Basic Information

Symbol
KLKB1
RNA class
mRNA
Alias
Kallikrein B1 KLK3 Kallikrein B, Plasma (Fletcher Factor) 1 Plasma Prekallikrein Plasma Kallikrein Fletcher Factor Kininogenin PKK EC 3.4.21.34 EC 3.4.21 PKKD PPK
Location (GRCh38)
4:186225424-186258476
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Tissue/body fluid identification Mixture deconvolution
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000892.5
Sequence length
2258.0 nt
GC content
0.4384

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-642.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -686.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 474.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((..(((..((..(((.((((((((((((.....((((((.(.(..((((((((.((((((.....((((((((((((((....))))).(((((((((..............)))))))))((((....))))(((.((........))))).)))))))))))))))..))))))))..).).((((((.(((.(((((((.((((((......((((((((.....(((((((((......((((((((.......((((((.(((....(((.....)))....)))))))))......((((((((....(((..((((((.(((((((((((................))))....))))))))))))).)))))))))))...((((((..(((((((((((....)))).)))))))....))..))))..((((((.((...((((...((((((.......((((.(((..(((((((((....((((((.(((..(((((((.(((((.............(((...)))............))))).(((..((((.....(((((((((((....((((..(((..((.(((.((((.....(((((((..(((((......((((((....(((.........)))....)))))).....))))).((((..((((((....(((...)))......))))))..))))(((((((((...(((((((((.((((((.((((((...((((.((((((((.(((....(((..((((((((((((((((((((....))))))))......(((((..(((..(((((.........))))))))....)))))....((.((((.(((.((((((.........(((....))).......(((((.......))))).........(.(((((((.................)))).))).).....)))))).)))...)))).)).((((((.....((((((((.........(((((((.(.(((..((....))..))))))))))).........))))))))))))))..)))))))))))).)))....)))........(((((((....))))))).......))))..)))).)))))))))).)))))))))))...((((((((((((((((((((..(((.....)))))).)))))))....(((((((....)).)))))((((.......)))))))))))))))))))))))))))..(((((.(((((......))).)))))))..)))))))..)))))))))..)))...))))..((((((((..........)))))))))))))))))))))))..))).)))))))))).))))))....))))))))).))))))).))))))...))))...)).))))))............((((((.((((...........))))))))))..((((((.((((...(((((((.((......)).))))(((((((.....((((...((((........(((.(((((((((...)))))).....((((((......((((.(((((((((....((((...(((((((....))))..)))...))))................((((....(((.((((....)))).)))...))))..........................))))))))).)))).))))))))))))........))))..)).))....))))))))))....)))))))))).....))))))))..))))))))).)))))))))))))).......)))))))..(((...))).)))))))))....(((((....)))))..))))))......)))))).)).)))).)))..(((((...(((((.(((((....(((((.(((....(((.((((......((((((...((...(((...........(((.((((((..........)))).)).))).(((((....(((((((....((((......))))))))))).....))))).......(((.((..(((((.....)))))..)).)))...(((((((.....)))))))..)))...))...))))))...))))..))).))).)))))...))))).))))))))))))....)))..)))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((..{{{..,{..(((,((({((((((((.,,,.((((((...{..((((((((.((((((.....((((((((((((((....})))).(((((((((...,..........))))))))){(((....)))}|||.{,.,,.....,,}},.)))))))))))))))..))))))))..),|.((((((.(((.(((((((.((((((......((((((({..,,.(((((((((......((((((((.,..,..((((({{(((....{{{.....,,),...))))))))},{,,{,((((((((..,.{{(..{(((((.(((((((.,(({{..............,.))}}..))))))))))))).)}})))))))),,,{,,,,{..(((((((((((....)))).)))))))...{{{{(({{{.,,(((((,({|..||||..,((((((...{{..((((.,(({,{((((((((....((((((.(((..{((((((.(((((.............(((...)))............))))).(((..((((.....(((((((((((....((((..(((..((.(((.((((.....((((((({.(((((..,...((((((....(((.,.....,.)))....)))))).....)))))},,...,((((({..,.((({{{,|,.....,))))))}})))){((((((((,,{({(((((((.((((((.((((((...((((.((((((((.(((....(((..((((((((((((((((((((....))))))))......{((((..,,,..{{{{{,,,,,,,..}}}}}}.,,,,,|||||,,.,,,,((((.(((.(((({{{((..{{{.{{,....,||.....,.{((({.......}})))..,,...,,.,,.,{{{{.................}))).)))..})).,)))})),})),},,,.)))}}||||||.....((((((((.{...,...(((((({,(.(((..((....))..))))))))))).....,..,)))))))),))))),,)))))))))))).)))....)))...,...,{{..,||,..||}}||,,.,}}}..))))..)))).)))))))))).)))))))))))...((({{{{{{{{((((({{|{,.(((,....))}})).))))))}....(((((((....)).)))))((((.......})))))))))))))))})))))))))}..(((({{(((((......))).)))))))..}))))))..)))))))))..)))...))))..((((((((.,.....,..)))))))))))))))))))))))..))).)))))))))).))))))....))))))))),),,)))).,))),}.....,}}}}}),||||||{...........((((((.((((...........)))))))))),}|||||.,{{,,,..{{{{{{{,||,.....}}.,)))||||||{|,,|...,|.}))}}|....,,,.,,,.{((((((((...}))))).....((((((......((((.(((((((((....((((...{((((((....)))),.)})...))))....,,,{,{......(({{....{{{.((((,,,.}}}}.}}}...)))),,,....,,.................))))))))).)))).))))))))),}}....,,|}}}},...|.,,{||.|||||||},,,,..,,,,)))))),....))))))))..))))))))),)))))))))))))).......)))))))..(((...))).))))))))).,,.(((((....)))))..))))))..,...)))))).)).)))}.)}}..,((((,..(((((.(((((....(((((.(((.,..(((.((((......((((((...((...(((...........(((.{(((((.(.......,))))),),))}.(((((....(((((((...{(({{......)))}))))))).....))))).......(((.((..(((((.....)))))..)).)))..,(((((((.....}))))))..)))...))...))))))...))))..))),))).)))))...))))).)))))))))))),...}}}..)))),........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000892.5 NCBI
AGUGCCACAUUAGAACAGCUUGAAGACCGUUCAUUUUUAAGUGACAAGA… 2258 nt 0.4384
NM_001318394.2 NCBI
AGUGCCACAUUAGAACAGCUUGAAGACCGUUCAUUUUUAAGUGACAAGA… 2187 nt 0.4463
NM_001318396.2 NCBI
AGUGCCACAUUAGAACAGCUUGAAGACCGUUCAUUUUUAAGUGACAAGA… 2289 nt 0.4386
Summary

