Basic Information

Symbol
KLF12
RNA class
mRNA
Alias
KLF Transcription Factor 12 AP2REP AP-2rep HSPC122 KLF12 Zinc Finger Transcriptional Repressor Transcriptional Repressor AP-2rep AP-2rep Transcription Factor Krueppel-Like Factor 12 Kruppel Like Factor 12 AP-2 Repressor
Location (GRCh38)
13:73686089-74134922
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001400136.1
Sequence length
11074.0 nt
GC content
0.3997

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2941.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3162.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2739.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((..((((((((((((..........)))))).))(((.((((((..((((...)))).......(((......)))((((((((((((((((.....(((..(((((((((..((((....(((((((((((((((((..(..(((((((.((((((((((((..((((((..(((((((((......)))))))))..))))))..))))(((((((.((((.((.....................((..(((.((...)).)))..)))))))).))))).)))))))))).)))))))..)....))))).))))))))))))...)))).)))))...)))).)))....(......)...)))))))))...)))))))......))).))))))......(((.((((((((.((.((((...(((((((((((..((((.....((.(((((((......))))))).)).))))...........................((((..((((.(((((..(((.(..((((((.(((((((((((.((((((......))))))..)))))...((((.......((((((.......(((......)))....((((((((.((((........)))).))))))))....(((((..((..........))...)))))........((((...))))((..((((......))))..)).)))))).)))).))))))...))))))..).))).....)))))...))))....))))..(((((((......(((((((((((..(((((..(((((((((((((.....(((((..((((((((.((.((((..(((((.......((..(((((((((((((.((((((((((((....((((.((((((..(((((((((((((((((...((.(((((......((((((.((........(((((.....((((.......))))..))))).(((((((......)))))))...)).))))))..(((((....)))))..(((((((((.(((....((.(.((.((.(((((((.....(((((((..(..(((((((((((.(((.....((....)).....))).))))..)))))))..)....)))))))))))))).)).)).).))...)))...)))))))))))))).))....)))))))...))..))))...))))..)))))))))))))))).(((((...........)))))..)))))))))).....((((((((((............)))))))..))).....))))))))).))......)))))..)))).((((((......)))))).........((.....)))).)))))))).((((((((((.........((((((...((((((((.((((....(((....)))........)))).)))))..)))....))))))(((((((((((((.......(((((((((((.(((.....))))))).(((((.(((........)))(((((....))))).))))))))))))......))))).))))))))(((((..((((((((((((...(((...)))....(((((.(((.....(((((...((((((((.........))))))))....))))).))))))))...)))))))))))).(((((....(((....)))..)))))......((((....)))))))))..((((.((.((.((((((((.....))))))))(((((((.((......)).))).))))(((((.....)))))....))..))))))(((.((((((((.(((((((.((.((.((((.(((.(....).))))))).)).)).).))))))((((((((((((((((...........)))))).))))))))))))))))))...)))(((((((.(((((((........))).))).)...))))))).......((((((........))))))))))))))))...................)))))......))))...)))))..........((..(((((.......)))))..)).........)))))))))..))))))))))).........(((((....(((((.........))))))))))...((.(((((((......((((............))))...)))))))))..))))))).....)))))).))))))))).))..)).)))))).)))...((((((((((.(((((((((((((((((..((((((.((.(((((.(((((((.