Basic Information

Symbol
KLHL31
RNA class
mRNA
Alias
Kelch Like Family Member 31 BKLHD6 BA345L23.2 KBTBD1 Kelch Repeat And BTB Domain-Containing Protein 1 Kelch Repeat And BTB (POZ) Domain Containing 1 BTB And Kelch Domain-Containing Protein 6 Kelch-Like Protein KLHL Kelch-Like Protein 31 KLHL Kelch-Like 31 (Drosophila)
Location (GRCh38)
6:53647916-53665756
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001003760.5
Sequence length
5776.0 nt
GC content
0.4008

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1540.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1654.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1572.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
................(((((((((..(((.(((((((((((....)))))(((...)))(((((...(.(((.((((((.((((..((((((.((((((.((((.((((..........((((((((..((((.((.((....(((....(.((((((....)))))).)....)))....(((((...))))).............((((........)))).))))...))))))))))))........)))).)))).(((((((.......(((...((((.....))))...))))))).)))...((((..((..(((.....((((......)))))))..))...))))....)))))))))))).....(((((..((((((((((..((((((((.((((((((((((((((......)))))......)))).....))))))).....(((...((((((((((((....)))..............................(((((((((.((...)).))).)))).)).(((...)))....)))))))))..)))((((..(((.((......)).))).))))....)))))))).....))))))))))..)))))((.((.(((..(((....)))..))).)).))......)))).....))))))))).)..)))))(((((((((((((..............)))))))..........)))))).)))))).)))..(((.....)))((((........(((((..((((((((.(((((.(((((.............))))).....(((((((((...(((...(((.(((((((...(((((..(((.((.((((...(((((((((((((...((((((.....))))))...((((((.....(((.(.((((((((....(((.(((((...(((((((.......(((...(((...))).....))).......)))))))))))).)))))))).)))).))).....)).))))...((((.((((................)))).))))......))))))))))).)).....((((((((((((((((((((((((((..(((.((((((((((((..((((......))).)..)))))))))))).))).((((.....)))).((.......)).........((((..((..((((..((((...((..((.((((.((((((((((..(((...(((((((...((((.....((((....))))......)))))))))))...))).....)))))).(((.....))).((..((.....))..)).)))))))).)).)).))))..))))...))..))))((((((.(........).)))))).....))))))).))).)))))(((.((((((...(((..(((((((.(.((((.(..((((((((.((.(((((((((((....(((((.(((((.(((((((...(((((((((.(((.((((((((...(((((((((....)))))))))(((((...(((((((((((((((....(((......)))..))))))).)))).....)))))))))....)))))))).)))))))..))))).((...((((..(((((((.((((.(.((((((....((......))...)))))).)))))..)))))))))))..))((((.(((((((....))))))).))))(.((((((.((..(((((.....((.(((((.(((....))).)))))))..)))))..)))))))).))))))))))))))))))..(((...)))....)))))))))))))...((.((((.....(((((((..((......))..))))))).)))))).((((...)))).((((((...((.(..((((((((.((((.(((..(((((((.((.((((.(((((((((((((.(((....((.((((((...)))))).))))).)))))).((((.(((((.......))).)).))))..)).).))))..))))..)).))))))).....(((((.((((((.(.((....)).))).)))))))))...((..((((((.(((..(((..........))).))).)))))).))..(((.(((((((((((.(((..(((.....((((.((.....)))))).................)))..)))...)).)))))).)))))).....................))).))))..)))))))).).))...))))))...))))))))..).)))).)...)))))))...)))...))))))...)))...)))).)))))))..........)))).))..))))))))...))))))).)))...)))....))))))))).................