This gene encodes a glycoprotein that participates in the surface-dependent activation of blood coagulation, fibrinolysis, kinin generation and inflammation. The encoded preproprotein present in plasma as a non-covalent complex with high molecular weight kininogen undergoes proteolytic processing mediated by activated coagulation factor XII to generate a disulfide-linked, heterodimeric serine protease comprised of heavy and light chains. Certain mutations in this gene cause prekallikrein deficiency. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

A study in human sepsis patients identified the KLKB1 as a potential diagnostic biomarker, finding it to be lowly expressed in the sepsis group compared to normal controls based on RNA sequencing data, with its mRNA expression pattern being consistent with its corresponding protein level [Wang et al. DOI:10.2147/IDR.S380137]. A study in humans demonstrated that the mRNA marker KLK3 is a highly effective and specific biomarker for semen identification, showing over 98% positive detection in both normal and infertile semen samples with minimal cross-reactivity in non-semen body fluids [Tian et al. DOI:10.1002/elps.202000238]. Furthermore, KLK3 was integrated into discriminant function analyses, achieving a 96.6% accuracy for normal semen identification and maintaining utility in broader semen identification contexts, including mixtures, as part of reviewed mRNA-based body fluid identification frameworks [Liu et al. DOI:10.1002/elps.202400077].