Basic Information

Symbol
KLF9
RNA class
mRNA
Alias
KLF Transcription Factor 9 BTEB1 Basic Transcription Element-Binding Protein 1 Transcription Factor BTEB1 GC-Box-Binding Protein 1 Krueppel-Like Factor 9 Kruppel Like Factor 9 BTE-Binding Protein 1 BTEB Basic Transcription Element Binding Protein 1
Location (GRCh38)
9:70384604-70414657
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001206.4
Sequence length
5201.0 nt
GC content
0.4624

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1687.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1788.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1247.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001206.4 NCBI
CUUACUCAUUUGUGUUUAUUCUUGGACUUAUCCUGACAUAAUGGGGUUU… 5201 nt 0.4624
Summary

The protein encoded by this gene is a transcription factor that binds to GC box elements located in the promoter. Binding of the encoded protein to a single GC box inhibits mRNA expression while binding to tandemly repeated GC box elements activates transcription. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly upregulated the transcription factor Klf9 in oligodendrocytes, revealing its role as a key dysregulated transcriptional regulator within glial cells during methamphetamine-induced neurotoxicity [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].