Basic Information

Symbol
KLHL1
RNA class
mRNA
Alias
Kelch Like Family Member 1 Kelch-Like Protein 1 KIAA1490 MRP2 Mayven-Related Protein 2 FLJ30047 Kelch (Drosophila)-Like 1 Kelch-Like 1 (Drosophila)
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_020866.3
Sequence length
4105.0 nt
GC content
0.4580

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1280.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1357.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 877.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((..........))))))))))((((((........(((.........).))(((((((((....................((((((((((....(((((.(((((((.(((.(((((((....).))))))))).))).((((((((....((.((((((.((((((..(((((((..(((((((((((.((.......(.((((.((..(((((.(((((.....(((..((((((((((..(((.(((((((...(((........))))))).))).))).))))..))).)))((((.......)))).))).....))))).))))).)).)))).)...)).)))).)))((((((((....)))))).))...((((((((((((((((((((...(((((....)))))((((((((..((((.(((((((((.(.((.(.((((...(((((...((((((.((((.(((((((....((....))....((((((..(((....)))..)))))).))).))))))))....))))))...(((((.((((((((...(((..........))).))))))))))))).((((.(((((.(((....))).))))))).))(((((.((.....)))))))))))).)))))))))))))).)))((((((.((((((..((((((((.((.((.....(((((((.(((((((((((....((((.....))))....((((.((((((((.....)))((((((...))))))..(((((((.(((((....(((((((((((....((((((((.((((....)))).))))))))((((((((...)))).)))).))))).(((...)))..)))))).)))))..)))))))..)))))..)))).((((.((((.((.(.(((..((((......))))..)))).)).))))))))((((((((((..((((((((((..(((.(.(((((((..((..((..((((.(((((((....((.(((....))).))))).))))..((((((....(((........)))..))))))((((((((((.(((....)))))))))).)))(((((.(((((.(......).)))))))))).......((((((((((((((...........))))))))))....)))).))))..))...))))))))).).)))....(((((........))))).(((((...(((......)))..))))).(((((((((.(((..((((((...((((((.((((((...(((((......)))))...))))))..(((......))).((((...((((.....(((.(((........))))))..))))....)))).....))))))....)))))).((((((.....(((((((((....((((((((.....)))))))))))..))))))))))))......(((.(((((........))))).))).((((...))))............)))))))).)))).....))))))))...........(((((((.(((((((((..(((((((((((.......((((((((.((((((((((((((..((((..(((((.(((((((......((((..(((........)))..))))........)))))))..))))).)))))))))))....))).))))...(((..((((..(((..(((((((....(((..(((((...((((((......))))))......)))))..)))....))))))).))))))))))....(((((.....)))))((((((((.((..(((..((((....))))..)))..)).))))).))).....((((.((.(((((......)))))..))...)))))))))))).......)))))).(((((..((((.((..(((((.(((....))).)))))......)))))))))))..((((((..........)))))).....))))).))....(((((((((((((........................)))).)))))))))))))))).))))).))...........(((.(((((.((.((((.........))))))........))))).))).))..))))))))))..)))))))))))))))))))).))))))((((((..((((...((((........)))))))).)))))).....((((((.(((...))).))))))..............((((((.....)))))).......(((((........)))))))))))))))..((((((..((((.......)))))))))))))))).((.((((((....))))))))......))))..))))))))......(((....((((.((((((((....))).))))).)))))))((((((((((((......))))..((((((........))))))((..(((((((((((....(((((...(((....))).)))))))))))).))))..))................)))))))).))))))..)))).))))))).)))..((((((((((.((((............((.((((((((.........)))))))).))..)))))))....)))))))(((((((((......)))))))))...........))))..))....)))))..)))))).)))))).))....))))))))(((((((........)))))))..(((((((((.((.......)).))))).)))).(((((......((((.((..((..((((..........))))...))...)).)))).......))))))))).)))))....))).)))))))(((((....)))))......)))))))))((((((.((.(((((.((.(((((((..((((((((............))))))))..)).))))).))))))).)).))))))...((((((...(((((.(((..((((((((.........)))))))).....(((((.((((.(..((((((....................((((((((...(((((((((((.....(((((((((.((((.(((((((((((((((((((......)))))).)))..)))))))))).))))......))))))))).....(((((((((((((((..(((((.((((((....))))))..)))))............((((.((.(((.(((((((.((...)).)))))))))).)).))))((((.((((((....)).)))))))))))))))).(((((((((((((....(((..(((((.((((((((((((....((.................))))))))......)))))..).)))))..))))))))))))))))...(((((.(((((.(..(((((((((.............................((((((....))))))(((((((..........)))))))...((((((((.....((.....))....)))))))).(((((((.(((.(((...(((((............(((((((((..((.((((((((....)))))(((....))).))).))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))..).)))))......))))).....))))))).....((((((....)))))).......((((....)))))))))))).((((......))))(.(..(((((...(((((........)))))...)))))..).)...)))))))))))...)))))).))))).))))).............((((.(((((...........)))))..)))).))).)))))....)))))).......)))))).