(((((((((.(((((.(((.(((((.(((((.......)))))...))))).))).))))).))).)))))).....))))).)))))))).)))))........)))).(((.((((..(((((((((((((((((((.(((((((...(((((.(((((.....(((((......(((((..(((.((((((((((.((((.....))))))))...((((.((((......)))).)))).)))))).)))(((((..((((((....((((...((((((........((((((.....((((..(((((((((.(((.(((((((((((((...)))))))((((((.((((((((...))))))))..))))))(((((((.((((.(((((((......(((....))).....((..((..((((((((.........................)))..)))))..))..))((((((((.((((((...((((((...(((((((((.(((((((....))))....(((.((((((((...)))))))).)))................))).))))))))).....)))))).(((.((((.((((((..((((((..(((.((((((.(((..((.((.((((.(.....).)))))))).))).)))))).))).))))))((((.....)))).......((((((.........))))))..............(((((((....))))))))))))))))).)))..((((.((((.((...((((.....))))..)))))).)))).((((((((((.....(((.(.((((((((...........((((...))))((((((((((....((((........))))....))))))))))((((((((((((..........(((((.....))))).(((((((((.(((((((((.....)))))))))......((.((((((...(((((........))))).)))))).))..((((((..((((((((........))))))))..)))))))))))))))......)).))))))))))...((((((((((((.............)))))))...))))).)))))))).))))....))))))))))..((((..((((.((((........))))))))))))..((((((((...(((((.(((..(((.((((((.((((.((..((((....(((((.............))))).....)))).)))))).)).((.(((((((.((.(((..........))).))...)).))))).))........(((((((((((....(((((((....)))))))..))))).))))))..))))..))).))).)))))..))))))))...))))))..))))).)))(((((..((((......)))).....)))))...(((.(((((.((....((((((..........)))))).....))..))))).))).)))))))..))))..)))))))))))))...))))))))))))..)))).)))))).........))))))...))))...)).))))...((((((((...((((((.......(((((((.......)))))))....))))))....)))))))).)))))........((((((((((((((.(((((...............((((((....(((((((((((.(((.((((((...........))))))))).((((....)))).((((((((((((.(((((((((((((((.((((.((....((((((((((.......)))).((((((((...)))))))).....((((((((...(((.(((.(((.(((((..(((((...))))))))))...))))))))).))))))))(((....((((....)))).....))).....((((((...(((((........)))))..))))))))))))..)))))).)))))))))....((.(((((.((((((..(((...(((((((((((..(((((((.....)))))))..))))((((.((((((((((.(.(((....))).).(((((.((((.((((((((((.(((((......)))))...(((((....)))))((((((((..(((......)))...)).)))))).....(((((((((..((((.((.....)))))).((((.........)))).................((((((((.((((((((((.(((((......((((.....)))).....))))).))........)))))))).))))).)))........)))))))))((((...(((.......)))...))))....((((((((((..(....)..))))))))))....))))))))))..)))))))))....(((((((..((((((...(((......)))....))))))..)))))))..))))...))))))))))...).))))))))).))))...))))))).))...)))))).)))))))).))))....((((((((...))))))))..((((((....))))))((((((..(((((.((((....(((...(((...(((.(((((((..(((.((((((...))))))..((((((...((((......))))..)))))).....((((((........................)))))).)))..))))))).)))...))).)))....))))))))).....))))))..((((..(((....)))..))))....((((......((((((((((((....))))))))))))..))))........(((.((((((................)))))))))......)))..))))))))..)))))))))))))))))...)))))))).......(((((((..........)))))))..)))))...))))).....))))))))))..))))))).)))))))...............((.(((((((......))))))))))))))))))))).))))..)))...........................((.