((((((.(((((((.(((....))).))))))).)).))))......((((((..(((((.....)))))......)))))).((((((((((...(((((((((((((((.....)))..........((((..(((.(((......))).)))...))))(((((.....))))).))).))))))....))).....))))))))))(((....)))..((((((..........)))..)))...(((((((.((...((((((((((((((((.((((((.(((..(((((...((((((((...((((......((((((.((..((..((((((((((((((.((.....((((((.(((((((....(((...(((((...)))))...)))....)))))))....((((((((((((.........(((((..(((((....)))))..))))).))))))))).)))))))))....)).)))))).......))))))))..))..(((..(((((((((((((((((......)).))))))..(((.((((((((....)))))))).)))...........)))))))))......(((((.....)).)))...((((((((((((....)))))((((((((((((((.....(((........)))((..(((.((((((.((((((.(((((..(((((.(((((((........))))))).........((.((((((((......)))))))).))...((((.((((((..(((((((.((((((((((((.....((((((((((.((((...(((((((.(((.(((....((((((..(((......)))..((((((......))))))(((((((((((((((((((......)))))))...))))).)).)))))))))))......)))))))))))))...)))).)))).....((((((.......))))))((((((.......)))))))))))).....))))............))))))))))...(((((((((...((((.........((((..((((....)))).))))..((((((.(((........))).))))))...((((((..((((.(((.((((((.(((((..((((....((.(..((((...........))))..).))))))..))))).)))))).)))))))))))))............(((((.((....)).)))))..(((.((((((((..(((.((((.......((((((..........(((((.(((((((.((((((((..(((....((((......)))).)))((((((.(((.(((((.....((..((((((((((((((((((((.(((......(((..((((((((((...((((((.........((((.((((((.((.((((((((.(((.(((........)))((((((......))))))(((((((((((((((((((.((((((..(((........))).................((((.(.....).)))))))))))))))))).....))))).........))))))...)))))))))))..)).)))))).))))...(((.(((((.......))))).))).))))))..))))))))))..))))))))))......)))))))).((((((..........))))))..((((.(((....))).)))).))).))))).)).....))))).))))))))).)))))))).....((((((....((.(((((((....(((((((......)))))))))))))).))....)))))).........(((((.((.....((((((.....))))))..))))))).....((((....((.((.(((((.((((((.((((((((.(((.(((......)))..))).))))))..)))))....))).))))).)).))...))))......))))))).))))).....(((.(((.(((..............))).))).))).....(((((.((((..(((((((..((((((((...(((((.......)))))...))))))))...)).)))))......)))).)))))....)))))).(((.......)))((.(((.(((.((....(((....)))....)).))).))).)).....)))))))..)))))))).))).....((((((.......))))))))))))))))))).))))))))))).))))...............(((((...((....))))))))))))...)))))..)))))).)))))).)))..))..))))))))).)))))(((((((..((..(((..(((((...)))))..))).))..))))))).((.(.((((((.........((((((((((....((....))......(((.(.((.(((.(........).))).))...).)))..(((((((((((((((.(((((((......))))))))))).((((((((..((....)).....(((...(((.......)))...)))(((((((((.....(((((.(((((((...((((((((..(((.((((........))))........(((((((...))))))).....(((((..((((((((....))))))))))))).((((((((.(((((.(((((.....((((...((((...(((((((((....(((.......))).....(((((....))))).(((..(((((((((((.....((....))...((((((((........)))))))).((((((((..............((((((...)))))).(((((((.(((((((((((((..((((((((((..((((.((((...((((((((((((((((.