Basic Information

Symbol
KLK5
RNA class
mRNA
Alias
Kallikrein Related Peptidase 5 KLK-L2 SCTE Stratum Corneum Tryptic Enzyme Kallikrein-Like Protein 2 Kallikrein-5 Kallikrein 5 EC 3.4.21.- EC 3.4.21.4 EC 3.4.21 KLKL2
Location (GRCh38)
19:50943299-50953314
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012427.5
Sequence length
1513.0 nt
GC content
0.5783

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-591.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -617.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 265.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001077491.2 NCBI
AGGAGGAGGCAGUGGCCAGGAAGGCACAGGCCUGAGAAGUCUGCGGCUG… 1378 nt 0.5798
NM_001077492.2 NCBI
AGGAGGAGGCAGUGGCCAGGAAGGCACAGGCCUGAGAAGUCUGCGGCUG… 1310 nt 0.5786
NM_012427.5 NCBI
AGGAGGAGGCAGUGGCCAGGAAGGCACAGGCCUGAGAAGUCUGCGGCUG… 1513 nt 0.5783
Summary

Kallikreins are a subgroup of serine proteases having diverse physiological functions. Growing evidence suggests that many kallikreins are implicated in carcinogenesis and some have potential as novel cancer and other disease biomarkers. This gene is one of the fifteen kallikrein subfamily members located in a cluster on chromosome 19. Its expression is up-regulated by estrogens and progestins. The encoded protein is secreted and may be involved in desquamation in the epidermis. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans evaluating skin- or sweat-characteristic mRNAs found that the KLK5 was detected in most body fluids except blood and sweat, with some vaginal fluid and urine samples showing expression levels similar to those in skin swabs, making it non-specific for identifying skin or sweat as a source of touch DNA [Akutsu et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2018.05.003].