Basic Information

Symbol
KLF4
RNA class
mRNA
Alias
KLF Transcription Factor 4 GKLF EZF Epithelial Zinc Finger Protein EZF Gut-Enriched Krueppel-Like Factor Kruppel-Like Factor 4 (Gut) Gut Kruppel-Like Factor Krueppel-Like Factor 4 Kruppel Like Factor 4 Endothelial Kruppel-Like Zinc Finger Protein
Location (GRCh38)
9:107484852-107490482
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Sudden death from CNS diseases
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004235.6
Sequence length
2936.0 nt
GC content
0.5589

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1094.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1142.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 764.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001314052.2 NCBI
GGCAGUUUCCCGACCAGAGAGAACGAACGUGUCUGCGGGCGCGCGGGGA… 3038 nt 0.5616
NM_004235.6 NCBI
GGCAGUUUCCCGACCAGAGAGAACGAACGUGUCUGCGGGCGCGCGGGGA… 2936 nt 0.5589
Summary

This gene encodes a protein that belongs to the Kruppel family of transcription factors. The encoded zinc finger protein is required for normal development of the barrier function of skin. The encoded protein is thought to control the G1-to-S transition of the cell cycle following DNA damage by mediating the tumor suppressor gene p53. Mice lacking this gene have a normal appearance but lose weight rapidly, and die shortly after birth due to fluid evaporation resulting from compromised epidermal barrier function. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Sep 2015] CIViC Summary for KLF4 Gene

Forensic Context

A study in domestic swine demonstrated that the KLF4 was induced in border and ischemic zones of the heart after myocardial infarction, with its transcriptional response to ischemia being a central regulator of enhancer activity [Kaikkonen et al. DOI:10.1161/CIRCGENETICS.117.001702]. In C57BL/6 mice with traumatic spinal cord injury, the KLF4 was upregulated and verified as a target of miR-135b-5p within a circAbca1/miR-135b-5p/KLF4 regulatory axis, where its expression may inhibit axon regeneration [Wang et al. DOI:10.4103/1673-5374.308100].