(((((((((((((..................))).))))...))))))(((((((((((((((((..(((....((((((.((.(((...((((((....))))))(((.((((..((((((...(((((((...........((((((((((....((...((((......))))..))))))))))))....)))))))...)))))).)))).)))...((((((((.((((((.......((((((((......((((.......))))....)))))))))))))).).)))))))((((((.(....((((((((((((((.......)))))))).(((((....)))))......))))))).)))))).................(((((((((............((((((...((.....))...))))))..........((((...((((.(..(((((........)))))..)))))...)))).)))))))))..(((((........(((((((((((.....(((...((((((((((....))))))))))))).....)))).............(((((...(((((...)))))..)))))..........))))))).......)))))......(((....))).....))).))))))))......)))....)))).))))))).......((((((((((.......)).))))))))....((((((((.((((...((((((((((..(((((...............)))))....)))))))))))))).))).)))))))))))((((((......)))))).....))))))))))))))))..........(((((((((((((((((...((((...))))..))))))))....))))))))).((((((((((((((((.....))))))..))))).)).))).(((((.((..(((((((...))))))).)).))))).............(((..((((((((...)))))))).)))(((.....))).....(((((((.((...((.(((.(((((((((((((((.....)))))))))......))))))))).)).)).)))))))..(((((...)))))....))))))))..)))))))))).........))))))))))))).(((((..((....(((((.....(((......)))...)))))....))...)))))((((((((((.........))))).)))))...(((..(((((((........(((.(((((((.((.....))))))))).)))..........)))))))..)))..(((......))).((((.((((((((((..(((((((((((((....))))))..(((((..(((.((((((.(((.......))).))).(((((((((..............)))))))))...((((..........))))....))))))))))).........))))))).....((((...))))....(((((((..((..((((((((((..........(((............................))).........))))))))))..)).)))))))(((.....))).............)))))))))).))))................((....)).....))))))).))))))))..)))))))))))..)))...........)))))))))...))))...))))......))))).))))).......((((((((..(.......)..))))..))))..(((((.(((((((.(((((((((((((.....(.((((.....)))).).....))))))......((((.(((((((..((((((...((((...........(.(((((((((((..............(((..((..((((..((((((((((((((.((((....((((((...(((((....((((((((....(((......)))...))))))))......(((((...)))))..(((.(.(((...((((...(((((((((((((((........((((((((...((.(((((..(((((......)))))....(((.((((......)))).)))..((((.((...(((((((.(((...((((((...(((........((((.....))))...(((...(((((((((..................))).))))))....)))........((((((((((((((((...((((((.((((.........(((((..((.(((......))).))..)))))..((.(((((((..(((((((.(((((...((((........(((...(((((((.(((((...................)))))..((((((((..((((....(.((((((............((((...(((((..(((....)))))))).....))))((((((.((((....)))).))))))...........((((((((((.......((((((....))).))).....(((......(((((((..........)))))))......)))..((((.(((....).)).)))).))))))))))..)))))).)..))))....)))))))).............))))))))))....))))...))))))))))))..))))))).)).............((..((((.((((((..(....((..((((((.....))))))..))...)..)))))).))))..)).(((.....)))(((........))).))))))).)))...))))))))...........((((.....))))))))))))))).))))))...(((.(((..((((((.....))))))..))).)))......((((.((((((.((((((....