Basic Information
Symbol
KLF1
RNA class
mRNA
Alias
KLF Transcription Factor 1
EKLF
Erythroid Krueppel-Like Transcription Factor
Erythroid Kruppel-Like Factor
Krueppel-Like Factor 1
Kruppel Like Factor 1
Erythroid-Specific Transcription Factor EKLF
Kruppel-Like Factor 1 (Erythroid)
EKLF/KLF1
CDAN4A
CDAN4B
Location (GRCh38)
19:12884422-12887201
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_006563.5
Sequence length
1613.0 nt
GC content
0.6572
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-751.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-776.15 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
294.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGAGUUCACGAGGCAGCCGAGGAAGAGGAGGCUUGAGGCCCAGGGUGGG… | 1613 nt | 0.6572 |
Summary
This gene encodes a hematopoietic-specific transcription factor that induces high-level expression of adult beta-globin and other erythroid genes. The zinc-finger protein binds to the DNA sequence CCACACCCT found in the beta hemoglobin promoter. Heterozygous loss-of-function mutations in this gene result in the dominant In(Lu) blood phenotype. [provided by RefSeq, Oct 2009]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that the KLF1 was upregulated in common in splenocytes at day 7 post-injury following both burn and trauma-hemorrhage, where it was categorized as a gene expression marker within the antiapoptosis pathway [Lederer et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00086.2007].