Basic Information
Symbol
KLC1
RNA class
mRNA
Alias
Kinesin Light Chain 1
KLC
KNS2A
KNS2
Kinesin 2 60/70kDa
HKLC1S
HKLC1N
HKLC1P
HKLC1G
HKLC1R
HKLC1J
HKLC1B
Medulloblastoma Antigen MU-MB-2.50
Kinesin 2
KLC 1
Location (GRCh38)
14:103561896-103714249
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_001394837.1
Sequence length
2550.0 nt
GC content
0.5376
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-936.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-980.60 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
625.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… | 5709 nt | 0.5292 | |
| AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… | 2480 nt | 0.5375 | |
| AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… | 2477 nt | 0.5382 | |
| AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… | 2456 nt | 0.5379 | |
| AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… | 5669 nt | 0.5294 | |
| AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… | 2427 nt | 0.5356 | |
| AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… | 5642 nt | 0.5292 | |
| AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… | 2400 nt | 0.5354 | |
| AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… | 2649 nt | 0.5134 | |
| AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… | 2622 nt | 0.5130 |
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Summary
Conventional kinesin is a tetrameric molecule composed of two heavy chains and two light chains, and transports various cargos along microtubules toward their plus ends. The heavy chains provide the motor activity, while the light chains bind to various cargos. This gene encodes a member of the kinesin light chain family. It associates with kinesin heavy chain through an N-terminal domain, and six tetratricopeptide repeat (TPR) motifs are thought to be involved in binding of cargos such as vesicles, mitochondria, and the Golgi complex. Thus, kinesin light chains function as adapter molecules and not motors per se. Although previously named "kinesin 2", this gene is not a member of the kinesin-2 / kinesin heavy chain subfamily of kinesin motor proteins. Extensive alternative splicing produces isoforms with different C-termini that are proposed to bind to different cargos; however, the full-length nature and/or biological validity of most of these variants have not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in human keratinocytes and mouse skin demonstrated that X-ray irradiation (5 Gy) significantly downregulated the KLC1 (KNS2) with a 0.63-fold change at 3 hours post-exposure, as identified via cDNA microarray analysis [Koike et al. DOI:10.1269/jrr.46.173].