Basic Information

Symbol
KLK2
RNA class
mRNA
Alias
Kallikrein Related Peptidase 2 Kallikrein 2, Prostatic Glandular Kallikrein-1 Tissue Kallikrein-2 Kallikrein-2 HGK-1 Glandular Kallikrein 2 EC 3.4.21.35 EC 3.4.21 KLK2A2 HK2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification

MANE select

Transcript ID
NM_005551.5
Sequence length
2829.0 nt
GC content
0.5111

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1029.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1075.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 803.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
AAACUCACCACCUGGCCGUGGACACCUGUGUCAGCAUGUGGGACCUGGU… 2866 nt 0.5115
AAACUCACCACCUGGCCGUGGACACCUGUGUCAGCAUGUGGGACCUGGU… 2669 nt 0.5054
AAACUCACCACCUGGCCGUGGACACCUGUGUCAGCAUGUGGGACCUGGU… 2829 nt 0.5111
Summary

This gene encodes a member of the grandular kallikrein protein family. Kallikreins are a subgroup of serine proteases that are clustered on chromosome 19. Members of this family are involved in a diverse array of biological functions. The protein encoded by this gene is a highly active trypsin-like serine protease that selectively cleaves at arginine residues. This protein is primarily expressed in prostatic tissue and is responsible for cleaving pro-prostate-specific antigen into its enzymatically active form. This gene is highly expressed in prostate tumor cells and may be a prognostic maker for prostate cancer risk. Alternate splicing results in both coding and non-coding transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the KLK2 is a specific mRNA marker for seminal fluid detection, present in all tested semen samples including azoospermic samples with no observed cross-reactions with non-target body fluids [Albani & Fleming DOI:10.1016/j.scijus.2017.09.002]. In a subsequent developmental validation of a multiplex RT-PCR system, the KLK2 was included in a pentaplex assay for semen and seminal fluid, where it demonstrated a lower limit of detection of approximately 0.05 µL for semen and was successfully detected in post-coital vaginal swabs for up to six days [Albani & Fleming DOI:10.1016/j.scijus.2019.01.001]. A study in humans demonstrated that the KLK2 is a highly specific mRNA marker for seminal fluid identification, with minor to no off-target expression [Lynch & Fleming DOI:10.1016/j.scijus.2023.10.004]. Further research applied machine learning models to RT-qPCR data, where the KLK2 was used alongside other targets to discriminate body fluids, with Multinomial Logistic Regression achieving an overall accuracy of approximately 0.95 [Lynch et al. DOI:10.1016/j.forsciint.2024.112032].