((((((......(((.....(((...(((((((............(((((........)))))............))).))))...))).....)))))))))((.........))...)))))).)))))).)))).....(((((........)))))........))).))))))).)).))))......((((...))))......))))).))))))))))....(((((......))))).))).)))))))...((((....))))))))).))))...))).)))).......)))))....))))))....))))))))))))...(((((....(((((((..........)))))))....)))))......((((((.(((((((((...))))))))).))))))((((((.....((((((...(((.(((.(((((.(.(((.((((((...((......))....))))))))).).))..))).))).))).....)))))).......))))))(((..((((((.(((((.(((((......))))).)))))))))))..)))(((((((((((((.((((......((((((.(((.(((....))).)))))))))((.((((..(((....)))..))))..))..((((...)))).((((.......))))((((((((...(((((((......)))))))..(((((........((((((((((...(((((.......(((........))).(((((.......))))).((((......))))(((((.(((((...((((((((.......))))))))...)))))..)))))...(((((((..(.((((((...))).....))).)..))))))).))))).)))))))))).......)))))))))))))..........))))..))))))))))))).....))))))))))..))..))))))).))))))))..........))))...))))))..))))))).))))..))))))).)))).))).)))))...)))))))).....((((.((((((((.((((.(((...(((((((....................))))))).....(((((((((.......(((((((((((..((((((......(((((((((...))))))))).............)))))).(((((((((((.(((((..(((((....((.((((.......)))).)).)))))))))))))))))))))(((..((..((.......))..))..))).....((((((.((((....)))))))))).......)))))).)))))......)))))))))((((........))))........))).)))))))))))).))))............)))))))))))..)))))))((((((((...........))))))))...(((((........)))))(((.(((....))))))......((((((....)))))).....((((..((....))...)))))))))..)))))))))(((((((((.........(((.(((((.(((((.....((((..((((((((........)))).)))).)))).....))))).))))).))).........))).))))))............)))))))).(((((.......)))))....((..((((((.........)))))).))..))))))))))))))))))))).........((((.((......)).)))).(((((...))))))))))).).))((((....))))....((((((....((((...)))).....(((.(((((...)))))..))).((((((((....(((((.....)))))))))))))....))))))............(((((((((.((((((....)))))).)))))))))...)))))))(((((.........)))))...))))).))))))((((....))))..))))..)))))))).....)))))))).)))))).)))))))..............(((.(((..(((..((.....))..)))..))).)))..((((((((((((((((((((((((.....(((((((((.(((....)))..))))..)))))....))))))))))).(((((((((((((((((((.....)))).))))))))))...)))))...(((((((((((..((..(((((((.....)))))..))..))..)))))))))))..........((((...)))))))))).))))))).(((..((((((.(((.(((.....((((((......)))))).....))).))).))).)))..)))..)))))))))))))))))).)))))))))))).))..)))))).)))))).)))))))))))..((((((((..(((...((((((((....)))..)))))...))))))))))))))))))))).))))..))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,,.((((((((((((...,,...})).)),)))))))((((((({{{,...}}}}.......(({.....,)|}((((((((((((((((.....((({{(({{(((((..((((....(((((((((((((((((..{..(((((((.((((((((((((..((((((..(((((((((......)))))))))..))))))..))))(((((((.((((.((.,,...........,....{,{...{,,.||,..,}.)}).})})))))).))))).)))))))))).)))))))..}..,,})))).))))))))))))...)))).)))))..,)))).))},,..,......}...)))))))))...))))))),...........))))).