Basic Information

Symbol
KIF1C
RNA class
mRNA
Alias
Kinesin Family Member 1C SPAX2 SPG58 Spastic Ataxia 2 (Autosomal Recessive) Kinesin-Like Protein KIF1C SAX2 KIAA0706 LTXS1 SATX2
Location (GRCh38)
17:4997722-5028401
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006612.6
Sequence length
7917.0 nt
GC content
0.5491

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3415.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3546.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1797.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006612.6 NCBI
AGCUCGCGCUGCCCGGGCGGGCGCCGGCCGCUGGCGCCGCUACUGCUGC… 7917 nt 0.5491
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the kinesin-like protein family. The family members are microtubule-dependent molecular motors that transport organelles within cells and move chromosomes during cell division. Mutations in this gene are a cause of spastic ataxia 2, autosomal recessive. [provided by RefSeq, May 2014]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the KIF1C was downregulated in subcutaneous adipose tissue during short-term (0-5 month) weight loss in obese participants [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].