Basic Information

Symbol
KIF13A
RNA class
mRNA
Alias
Kinesin Family Member 13A RBKIN BA500C11.2 Kinesin-Like Protein KIF13A Kinesin-Like Protein RBKIN Homolog Of Mouse KIF13A Mannose-6-Phosphate Receptor Transporter
Location (GRCh38)
6:17759183-17987635
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022113.6
Sequence length
6007.0 nt
GC content
0.4858

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1912.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2028.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1502.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001105566.3 NCBI
GUCGCGCUCCCCCGGGAUGGCCCGCGCGCCUCGGCGCUGCCUCUCGGAG… 5902 nt 0.4854
NM_001105567.3 NCBI
GUCGCGCUCCCCCGGGAUGGCCCGCGCGCCUCGGCGCUGCCUCUCGGAG… 5863 nt 0.4861
NM_001105568.4 NCBI
GUCGCGCUCCCCCGGGAUGGCCCGCGCGCCUCGGCGCUGCCUCUCGGAG… 7153 nt 0.4721
NM_001243423.2 NCBI
GUCGCGCUCCCCCGGGAUGGCCCGCGCGCCUCGGCGCUGCCUCUCGGAG… 1342 nt 0.4367
NM_022113.6 NCBI
GUCGCGCUCCCCCGGGAUGGCCCGCGCGCCUCGGCGCUGCCUCUCGGAG… 6007 nt 0.4858
Summary

This gene encodes a member of the kinesin family of microtubule-based motor proteins that function in the positioning of endosomes. This family member can direct mannose-6-phosphate receptor-containing vesicles from the trans-Golgi network to the plasma membrane, and it is necessary for the steady-state distribution of late endosomes/lysosomes. It is also required for the translocation of FYVE-CENT and TTC19 from the centrosome to the midbody during cytokinesis, and it plays a role in melanosome maturation. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

A study in human menstrual blood-derived stem cells (MenSCs) identified the KIF13A as a differentially-expressed gene that was up-regulated with increasing passage number in vitro [Chen et al. DOI:PMC4713568].