}}..,{,.{(((,({{,(({{(((((...))))||}))),|,||,,...((.(((((((......))))))).)).,}}|,.,,,,{{,{((((..((((((.....{(((..((((.(((((..(((.(..((((((.(((((((((((.((((({......)))))}..)))),...,(((..,,,..((((((.......{{(......))}.,,,((((((((.((((........)))).))))))))....||,((.{(({,,...{{{.||...,,)),..,},...||||}}}),}|((.,((((......))))..)),)))))).))}}}))))))...))))))..}.))).....)))))...))))..,.)))}..(((((((......(((((((((((..(((((..(((((((...((((.....,{{{,.((((((((.{{.((((..(((((.......((..(((((((((((((.((((((((((((....((((.((((((..((((((((,{(((((((...((.(((((......((((((.({........(((((.....((((.......)))),,))))).{((((((......))))))}...}).))))))..(((((....))))).,(((((((((.(((....((.{.((.((.(((((((,,..,(((((((..(..(((((((((((.(((.....({....}).....))).)))),.}))))))..)....)))))))))))))).)).)).).))...)))...)))))))))))))).))....)))))))...,,..))))...))))..)))))))))))))))).(((((...........)))))..)))))))))).....(({(((((((..,......,..)))))))..})}.....))))))))).)},.....)))))..)))).((((((......)))))).........||.....,,,}.)))))))).{(((((((((.......,.((((((...{(((((((.((((..,.(((....)))....,.,.)))).)))))..}))....))))))({(((((((((((.......((((((((((,,(((.....))))))),(((((.(((........})}(((((....))))).,)))})))))))......))))))))))))))(((((..{(((((((((((...(((...)))....{((((,(({.....(((((...((((((((.........))))))))....))))).)))))}}}...)))))))))))).(((((....(((....)))..)))))..,,..{{{{....))))||||,..{|||,{{.{{.((((((((.....))))))))(((((((.((......)).))).))))(((((.....)))))....}},,}}}}))|,,.((((((((,(((((((.({.((,((({((((.{....}.)))))}),)).)).),}))))){((((((((((((((({........,.)))))).))))))))))))))))))...,||(((((((.((((((({,...,}.))).))).)...))))))).......((((((........)))))))))))))))}...........,|,..{(((((((((.......))}}))))))}...........,||||{....},.})))).}))}...)))}.,))))))))..))))))))))).........((((,...,(((((.........))))))))))...((,{((((((......((((............))))...)))))))))..))))))).,,.{(((.(((,...})))..)))}.)}.)))))},,)))))}}|||{||||(((((((((((((((((..((((((.((.{((((.(((((((,{({,(({({(((((.(((...||||.}}}}}||{||.|||||{|||,(({(((,.{((((..,.,})}})}|,...}}}}}}.((((((((((...{{{((((({{,{({{...,|||},.....,,,|||||..(((.(((......))).)))..,})))||{{,.....}},,,,|)}.)))))},||,,,,,}}..)))))))))){({,..,)))..|||||,},.,.,,,..,,|||}}}...(((((((,({,,.((((((((((((((((.((((((.((,.,(((({...,((((,{,,}}|,{,......{{,,(({((,,,,,,||,....{{{{(((,(({....{((((((((.(.,,..{((((...........)))))((((((((.....((((((..((({...,))),.))))))..{{(((..(((((....)))))..))))}.......{(((((((((((((((.(((...,,,.,,...,})...))).)))))))...)))}}})))}|{(((((.....,|}||}))),.,((({{(((((((,.,,}}}||||}.,)}||,{.|||}},,}.,}}}))}}....(((((,...,)).)))....{((......))))))))))){((((((((((({(,.,,,((,...,}}},}}}((..(((.((((((.((((((.(((((..(((((.(,(((({.,|{{.||||},|||........}||.((((((((......)))))))).,}...((((.((((((..((((({({{(,,,,||||.......{((({,((((.((((...((((((((((({(((....((((((..{{,......,,,..((((((......))))))(((((((((((((((((((......)))))))...))))).)).)))))))))))......)))))))))))))...)))).)))).....{(((((.......))))}|((((((.......)))))))))))}.,...