Basic Information

Symbol
KLHL29
RNA class
mRNA
Alias
Kelch Like Family Member 29 KIAA1921 KBTBD9 Kelch Repeat And BTB Domain-Containing Protein 9 Kelch Repeat And BTB (POZ) Domain Containing 9 Kelch-Like Protein 29 Kelch-Like 29 (Drosophila) Kelch-Like 29
Location (GRCh38)
2:23385179-23708611
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_052920.2
Sequence length
5325.0 nt
GC content
0.5808

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2136.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2218.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1388.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((.((((.((((((((......((((......))))((.((.(((((.((((........)))).))))).))))...((((....)))).(((((((((.(((((.((((((((((.(((..(((((.(((((..(((.....((((((.(.(((.((...((((..((((((((((....(((((((((((.((((((.((........)).))).)))...))))))).))))....))))))))))..))))))))).)))))))((((((((((((((((..((..(((((((......)))...(((((.....))))).((((.((((...(((............)))...)))).))))))))..)).)))))))))))))))).((.(.((((((...((..(((((..(((((.(((.....((.(((((((.(((......))).)))))))))(((.((.....(((((.........))))).....)))))))).)))))))))).))...)))))).).)).....)))....)))))...))))).))))))))))))).))))).))).((((((.....)))))).(((((.((((((((((((((....))))))(.(((((....((((((((.(((..((.((((....)))).))..)))(((((.(((((........)))))..)))))...........))))))))(((((....)))))..((((((((.((((..(((..((......))....))))))))))))))).))))).)...)))))))).))))).(((.(((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(.(((.((.((...........))))))).)))))))))).((.((((((.(((((((((....))..(((......)))...(((....)))....))))))).)))))).))((..(((((.((.(((....)))..(((((((((.((((((((.......((.(((((((.(((((...)))))((((..(((((((((..((((..(((.(....).)))((((....))))........).)))..)))))))))))))....(((((((((((......)).)))...(((...((((((((.....))).)))))...))))))))).))))))).))........(((...((.((((((...)))))))).))).......(((((((((((((((.((...)))))...))))((.((((((((.((((((((.(((.((((((((((((((((((((....)))).((((((((((((((..(((..(((((..((.......))..))))).)))))))))))).(((.((((....))))..)))..(((.((((.((((.(((((.((.(.((((.((((((......)))))))))).))).))))).......)))).))))...)))....)))))))))))).)).(((.......((((.(((.........(((((((......)))))))...((((..((..((((((...............))))))..))..))))..)))))))......)))))))))).)))))))...........)))))))))))).))...))))))))...)).))).))))))))))))..............((((((.....(((((((.((((..((.((.(((((((.........((((((((((((((...(((((((.....((((((.......))))))))))))).)))(((((.....)))))...)))))))))))..(((.((((.........)))))))(((((((((.(((((..(((((((((....))))))))).(((((........)))))((((..((((..(((.(((((.(...(((........)))...).))))).)))..))))))))...(((....)))..((((((((.((((((((..(((....)))))))))))..((((..(((((((..(((.((....)).)))..)))))))..)))).))).))))).(((((((.((..(((....)))..)).)))))))..))))).)))).))))))))))))..))))..)))).)))))))(((((........)))))((((((.(((((.((......))))))).((((((((...((((.((((((((.........)).)))))....).)))).....)))))))).((((((.(((.(((..(((((((.(.....).)))))))(((.(((((((((......(((((.(((((...(((((...)))))...(((((((((..(.((((((.((.((....(((.((((((((((.(((.((((((((.(((((((((((((((......))))))))))).............)))).)))).))))......((((.....)))))))))).))))))).)))...((((.((...))))))..)).)).)))))).)..))))))))).....))))))))))....))))))))).))).))).))).))))))......)).)))))))))))))))))..)).))))))))))).)).)))).))))))......)))))))).(((((((((((((((((((........)))(((((((((.....(((......)))(((....))).(((..........))).)))))))))(((...(((((((.(((((...)))))((.(((((.....))).)).)).(((((((...((((.((((((...(((((.(((((((.......(((.(((((((((((((((((((((((.((((((((((.(((.(((.(((((.(((((......)))))(((........)))...))))))))..))))))))))))).)).....(((...(((.(((.(((((........((....)))))))...))).))).)))((.(((.(((((((.(((((((......))))).)).))........(((((.(((.((((((......((((((((..........((((((.(.(((((((.((((((.((((..((((....))))..)))))).)))).))).)))).))).))))..))))))))(((((((((...((((((((.....(((..........(((((.....((((((((......((((((((.(.(((((((.(((((((....(((.............)))..)))))))...(((.