Basic Information

Symbol
KLF7
RNA class
mRNA
Alias
KLF Transcription Factor 7 UKLF Kruppel-Like Factor 7 (Ubiquitous) Ubiquitous Kruppel-Like Factor Krueppel-Like Factor 7 Kruppel Like Factor 7 Ubiquitous Kruppel-Like Transcription Factor Ubiquitous Krueppel-Like Factor
Location (GRCh38)
2:207074137-207173856
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003709.4
Sequence length
8365.0 nt
GC content
0.4381

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2433.41 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2593.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2146.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001270942.1 NCBI
AUUGUGUGGCACUUCCUCCUCAGGCGCUUCUUCUCUGCACCCUGGCAGC… 8021 nt 0.4339
NM_001270943.2 NCBI
AGAUGUAACAGAUCUCUCUAUGUCUACAUCCCAACUCCAGAAAACGAGA… 7990 nt 0.4335
NM_001270944.2 NCBI
AGCCUGUGCAAGUGAUUUGGGAGAGGAAGGGGAGAUGAUGUAACUGGUU… 7954 nt 0.4336
NM_003709.4 NCBI
AACAGCGCUGCAGAAAUAGAUGGCAGCUUCGUGUCAGUGAGUUUGCAUC… 8365 nt 0.4381
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the Kruppel-like transcriptional regulator family. Members in this family regulate cell proliferation, differentiation and survival and contain three C2H2 zinc fingers at the C-terminus that mediate binding to GC-rich sites. This protein may contribute to the progression of type 2 diabetes by inhibiting insulin expression and secretion in pancreatic beta-cells and by deregulating adipocytokine secretion in adipocytes. A pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome 3. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2012]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the KLF7 as a shared upregulated differentially expressed gene between rhesus and adult human hypertrophic cardiomyopathy, demonstrating its association with the disease [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].