||||....,,,.....})}}})))}}...{((((((((,..(({{,........{(((.,(({,,,,,||}|,|}||..{(((((.{{{....,,.,|||,|}||||..,((({{{{{((((.,{({,((,..{((((,.....,..})))}{({(((.{......{{,.{.{{({{{..|,.{{{,,|||{{{|,|{{|,,,||,||||,,..,,}}......||||.}||,.,,))}),,),..)))}}|||||.....}.))))}}......{(((((,.....,,,.(((((.(((((((.((((((((..(((....((((......)))).)))((((((.(((.(((((.....({..((((((((((((((((((((.((({,,...,||,.((((((((((...((((((.......{.((((.((((((.((.((((((((.(((.,((,..{{,{,|},{(((((......)))))){{((({(((((((((((({,((((((..(((........))).,...,{......,...((((.{.....}})))))))))))))))))).....))))).,,,,,}},})))}}...)))))))))))..)).)))))).)))).,.(((.(((((.......))))).))).))))))..))))))))))..,}}))))))),.....}))))))){((((((..,....,..))))))}.((((.(((,...,)),)))).))).))))).)).....))))).))))))))).)}})))}}.,||||{|||{....,,.{{|||||,,,.((((((((,,...,})))))),}))))}}|||||}||||{,{{{,,,..(((((..,,,...((((((.....))))))..}})))))...,}}|{|||||((.(({...,}}}.}}..}}}{(((((.,,,.(((......)))..}}),))))))||,|.(((((((((({.......)))}}})))))).,.,))))))).)))))..,{{(((.(((.(({....,,...}}...))).))).))}..,,.(((((.((((..(((((((..((((((((...(((((.......)))))...)))))))).,.)).)))))......)))).)))))....}}}}}},|||.....},}},,|,,,..,|,,|,||}}}||}}}}||{,,...,.}}|}})).}}}}}}.}}}},,,,}},}}}}}}}}}}..}},|||||{..,....))}}})))))))))))))}.))))))))))).}}))}}.,,,}|}},....,,..{,,,{,.,.})))),),)))))...)))))..)))))).)))))).)))..))..))))))))).))))}((((((((....))))))}((({...))))},,.}.)))))))))....||}|}||.,,,,||,,|,.|(({,,,,{,|,,,.||.,||||{,,,,,,.,,|,,,.,{,,{{,.....,|{||||||{{,,.|||{.(((((((((((((({{(((((((......))))))))))),((((((((..,,....|,.....(((...(((.......)))...))){((((((((.{,..{((({.{((((((...((((((((,.{((.((((.....,,,}}}}........(((((({...}))))))(((((((((...,(((((((....)))))))|{{{{..((((((((.(((((.{((((,....((((...((((...(((((((((...,(((...,...}}}..,,.(({{{,...}))}}.,{{..(((((((((((,....((....)){((((((((((........))))))}})))}.,,...........,....{((((({{.|||,,..{((((({.{((((((((((((,,((((((((((..(({{{((((...((((((((((((({{((({.,(((((((,.({{{{{{{....,,..,,.,,.,}.....,}})}}}}|,{|||{((({{({{..,,....,{{,.,,,,{{||||,.((((((....}}))))(((.{(({..(((((,|||(((((((,..,.,,,.,,{(((((((((,.,,((...{(((.....,|}}},.|||})}))}))}....}))))),.}})))))).}))).))}...(((((((,.((((((.......{(((((((..,...((((.......))))....)))))))))))))).}.)))))))((({((,(....((((((((((((((.......)))))))}.{(({{....}}}}}..,,,.)))))),,))))))........{{.....,,{((((((((........,,,,((((((,..{{....,))...))))))..,,,,....((((...((({,(..(((((........)))))..))))).,.)))).))))))))}.,,},,.}},,}}}}|||{(((((,,.....(((...((((((((({....}))))))))))}},,...})))}}...........((({{,..{{(({...}}}))..})))).,......,}))))|,|,{...{(((((({..{{.(((....))).,,..)))))))}..,|||,,,|||,,...},,|||||{{|,,,,,...||||||||{{......,)).)}))}))),.},||||||||,||,{{{.((((((((((..(((((.....,.........)))))....))))))))))...)}},}.}}}},..,,||{((({{..,,,,))}}}},.,))))))))))))))))))....,,{.(((((((,,,{||||||,|}},({((.,,||||,,|}}}||||,,,,}}})))))}.,|||{(((((((((((,...,)))))}.,))))).}},.}}.{{(((.{{..(((((((...))))))).}}.}}}}}....,......,,|{{..((((((((...)))))))).