((((....(((((.......))))).....)))).)))(((....))).(((...((......))..)))............((((...........(((((((((.....(((.((((.....(((((((...(((((((...)))))))...((((((........)))))).((((((((...((((((((....((.(((.......))).))...(((((.(((.(((.(((....))))))))).))))).))))))))......))))).)))....((((((((((.(((((((((((........((((...((((..((((((((.(((((.....(((((((.....))).))))......))))).)))))))))))).))))...((((((((((.......))))))))))....((((((((((((...((..((((.......)))).))..))))))))))))........(((((((((..(((((...))))).(((.(((((....(((((.......))))).((((((((((.(..((((....))))..))))))).)))).))))).)))((((....))))(((((((.(((......(......)......)))..))))))).)))).))))))))).))))))).)))))).)))).))))))).....))))))).)))))))))........))))........)).))))).).))).)))))((((((.(.......).))))))(..(((((...((((((.((.(((((((((....((((((....))))))..((((((((.......))))))))..(((((((.((.((((...))))))...((((((((...))))))))(((((...(..(((.......((((.(((...((.(((....)))(((((....)))))((((((((......))).)))))(((((((.((((...))))...))))).)).)).))))))).....)))..)..))))).....((.........)).)))))))......(((((((..........))))))))))).)))))))))))))((((((((((..((((((((((.....((.(((.((....)).)))))))))))......((((......)))))))).))).....)))))))...)))))..).)).)))))).....)))))........)))..))))))))....))))))..))).......(((......))).....)))))).)))))))))))))))).))))))))))).)))))).)).)))).)))(((((.............)))))((((((((..(((...((((....((....))....)))).....)))..)))))))).....((.((......)).))(((((.........)))))........((((((((((.....((((..(((((((...(((((.((((((.(....)))))))((((((((((...((((.(((((....(((..((((........))))..)))..)))))))))...(((..((((((...))))))..)))...)))))).))))......))))))))).))).))))))))))))))............))))))).))))))))))).))))..)))))))....))))))).)))...)))))))))))))))))))))).((((...........))))..)))))))).))))..(((..(((((....(((.......))).....)))))..))).....(((((....)))))...))))))))..((((((......))))))..((.(((...((((((......)))))).....))).))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((({((((,(((((({({{,,..((((......))))((.((.(((((.((((........)))).))))).))})...((((....)))).{{{{(((((.(((((.((((((((((((((..(((((.(((((.,(((.,...{((({{,|,{{({((...,|||}.((((((((((....(((((((((((.((((((.((........)).))).)))...))))))).))))....))))))))))..})))))))),))))||}((((((((((((((((..{{.,((({(({......})),,.{((((.....))))}.{{((,(((({{.{{{.....,,.,.,,|||,,.}}}}.)))))))),})}.)))))))))))))))).||.{.((((((...((..(((({.,(((((.(((.,,..((.(((((((.(((......))).))))))))){{|.{{..,,,{((((.....,,..}})))..,,,))))}))).)))))))))).))...)))))).|,|}.....))}....)))))...))))).))))))))))))).))))).))).((((((.....)))))).|{|||,|{{|||||,|||||,,..}}}}||(,(((((,,,,((((((((((((..{{,((((,,..|||},|},,|||{,{,,.{{{{{,|,||||||)}|)|||}}|}||,,,||||}}}}}|))}}(((((,,..}))}}..((((((((.((((..(((..((......))....))))))))))))))).))))).,..,)}|||||,.}}})),||{.(((((((((((((((.{(((((((((({{|{{||||{{,(|||||,{.{{,{||||,,,,,||||||}|}}}||||||,,|{.((((((.(((((((,.....||{,({{,.....))|..,|||,...}}}....))))))).)))))).)}|||||,..,.,..|||||||||||.(((((({((,(({{((({,......((((((((((.(((((...))))){{((,.(((((((((,{((({.,(({.{....},}|}((((....))))..,..,},}|}},..}))))))))})))..|,{{(((((((((......)).))).,.|||.,.{({{{(({...,,))}.}))))..,)))))))))})))))},.,|,||,,..,{((,,,((.((((((...)))))))).|}},,,,,..((((((((({((((({({,,,|,},}|{.}}}}((.((((((((.((((((((.(((.(((((((({((((({{((((....)))).,|||,(((((((({.,(((..(((((..((.......))..))))).)))))))))))).,,,.((((....))))..|||..(((.((((.((((.(((((.((.(.((((.((((((......))))))))))}})).))))).......)))).))))...)))...,}}))})))))}}.{|,({,......}|.||||||||,|,.{|,(((((((......)))))}|,..((((..((..((((((..........,....))))))..)).,))))..))})))),}...})))))))))).)))))))...........)))))))))))).))...||||}}||...,,..)).})))))}})}))....}}|||},,,},}}|{,...{((((((((.((((..((.((.(((((((.........((((((((((((({,.,(((((((.....((((((.......))))))))))))).).}(((((.....)))))}}.)))))))))))..{{{(((((......,,,)))}))}(((((((((.(((((..(((((((((....))))))))).(((((........)))))((((..((((..(((.(((((.(...(((........)))...).))))).)))..)))))))),..,,{....,,),.((((((({.