Basic Information

Symbol
KIF5C
RNA class
mRNA
Alias
Kinesin Family Member 5C NKHC2 Neuron-Specific Kinesin Heavy Chain 2 Kinesin Heavy Chain Neuron-Specific 2 Kinesin Heavy Chain Isoform 5C Kinesin-1 Kinesin Heavy Chain EC 3.6.4.- KIAA0531 CDCBM2 NKHC-2 KINN NKHC
Location (GRCh38)
2:148875227-149026759
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004522.3
Sequence length
6954.0 nt
GC content
0.4461

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2101.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2231.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2221.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_004522.3 NCBI
AGAGCGCGCUGGUGCUGAUGCAGGAUGGCUGAGCGCGCAGGAGCCCGGG… 6954 nt 0.4461
Summary

The protein encoded by this gene is a kinesin heavy chain subunit involved in the transport of cargo within the central nervous system. The encoded protein, which acts as a tetramer by associating with another heavy chain and two light chains, interacts with protein kinase CK2. Mutations in this gene have been associated with complex cortical dysplasia with other brain malformations-2. Two transcript variants, one protein-coding and the other non-protein coding, have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2015]

Forensic Context

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