}}}({(.....))).....(((((((.((.,.((,{{.,{(((({(((((((((.....)))))))))..,,,.))))))))).)).}).))))))),.{((({...))))}.,..))))))))..))))))))))..,,.....))))))))))))}.{((({..((.,..(((({...,,|{{......)))...||}}}....,),,,)}}}|((((((((((.........)))))})))}....(((..(((((((....{(({(((.((((((,,((.....))))))))).)))))}.......)))))))..))}..{(({,,...,},.((((.((((((((((.,(((((((((((((....))))))..(((({..,,,.{{{{{{,(((,,,,,.,|}}.})).(((((((((...,..........)))))))))...{{{{.,....,||,|}}}..,,))),))))))),,.......))))))}.....{{{,...|}}}..{,(((((((..((..((((((((({............,.........,.|,....,,.|,,.....))).......,,))))))))))..)).}))))))(((.....)))..........,},)))))))))}.)))}.,......,,,,,...||....,,.....))))))).))),)))))})))))))))))..}}},..........)))))))))...))))...))))......))))).))))}.......((((((((..(.......}..)))}.,))))..(((((.((({(((,(((((((((((((.....(.((((.....)))).).....)))))}......((((.(((((((..((((((((,{(((...........,.(((((((((((.......,{{,...,,(((({.,{{{,..,.(((((({(((((((((,..{{{(,,{({{{(,,,{{,..,((({{{{.,,,,||,...,,})},.,||}|}}|,......||{||,..,}}}}..(((.{.(((.,.((((...{((((((((((((((,,{{{,..((((((((...((.(((((..(((((......)))))....(((.((((......)))).)))..((((.((...(((((((.(((...(({{{{.,.{{{........((((.....))))...{{(,..{((((((((..................))).)))))),,..,||,,......{{{{{{{|((((((({...{(((((.{(((,.....,..{{{((.,((.(((......}}},}|..||}}}..((.(((((((..(((((((.(((((...((({....,,{,,,,..|||||(({,(((((,...,{.............}|}}}..{({{{((({.((((....(,(((({,....,,,.....((((...(((((,.,({...,}})))))).....))))((((((.((((....)))).))))))......,,,{,{(((((((({.......((((((....)))},}},,,,.{{{......(((((((..........)))))))......))),}|(((.(({....}.)).))),.})))))))))},}}}))).}..)))),,,.,}})))))...|},,..},.)))))...))))}..})))...))))))))))))..))))))).)).............{{,.((((.((((((..,....((..((((((,....))))))..))...}..)))))).)))){{((.(((.....))))||}.,,,|,...,.)))}))).))}...)))))))),,,........{{((.....)))})}))))})))),}}}}}}...{{{.{{|..{{{{(|,,.,.)))))}..}}).))}..,,,.((((.((((((.((((((....((((((......(((.....(((...(((((({.,..........(((((........)))))...........,))).))))...))).....)))))))))|,.........,,...)))))).)))))).)))),,}}.{((((........)))))........))).))))))).)).)))}......((({...})))......))))).)))))))))).,}}}||,........)),..))).)))))))...((((....))))))))).))))...))).))))........})))}})})))))),.}))))),}},.,||{..(((((....(((((({.,......,.}))))))..,,})))},,|,,.((((((.(((((((((...})))))))).)))))){{{(((,,...{{{{{{.,.{{{.{||,||{{|,|.{||.{(((((..,({......,.....}}}}}))),.}.},,,||}|))},}}}||.,,|}}}}},,,||,.}}}}}}{{{..((((((((((((.(((((......))))).))))))))))).,}}}{((((((((((({.{{{,.,,,|,((((({{(((.(({....})).)))))})))||,{(((..(((....)))..)))}.,},..{(({...}))}.((((.......))))((((((((...((((((({....,)))))))..{((((........((((((((((...(((({.......{{(,,,{,...,}),}|||,.......,},,,.{((|......}}}}(((({{(((((...((((((((.......))))))))...)))))}.})))),,.((({{{{..|,||||{{.,,},},...,|},.,..)))}))).))))).)))))))))).......))))}))))))))......,,..}))),,))))))))))))),,,}})},}.}))))..,,.}))))))).)))))))}..........)))))))))))))