((((((((((.((((...........))))...))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{.((((((((.,.......}))))))))}}((((({.{({(..{((..........)}}..||||.{(({{{,...{{{{{{{{{,..,{({(((((({....({{({.{{,((((.(((.(((((({....}.))))))))).)))}((((((((....((.((((((.((((((..(((((((..(((((((((((.((,,,,...,.{(((.((..(((((.(((({...,|{{,..((((((((((,.(((.(((((((..,(({........)}})))).))).))).))))..))).))},{{|........,|||,,,},,..})))).))))).)).)))),)...)).)))).)))((((((({....}))))).)),{.((((((((((((((((((((...(((((....)))))((((((((..((((.((((((((({{.{(.(.((((...(((((...((((((.{(((.(((((((.{,{({....||....||{{{{.{(((,...})),})))))}.))).)))))))}....))))))...{{((((({{{||||,..((({,,..{{,..,}}.,)))})))))))}.((((.(((((.(((....))).))))))).))((((((((.....)))))))))))).)))))))))))))).)))((((((.((((({..((((((((.((.((.....(((((({{(((((((((((...,((((.....)))),...((((.((((((,......}}|{{{{({..,))))}}..(((((((.(((((....((({{{(((((..,,((((((((.((((....)))).))))))))||((((((...)))).)))).))))).(((...}))..})))}}.)))))..))))))).,)))))..)))).((((.((((.((.{.{{{,.|{{{|,,,,||}}}.}))}).)).)))))))|((((((((((..((((((((((..(((.(.(((((((.,({{.((..((((.(((((({.,{{(,.(((.,..}||.},}))..}))}},{||||||,}||{.....,.,|||,|||,}},{(((((((((.(((....)))))))))))}}}(((((.(((((.(......}.))))))))))........{|||||||{||||..,.,,,,...}}})))))||....,))}.))))..)).}.))))))))).).)))....(((((........))))).{((((,.,({{......))},,))))}.(((((((((.(((..({{{{{...{{((((.((((((...(((({......}))))...)))))).}}}}...|||||{{({(({{,{{{({{{.,{{{.(((,,....||}}}},}},},}},...}}}),,,,}))})))}},,)})))).((((((.....(((((((((....((((((({.....)))))))))))..)))))))))))),....{(((.(((({.{..,,|,}}}},.}})}||{{...))))...,,,......))))))))}}))).....))))))))....,{{....(((((((.((((((({{,.,((((((((((,,,,,..{{{||||||((((((((((((((..((((..(((((.(((((((...,,.((((..(((........)))..)))).},.....)))))))..))))).)))))))))))...,))).)))}.{((.....}}}.,((({,(({.((({.......((((,...}}}}|||....))))}})),}}}},....,.,{{{,.{,|||||,|,{{{{{{{|,..{,.(((((.....)))))||{||||||||..((({{((((.,,,|}}|.,|||..|}.,}))),.}}...,,,|||}{{.{(((|......)))))..))||.|}}))}}}}}}).,....,)))))}.{{|||..,{{{|||.,,,,,...,,,}},|||{|{|,|||,...,,)))))))))}.|||{||,.....,,)}.))))),,,,|||,,,..},,,.(((((((((((((........................)))),,))))))))))))))).))))).)).,..},.....(({.(((({.,,.{{{{.......,,|}||||......}}))))).))).))..)))))))))),.)))))))))))))))))))).))))))((((((..((((...((((........)))))))).)))))).....((((((.(((...))).))))))..............((((((.....))))))....,,.(((((........)))))))))})))))..((((((..{(((.......)))})))))))))))).{{.((((((....))))))}}......))))..))))))))......(((....{(({.((((((((....))).))))).}))))))(((((((({{((......}})),{((((({.{,...,}))))))||..(((((((((((,...{((((...{{{....))}.)))))))))))).))))..}|......,},...},..)))))))).))))))..)))).))))))).))).}(((((((....{.(({{({........((.((((((((.........)))))))).)),,..)))))}.,.)))))))(((((((((......)))))))))...........))))..))....)))))..)))))).)))))).))....))))))))(((((((........)))))))..{{{{{{{{{.({.|.,,,.}},))))),)}},.{,{((,.,{{,((((,((,.{{..((((..........)))).,,||...}|,||||,......,,))))))),}}))}.,}})))}}}}||||{((((....})))}.....,||}.,,,,.((((((.((.(((((.({.(((((((..((((((((.{,,...,,,..))))))))..))}})))),},))))).)).))))))...,}}|||,|||||||.|||.,||||{|,||||||}}}}}..,}}}}}),..|||{,.||||}}}.|||{{{...................,((((((((...(((((((((((.....(((((((((.((((.(((((((((((((((((((......)))))).)))..)))))))))).))))......}))))))))..,,.(((((((((((((((..(((((.((((((....))))))..)))))............{(({.((.(((.(((((((.((...)).)))))))))).)).}))}((({,{{{{{{....)}.}}}})))))))))))).(((((((((((((....(((..(((((.{(((((((((((....({.................)}))))))......))))}..}.)))))..))))))))))))))))...(((((.(((((.,..(((((((((...,..,.|{.,,..........,.....((((((....))))))(((((((,{.....,}.)))))))...{(((((((.....{(.....}}....)))))))).(((((({{(((.(((...{((((............((((((((({{(,.{{{((({{....}}}}}(((....))),,}}.))}.))))))))))))))))))))))))))))))))))))..}.))))}...,..))))).....))))))).,|,.{(((((....}))))}.......{(((....)))})))))))).((((......)))){.(..(((((...(((((........)))))...)))))..).}...)))))))))))...}}}))),}},}).)))))....,,,.,{{{{,,(({(,,,({(({,,{{{{..,||,..}),,}}}}|}}}}}..)))).)}}},..,,.)))))).{(((((((((........,,....,.)}.....)))))))))}

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUACUGUGAGGACCUUGACAGCUUCACAGGCGGGCUUUUUCUUUUGCCU… 3922 nt 0.4595
GUACUGUGAGGACCUUGACAGCUUCACAGGCGGGCUUUUUCUUUUGCCU… 4105 nt 0.4580
Summary

The KLHL1 protein belongs to a family of actin-organizing proteins related to Drosophila Kelch (Nemes et al., 2000 [PubMed 10888605]).[supplied by OMIM, Feb 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.