Basic Information

Symbol
ANXA7
RNA class
mRNA
Alias
Annexin A7 ANX7 Annexin VII Annexin-7 SNX SYNEXIN Synexin
Location (GRCh38)
10:73375101-73414731
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001156.5
Sequence length
2443.0 nt
GC content
0.4265

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-672.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -722.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 659.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001156.5 NCBI
AUCUUGCGGGAGACCGGGUUGGGCUGUGACGCUGCUGCUGGGGUCAGAA… 2443 nt 0.4265
NM_001320879.2 NCBI
AUCUUGCGGGAGACCGGGUUGGGCUGUGACGCUGCUGCUGGGGUCAGCC… 2388 nt 0.4242
NM_001320880.2 NCBI
AUCUUGCGGGAGACCGGGUUGGGCUGUGACGCUGCUGCUGGGGUCAGCC… 2454 nt 0.4218
NM_004034.4 NCBI
AUCUUGCGGGAGACCGGGUUGGGCUGUGACGCUGCUGCUGGGGUCAGAA… 2509 nt 0.4241
Summary

Annexin VII is a member of the annexin family of calcium-dependent phospholipid binding proteins.The Annexin VII gene contains 14 exons and spans approximately 34 kb of DNA. An alternatively spliced cassette exon results in two mRNA transcripts of 2.0 and 2.4 kb which are predicted to generate two protein isoforms differing in their N-terminal domain. The alternative splicing event is tissue specific and the mRNA containing the cassette exon is prevalent in brain, heart and skeletal muscle. The transcripts also differ in their 3'-non coding regions by the use of two alternative poly(A) signals. Annexin VII encodes a protein with a molecular weight of approximately 51 kDa with a unique, highly hydrophobic N-terminal domain of 167 amino acids and a conserved C-terminal region of 299 amino acids. The latter domain is composed of alternating hydrophobic and hydrophilic segments. Structural analysis of the protein suggests that Annexin VII is a membrane binding protein with diverse properties, including voltage-sensitive calcium channel activity, ion selectivity and membrane fusion. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans analyzing pericontusional brain tissue from traumatic brain injury (TBI) patients via cDNA microarray identified the ANXA7 as differentially expressed, specifically showing a 15% down-regulation in patient T6, categorizing it among adhesion factors and contact recognition molecules [Michael et al. DOI:10.1016/j.jocn.2004.11.003].