(((((((.(((((..(((..........))).))))).))))))).)))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......,.....,,.(((((((((...((((((.(((((((....)))))))....{(((....((((.((((.,{.....{(((.((((.....)))).}))|,.{{(.,,.(((((....((((((((((((({{((.({{.....,|||.}}}}((((((((((((....(((((...(((({...})))).((((({,{{(((((((((,.,((((.(((((((((((((.((((((..{{{,.,{(...}..})},|((((((.......(((((,...|((,,(((({{{,.{{{{{{{(({...,|||}},({{((((({..((((......)))),||,.||,,.}|||||,,}},,}})),,)}},,,,|,,|}}}|}}}}((((,...}))))..{((((...)))}|((((......)))),..,,,,}{{({{{..,{{{||{.{{{|,((.....)}.|}}},}},,},}},,}}}}),,......,}.))))))))))))))))).)))))))).))))))))){(({,..((((((((((.,.((((((((..........((((((.(((.(((.((((...,......(((((((((({{((((((((((((((((.{{{((({{{,(((.((((((((.(((.,{......},..)))..))))))))))).)}.)})))}.(((((((((((((.,............)))))))..........))))))))))))))))..))))},..{{((((((.....)))}}))}}.,,.....({((((.(((({...}})))...))))))......,})))..))))))))(((.{.{((((...})))}.}.))})))).)))))).))))))..))))))))..)))))))...,{{{{(((((({{{(((......{,|,|{{,}}})))),})},}}}}},)))))))....((((((((....((((((.,.....,{{(({.{{........)).))}.||,((((((((((((.((((((..,,{({(((,,,|||||}.......,{{{{,{{{{{.,{{{,......,,{{||..,||.,}|}},,{{{{..,{(((({,(((.{{,|||||}}(((.((((((((((((..{(((......))).)..)))))))))))).))).||||,,...}}},.,,.......)))})}}}},,|{{{..((..{{((..((((...((.,,..{({(,((((((((((,.(((...(((((((...((((.,...((((....))))....,.)))))))))))...)))..,.|||||},.{{,....}))),{{..{{.....}},.}}.,))))))).,},,,.}|||..||||,,.||..}}}}{{{{((,(,{{{,,..|{||}||}....}}})})))|}}..||}||{||,,,||}}...||,,.,|||,||}|}||{{{|}}||}||||,.{{.(((((((((((....(((((.((((,,(((((((,,.(((((((((.(((.((((((((...(((((((((....)))))))))(((((,..{(({(((((((((((....(((......)))..))))))).)))).,,..)}}))))))....)))))))).)))))))..))))).|,...((((,.(((((((.((((.(.((((((.{,.((......)).,,)))))).)))))..)))))))))))..,|((((.(((((((....))))))).))))|.((((((.((..((({{..,,.(,{(((((.(((....))).))))))).,)))))..)))))))).})))))))))))))))))..(((...)))....)))))))))))|||..{{.((((..,..(((((((..((......))..))))))).)))))}.|}}|..,{{{.{{.{((({{{(,,({.,,..,((({,|,,..,.}})))}}})))).))),..}},)}}((((((.{{{....{(.((((((...)))))).))))).)))))).)))))).)))))))))))),.)}))))))...)))))))).|.{{{..,..{{(({..{{{,..,.},}},,,}}))),,...))},{(((({...((((((((((((((.((.(((((((((((.{((,,{{(((,...))))}||}{,(((.{{((((((({{.(((..(((.....((((.(,.....}})))).................}}}..)))...,}.))))))}.}||||.......,,,|,,.,....,}},|,}|||..{(((|({{,(({({,,{|||||...}{|||||,,.,..}|},|}.,||,||,{{{{{{{...{.||{..,}}))})}})})|}}....,{{{|,....,(((((....,{{(((,(((((.,,.((,...(({(({{,,,{,,,,,,............((((...(((((((((.(((((.(((.(((((.(((((.......))}))...))))).))).))))).))).))))))...))))...,{{{{{.{{.{{(((((((..............)))).)))))},.))))}}|}}}}........)))))..}}...))))).)))},..,,,,..)}}}}.....}))},(((((.((((.....))))))))).....,..,,},,,,)))))))))}},||||||}|,||,||||||||,(((((((((..{{(.........,,,,...(((((....(((({.(((.((((....}))).})}.)))))))))){{{{.((((((.((((((((...))))))))..)))))).}}}}........,{{.{({.....}}},}}........,,..))))).))))..{{{{..{{{{{{,,..,..{{{,...}))}...})}}...((((((....(((((........((((((...(((((((((.(((((((....))))....{((.((((((((...)))))))).)}}................}}}.))))))))).....)))))).