Basic Information

Symbol
KLC1
RNA class
mRNA
Alias
Kinesin Light Chain 1 KLC KNS2A KNS2 Kinesin 2 60/70kDa HKLC1S HKLC1N HKLC1P HKLC1G HKLC1R HKLC1J HKLC1B Medulloblastoma Antigen MU-MB-2.50 Kinesin 2 KLC 1
Location (GRCh38)
14:103561896-103714249
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001394837.1
Sequence length
2550.0 nt
GC content
0.5376

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-936.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -980.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 625.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005552.5 NCBI
AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… 2574 nt 0.5159
NM_182923.4 NCBI
AUUUUCGGCGGCGGGAGCGGCGCAGGCGGCCGAGCGGGACUGGCUGGGU… 2352 nt 0.5391
Showing 31 to 32 of 32 entries
Summary

Conventional kinesin is a tetrameric molecule composed of two heavy chains and two light chains, and transports various cargos along microtubules toward their plus ends. The heavy chains provide the motor activity, while the light chains bind to various cargos. This gene encodes a member of the kinesin light chain family. It associates with kinesin heavy chain through an N-terminal domain, and six tetratricopeptide repeat (TPR) motifs are thought to be involved in binding of cargos such as vesicles, mitochondria, and the Golgi complex. Thus, kinesin light chains function as adapter molecules and not motors per se. Although previously named "kinesin 2", this gene is not a member of the kinesin-2 / kinesin heavy chain subfamily of kinesin motor proteins. Extensive alternative splicing produces isoforms with different C-termini that are proposed to bind to different cargos; however, the full-length nature and/or biological validity of most of these variants have not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human keratinocytes and mouse skin demonstrated that X-ray irradiation (5 Gy) significantly downregulated the KLC1 (KNS2) with a 0.63-fold change at 3 hours post-exposure, as identified via cDNA microarray analysis [Koike et al. DOI:10.1269/jrr.46.173].