Basic Information

Symbol
KLK13
RNA class
mRNA
Alias
Kallikrein Related Peptidase 13 KLK-L4 Kallikrein-Like Protein 4 Kallikrein-13 KLKL4 Kallikrein-Like Gene 4 Kallikrein 13 EC 3.4.21.- EC 3.4.21
Location (GRCh38)
19:51055626-51065114
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015596.3
Sequence length
1820.0 nt
GC content
0.4973

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-508.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -543.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 531.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001348177.2 NCBI
GCCCUCCCCUCCCGAUCCCGGAGCCAUGUGGCCCCUGGCCCUAGUGAUC… 1601 nt 0.4803
NM_001348178.2 NCBI
GCCCUCCCCUCCCGAUCCCGGAGCCAUGUGGCCCCUGGCCCUAGUGAUC… 1364 nt 0.4597
NM_015596.3 NCBI
GCCCUCCCCUCCCGAUCCCGGAGCCAUGUGGCCCCUGGCCCUAGUGAUC… 1820 nt 0.4973
Summary

Kallikreins are a subgroup of serine proteases having diverse physiological functions. Growing evidence suggests that many kallikreins are implicated in carcinogenesis and some have potential as novel cancer and other disease biomarkers. This gene is one of the fifteen kallikrein subfamily members located in a cluster on chromosome 19. Expression of this gene is regulated by steroid hormones and may be useful as a marker for breast cancer. [provided by RefSeq, Jan 2017]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the KLK13 is a vaginal fluid-specific mRNA marker used in a multiplex RT-PCR assay for forensic identification, showing a sensitivity of 97.2% in vaginal fluid samples [Akutsu et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2020.101715]. Subsequent research confirmed its high specificity (1.00) and sensitivity (0.89) for vaginal fluid, with positive detection maintained in 1:5 diluted samples and in aged stains stored for up to 8.5 years, establishing it as a reliable component of a comprehensive body fluid identification procedure [Akutsu et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2022.102087].