))...))))).)).))))))....)))))))))..(((((.....)))))........))))).))))))......)))))..)))))...)))))))).......((((((((((((((((.......))))))..((.((((...))))))....(((((((((((((((........)))))((.(((((((((((((...((((((((((((...((((.(((.(..(((((.............)))))..).))))))).))))))))))))........)))).))))))))).))...(((.((((((((((.......................((..(((.(((((......((((((((......))..))))))))))).)))..)))))))))))).))))))))))))).....))))))))))((((((..............))))))(((......)))..((((((((((((((.......((((((((((((((((((((((((.((..(((((((..........((((.(((((((((((...))))).)....)))))))))..(((((.(((.(((.....))).))).))))).......(((((((....................)))))))(((((((.......((((((....)))))).)))))))(((((.....)))))..((((((((.(((....))))))))))).))))))))).))))))....))))))))...)))).))))))....((((....))))..(((((((.((.(((..(((.......))).))).)).)))))))..))))))))).)))))......)))))))...))))).)))))))))))))................
Summary

Predicted to enable guanyl-nucleotide exchange factor activity. Predicted to be involved in regulation of ARF protein signal transduction. Predicted to be located in transport vesicle membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.