Basic Information

Symbol
KLF10
RNA class
mRNA
Alias
KLF Transcription Factor 10 TIEG1 EGRA TIEG Transforming Growth Factor-Beta-Inducible Early Growth Response Protein 1 TGFB-Inducible Early Growth Response Protein 1 Krueppel-Like Factor 10 Kruppel Like Factor 10 EGR-Alpha Zinc Finger Transcription Factor TIEG TGFB Inducible Early Growth Response Early Growth Response Alpha Early Growth Response-Alpha TIEG-1
Location (GRCh38)
8:102648783-102655728
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference Sudden cardiac death diagnosis Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005655.4
Sequence length
2915.0 nt
GC content
0.4360

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-858.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -916.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 588.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001032282.4 NCBI
CAUUGGCGUCUUGGGGCUGUUACACACACGCGCGCUGUCCAUUGCAGCU… 3029 nt 0.4173
NM_005655.4 NCBI
GCAGACGGCGCUGAGCGCGGCGGCGGCGGGAGCGGCGUCGAGUGUCUCC… 2915 nt 0.4360
Summary

This gene encodes a member of a family of proteins that feature C2H2-type zinc finger domains. The encoded protein is a transcriptional repressor that acts as an effector of transforming growth factor beta signaling. Activity of this protein may inhibit the growth of cancers, particularly pancreatic cancer. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2013]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the KLF10 shows an up-regulated expression pattern after death and was used as a positive-coefficient predictor in a post-mortem interval (PMI) estimation model, which achieved a root mean square error of 4.75 hours [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z]. In domestic swine, research on myocardial infarction identified the KLF10 as being induced in the border and ischemic zones of the heart one day after injury, highlighting its role in the transcriptional response to ischemia [Kaikkonen et al. DOI:10.1161/CIRCGENETICS.117.001702]. A study in mice demonstrated that the KLF10 mRNA increased within 24 hours post-traumatic brain injury in the cortex [Dash et al. DOI:10.23/B:NERE.0000023614.30084.eb].