..))))))).)))).,))))))).)))).})),)))))...)))))))).})}}{(((,,,,{{.{,.,.,..,}},,})}}|...............}}}})))))||||||.,|,,,||||,.,}}}....,||,}||||||,..{{{||{{{{{..(((((((((,,.|}}}}}}}|......,,,,..,|.,|||,((((((((((,{(((((..(((((....((.((((.......)))).)).))))))))))))))))))))),{{..{{..||,,.,.,})},.|}..}))},...((((((.((((....)))))))))).,|},|||,{{{||||{{{{|.{{{{|||,,,,.||}|,,.}}}}))))),.,,...,,|}|)))}}}|}||}|,}}},,,}},.......)))))))))))..))))))|((((((((.......,...)))))))),..{((((........))))}(((.{{{....}},)))......((((((....)))))).,,|,||||..||....||.,,|,,,))))),}))))))))|(((((((((.........((,.(((((.{((((.....((((.({{((((((........)))).)))).)))).....))))).))))).})).........))).))))))...,,.......)))))))).{{(((.......))}}}..,{(,..((((((.........)))))).)),.})))))))))).)))),,,,}....,||||{{({.{{|....,}}.}}|},|{||,.|{|||}}},)}}},}|},||||},,,))}}.},.{{((((,,,,({{,....,,}.,...,{{.(((((...)))))..}}}.((((((({...,(((((.....)))))))))))))....}}}}||,....,,,....(((((((((.((((((....)))))).)))))))))..},}}))}}}|}}|}}}}},,..}))))...||..,,|||}}}||||}}..})),.,))))..)))))))),....}))))))).)))))).)))))))....,,.,,,,.,.(((.{{{,.{{{..{(,....}}..}))..,},.,,,..|||||{|||{{{||{{{{{{{({{,,,,{{((({{,{{{(((,,.{|}}|,||||..}},,},..,))))}}))))),|{{{{{((((((({(((((.....))))},))))))))),.,))))}...(((((((((((..(,..{,(((((.....)))))..,}..))..)))))))))))..,{{....,{{{{...}}}))|)))}.||||,,,.{{|,,{|||||,{((,(({.....((((((......)))))).....})}.))).})).))}..)))..))))))))))}))))))).)))))))})))).))..)))))).)))))).)))))))))))..((((((((..(((...(((((({(....}}}..)))))...))))))))))).,,,,,,,,..,,})}..)},,},,,.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001400136.1 NCBI
ACACUCAGAGCCCGCCUCCUAAUCCUCGGGCGGAGCGGCUCGGGGGCCC… 11074 nt 0.3997
NM_001400139.1 NCBI
GUGUUUCAGCACCGACUAUGUGGUCACCGGGUAUCAUGCCUGAGAGCUA… 10691 nt 0.3886
NM_001400141.1 NCBI
ACCUGACUUCACCGUGGGACUAGCUGAUCGACUUGAAGCACAAAUGGGG… 10757 nt 0.3888
NM_001400146.1 NCBI
AUUCAUUUCCUGAGAACUGCAGAGAGCCGCUGAGAGGCUCUGCGUGUGC… 10917 nt 0.3914
NM_001400147.1 NCBI
ACACUCAGAGCCCGCCUCCUAAUCCUCGGGCGGAGCGGCUCGGGGGCCC… 11010 nt 0.4003
NM_001400148.1 NCBI
AUUCAUUUCCUGAGAACUGCAGAGAGCCGCUGAGAGGCUCUGCGUGUGC… 10768 nt 0.3916
NM_001400149.1 NCBI
ACACUCAGAGCCCGCCUCCUAAUCCUCGGGCGGAGCGGCUCGGGGGCCC… 11011 nt 0.3992
NM_001400150.1 NCBI
ACACUCAGAGCCCGCCUCCUAAUCCUCGGGCGGAGCGGCUCGGGGGCCC… 10984 nt 0.3995
NM_001400151.1 NCBI
AUUCAUUUCCUGAGAACUGCAGAGAGCCGCUGAGAGGCUCUGCGUGUGC… 10742 nt 0.3908
NM_001400152.1 NCBI
AUUCAUUUCCUGAGAACUGCAGAGAGCCGCUGAGAGGCUCUGCGUGUGC… 10674 nt 0.3900
Showing 1 to 10 of 12 entries
Summary

Activator protein-2 alpha (AP-2 alpha) is a developmentally-regulated transcription factor and important regulator of gene expression during vertebrate development and carcinogenesis. The protein encoded by this gene is a member of the Kruppel-like zinc finger protein family and can repress expression of the AP-2 alpha gene by binding to a specific site in the AP-2 alpha gene promoter. Repression by the encoded protein requires binding with a corepressor, CtBP1. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.