{{{.(((,{((((((..((((((..(((.{(((((.{((..((.((.((((.{.....}.)))))))).))).)))))}.))).))))))((((.....)))).......((((((.,.....,.)))))).,............(((((((....))))))))))))))))).}}}..,(((.((((,{{...((((.....))))..}))))).)))|{{{(((((,...}}}}}}},.}},,,,....}))))....)))))),}}))))),,})))}},,..))))))))))).)).))))))))))))))...}))))}...)))).)))))))))))))}.})).}))))).,.{,{.(((((((((.....))))))))).,.|..{{,..{{{{.....,.,...,,,,.{{{(((({.{{{(({{{((((((..((((((((........))))))))..)))))))||||{|{((...|||,|}}|}}}{{{{{{.,.({.{((((((.,,,{{{{{.||,,{{{{{{.(((((({,.....,})))))).}}},,))),.}}})))),.......,||||||.},..,))))}...))))))).}))))))}......,}},})))))))))))))))).....((((....(((((.............))))).....)))).(((({(,...{{.{{{|||{,{,.,{{.........,})}}),...}))))}}}.|},,,,....(((((((((((....(((((((....)))))))..)))))},))))).}}}})),,.,.,,,)))))))))..,))))...{(((((..{{,,{.((({{(((..((((......}))}.....}}}}}}})}.}}}}}}})})}...{(((((..........))))))..))))).,}))).}}))))))))....)))}.{(({..{{,.{(((((..,...|{{|,,,((((((((((|.|{{,,,.{((((((({{{((({(({..,,{{{{,,,{(((((((...((((((.......(((((((.......)))))))....))))))....)))))))}((((((((((((((((((((((,{,,((((({...((((((((((((((,,,{({..,.(((((..((((((((.((((((...........))))))))).(((((((((.(((((.((((.(((.....(..(((((((((.((((.((....((((({((((.......)))).((((((((...))))))))..,,.((((((((...(((.((,,(((.(((((..(((({...})))))))))...))))))))).))))))))||...,.((((....})))............,{{((((.|.(((((.,....,.)))))..))))))))))))..)))))).)))))))))..}....,((((((...)))))}..,}.......((((..(((((((.....)))))))..))))}}}..)))))))}).))))))}..}).....(((((.((((.((((((((((.{{,,,...||,|||||..,(((({....})))}|(({{{,{,,({{..,...}},..,}|.}}}))}.....{{{{(((({..,{{{.{|.,...}|}}}}.{{{{........,||||,(.(((((..,((.....)))..))))).}|(((((.{,.{,,.((((((((((.((((..,{,{.....}}}.....,..)))).))))))))).},....)),))}))}}))}}|((({.,.{{{..,.,,,))),},}}))|,,.|{((((((((..{....}..)))))))))}....))))))))))..))))))))).))))}..,.})}}|,|,,,,,.,,)))))))))))))).,,|,{{|.{((.(((((,{{...{((((({{...{{{((|.,{((((.(((({,{{|,,{.,|.....(((,,((.((((((....{{{{,((((((({...})))))))..,,,{{{,{{{|||,||{(((({,..,,.,..||},...}})}.}}})))},,...}})}}...}))))).}}..)))}}})),}.,||))))).))))}}}}.,{{{..,,}}),.....,,,,....}}}...))))))))....}}})))).))).})},}}}))},,,,|{{{|.|.,,.....))..))))}......)))))},))))},..,})))}})))))).....{{,,......{((({{{{{{||,,,,))))))))))))}})})}........,,,.((({{,..,,,......},,,}))))))}}}......,{|,,......,|||......,{{{||||{{{{{{,,,{{..........|||||||.....,|{{{}||,((({...}))),,.}}}}..,,,,,,|,|||}.|||||||.,,,,|||,..,}})}}},.)))))}},},,|{{{((((((.{{,....})}.)))))}.}},|{{{{,||||.......,,},........}},,.,,})))))))))))}...})),,.))))))}}...)))}...)))))).....)))))))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001003760.5 NCBI
AAAAAUUGCUGCAGCCGGGUCUUGUCAGGUGGCUGCUGGUGGCUCCCCA… 5776 nt 0.4008
Summary

Involved in negative regulation of JNK cascade and negative regulation of protein phosphorylation. Located in cytoplasm and nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the KLHL31 as a differentially expressed gene downregulated in left ventricular tissue from animals with hypertrophic cardiomyopathy compared to healthy controls [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].