((((((((.,{((....)))))))))))..((((..(((((((..(((.((....)).)))..)))))))..)))).})).))))).(((((((,((..(((....)))..)).)))))))..))))).)))),,)))))))))))..))))..)))).))))))))},,||,.,,....})}}}}}}})))))||,,,|,,...,|,.,,..(((({(({...{({{,,{(((({{.,.......)).))))),,}.),)})),,,..))}))))),{(({((.(((,(((..(((((((.,.....,.)))))))(({.(((((((((......(((((.(((((,,,{{{||,..)))))}..(((((((((..{.((((((.((.{(....(((.((((((((((.(({.((((((((.(((((((((((((((......))))))))))){{{......,)},)))).))))},)))....,.((((.....)))))))))).))))))).)))...((((.{{...))))))..}}.)).)))))).}..)))))))))..,,.))))))))))....))))))))).))).))).))).)))))}...{{{((((({...)))))))))),..,}.)))))))))))}}}.)))).))))))......)))))}||.(((((((((((((((((((........))){((((((((.....(((......)))(((....})).(((..........))).))))))))|{,(,,{(((({{{.,{{|{..}))))){|.((((({.{,,,||.}|,||,{{{,,{{|,.((({.{{||||,,{(((((.(((((((.......(({,(((({(((((((((((((((({(.(((((((({{{(((.(((.((((({((,(,{{{{..,,,,)|||.}}}},..},,...})))))))..))))))))))))).}},...,(((...(((.(((.(((((....,.........),)))))...))).))).}}}|,.(((.(((((((.(((((((......))))).)).))........(((((.(((.((((((......((((((((..........((((((.{.(((({((.((((((.{{(({,((({...,))}}..},,})),}))).))).)))).})).))))..))))))))(((((((((...((((((((.....(((..........(((((.....((((((((.,,{{{((((((((.(,(((((,{.(((((((....(((,,........,,,)))..)))))))...(((.((((....(((((.......))))).....)))).)))(((....))).(((...((......)}..)))........,.{,((((...........,{{{{{{{{.....{((,{(({.....|||{{{{,,.(((((((...)))))))...((((((........)))))).,{((((((,{{({((({{{.,.,{{.(({.......}}},}},.,|||||,||{,|||||||,,,,})))))|||,}||||.||||||||...,{,|||||.,,,,,..((((((((((.(((((((((((........{(((...((((..((((((((.(((((.....(((((((.....)))},)))......))))).)))))))))))).)))}...((((((((((.......))))))))))....((((((((((((...((..((((.......)))).))..))))))))))))........((((({{{{..(((({...))))}.(((.(((((....(((((.......))))).((((((((((,{..((((....)))).,)}))))).)))).))))).)))(((({{..,,))||||{{(.({{,,....{..|,|,}.....})}},,))))))),)))),,)))))))))))))))).)))))).)))).,))}}})....,)))}))),}}}}}}}}}........)))}.,,,....)).)))}}.),))),))}}}((((((,(,,,....}.}}}|||{..,{|||..{(((({{{((.(((((((((....((((((....))))))..,{((((,(((((...(((((,{,{,(((((({,((.((((...))))))...{(((((({...}))))))}{((((...{,,({{.......||||,{((...{{.{{{....}}}(((((....)))))(((((((({...}}))).}))))(((((((.((((...))))...))))).)).}}.))))))),,}..))).,)}}))))}......|.}))}}...))})))))))......{((((((..........))))))})))),}))))))))))))|(((({{.|||}||||{|||||},.,,||.(((.((,...}}.})))}}))))),}|...{({,...,,.}}}|}}}}.,.......}|}))),..,))},,..,.)).)))))).....))))),.......)))..))))))})}...))))))..))).......(((......))).....)))))).)))))))))))))))).))))))))))).))))))).),))}},||}{((((...,,........)))))||||{{{{..(((,{{((,,.{{{(,....,|,,,.|}|}.....,}}..)))}}))),....|.}}||....}}}}))}|{{{,{{,....,})})),.......,(((((((((.....((((..(({{({{,,.(((((.((((((.{....}))))))((((((((((...(({,.{,,,{},,,{{{,.,,{{...,,{,{|||,,.,,,}})))))))},...|||..((((((...))))))..,,,...)))))).))))......)))))}))}.))).)))))))))))))}............))))))).)))))))||||.,},),,)})))))}}}.)))))))})},...)))))))))))))))))))))),,{,....,{,{||...,|{,..}}})))).}}}}}}|||,.(((((..,,(((.......)))....,})))},,}}|.....{(((|....}))))...}))))))).,((((((......))))))..{{.{{{.,.{(({{{,.....)))))).,,,,))).}}...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_052920.2 NCBI
AGACGGUACCCGGAGCGGAGCGAGCCAGAAGGGAGCAUGGUCCCCGCGC… 5325 nt 0.5808
Summary

Predicted to enable ubiquitin-like ligase-substrate adaptor activity. Predicted to be involved in proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process. Predicted to be part of Cul3-RING ubiquitin ligase complex. Predicted to be active in cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the KLHL29 as a shared upregulated differentially expressed gene in left ventricular tissue from animals with spontaneously occurring hypertrophic cardiomyopathy compared to healthy controls, with this expression pattern also observed in adult human HCM [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].