Basic Information
Symbol
KLRG1
RNA class
mRNA
Alias
Killer Cell Lectin Like Receptor G1
CLEC15A
MAFA
MAFA-L
2F1
Killer Cell Lectin-Like Receptor Subfamily G, Member 1
Killer Cell Lectin-Like Receptor Subfamily G Member 1
C-Type Lectin Domain Family 15 Member A
Mast Cell Function-Associated Antigen
ITIM-Containing Receptor MAFA-L
MAFA-Like Receptor
Mast Cell Function-Associated Antigen (ITIM-Containing)
C-Type Lectin Domain Family 15, Member A
MAFA-LIKE
MAFA-2F1
MAFAL
Location (GRCh38)
12:8950044-9010760
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
MANE select
Transcript ID
NM_005810.4
Sequence length
1874.0 nt
GC content
0.4029
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-514.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-550.69 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
456.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGAGAUUGGGCUGUUUCCUCACUGAUACAUAUCCCUUCACACUUCUAUA… | 1401 nt | 0.4111 | |
| AGUUCUCACGCUAGGUCUCCUCCGGGCGCUUCCCUAGCCCGUUCGCCGC… | 1895 nt | 0.4222 | |
| AGUUCUCACGCUAGGUCUCCUCCGGGCGCUUCCCUAGCCCGUUCGCCGC… | 2029 nt | 0.4199 | |
| AGUUCUCACGCUAGGUCUCCUCCGGGCGCUUCCCUAGCCCGUUCGCCGC… | 1844 nt | 0.4208 | |
| AGAGAUUGGGCUGUUUCCUCACUGAUACAUAUCCCUUCACACUUCUAUA… | 1874 nt | 0.4029 |
Summary
Natural killer (NK) cells are lymphocytes that can mediate lysis of certain tumor cells and virus-infected cells without previous activation. They can also regulate specific humoral and cell-mediated immunity. The protein encoded by this gene belongs to the killer cell lectin-like receptor (KLR) family, which is a group of transmembrane proteins preferentially expressed in NK cells. Studies in mice suggested that the expression of this gene may be regulated by MHC class I molecules. [provided by RefSeq, Jun 2016]
Forensic Context
A study in humans analyzing peripheral blood samples from myocardial infarction patients identified a 13-gene signature (HF.Sig) for predicting post-MI heart failure risk, which included the KLRG1 [Sun et al. DOI:10.3389/fimmu.2023.1163350].