Basic Information

Symbol
KMO
RNA class
mRNA
Alias
Kynurenine 3-Monooxygenase Kynurenine 3-Hydroxylase EC 1.14.13.9 Kynurenine 3-Monooxygenase (Kynurenine 3-Hydroxylase) DJ317G22.1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis

MANE select

Transcript ID
NM_003679.5
Sequence length
5017.0 nt
GC content
0.3899

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1238.37 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1340.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1460.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((........)))))....(((((((((.......(((((((((((......)))).))))))).......))))))))).............(((((((.((((((.(((((.((.(((........))).)).)).((((((...((((((((...((((..((.((....((.(((((((((..((.((((((.(.(((((..(((((.(((((((((.........))(((((.....))))).(((((.((.......))))))).((((((((((((..((((.((.((.((.....)).)).))))))...))).......)))))))))......((((((...((((...)))).....(((((((..............(((((..((.((((......))))...))..))))))))))))....((((((((((......)))...........((((((((..(((((((.((((..(((.....((((((((...((((((((((....((((((.((.((((....)))).)).)))..))).....((((.....))))..)))))))))))).))).))).....)))..))))))))))).)))))))).......((.(((((....(((((.....)))))))))).))..(((((.(((....(((((...((((..((((((..((((..((((.....................((((....((((((((((.(((....)))...))))))))))......))))(((((...))))))))).)))).....))))))..))))..)))))...))).)))))((((...)))).((((((((((((((((((..((((((((((((((((...(((((((((((((((.....(((((.(((((((..........)))))))................(((((.((..(..(((((((((.((((.((((.(((((((..(((..(((..(.((((...((((((.(((.(((..(((.((((((........)))))).)))..)))..)))....))))))(((.(((((((....)))))))..)))..(((((((.((...........((.(((((....))))).))(((((..(((((.((...((((...((((...((.(((.((((((((((((((....)))))))).(((......)))((((....................))))..))))))..))).))...))))))))))))))).)))))((((.((((((.....(((((((....(((((......)))))(((((..(((((....)))))..)).)))..................)))))))..(((((...(((.(((.(((((((((((((....(((.........)))((((.(((...)))))))..(((.((((.(((((((.........................(((.((((((((((.((((...(((((((...(((.((((((((.((((((...((((...(((.((((......))))...)))...))))...)))).)).)))((((((((...((((((((.....(((........)))((((..(((.(((....((..(...((((((((((((.(((((.....(((((((..(((((....((((................(((((((((.............(((......)))..((((((...(((((((((......(((.......))))))))))))..........((.(((((....))))).))....)))).))((....))..)))))))))...))))...............(((((......))))))))))..)))))))....)))))..)))).)))))))).)..))...))).))).))))....(((....)))......(((((((....)))))))..........((((((....)))))).................))))))))....)).))))))....))))).)))....)))))))......)))).))))))))))..)))...............................(((((((..(((....)))..)))))))(((((((((((((((...(((...)))...)))).)))))))))))))))))).))...)).))).....(((((.(((...........))).)))))((((......))))....))))))).))))))))).)))...)))))))))))...))))..((((((..........)))))))).))))))).)))).).))).)))))))))).)).)).)))).)).)))))))..)..)).)))))..((((.....))))..))))).......)))).......(((((..(((((..(((((......(((((.......)))))...)))))...(((((.(((.((((.((((.((((((.....((((((((((...((((.....(((((.((((.((((.(((((((((((..((((.(((..........)))))))..........((((((.(((((((....(((.((.(((...............))).)).))).....)))))))...........(((((((.(((((...)))))...(((.(((..((((((.(((...(((((.((((((((.(((((((...............................))))))))))))))))))))...)))))).)))((((((.((.(.((((((((((((.((((..(((((((((((.((((((....)))))).)))..(((((....((((((......))))))....................................(((((.((((......)))).))))).........))))).......((((((((.((((.....(((((..(((.((((((((......((..((((((.(((..((((((((..(((.....((((((((......................(((((((((((....(..((((...(((((((.((((.......((((((((((...))))))))))....))))..))))))))))).)..)))))))))))..)))))))))))..))))))))....)))..))))))..)).((((((((...))))))))(((((((..(((((.....((((((.(((.(((((......)))))...((((((((...(((((((......................)))))))))))))))(((((...........))).))......((((((((((((((.(((((((.....))))))).)))).)))....))))))))))))))))............))))).)))))))((.(((((((((.....))))).)))).))........(.(((((((...(((..(((((((((((..(((.....(((((((.((((.......)))).)))))))(((.....)))(((((........))))).....((....))(((((((..((...(((((((.(......))))))))..))..))))).)))))..))))))))))).)))...))))))).)..)))))))).))))))))..))))))))))))...))))))))....)))).)))))))........))))).)))..))))))((((((((((.....))))))))))((((((....))))))......))).)))((((((((.((...))))))))))....))))))).(((((.....((((....)))))))))((((..((((.....((((((((...)))).)))).....))))(((((((((.........))))))))).)))).))))))..)))).)))..)))).)))).)))).........)))))..))))..))))))))))(((.....(((((.((((((..(((((((.(((((...)))))..........)))))))..))))))..((.((((((.((((..((((....)))))))).))))))))........))))))))....(((((.(((((....((((....))))....)))))...)))))..........))))))..))))......)))).)))))))))))))..))))))))))))..))))....)))))))))))..))))))))).((((((.........))))))...((((((((.......(((.(((((.....((((.((((........................))))))))...))))).))).....))))))))............)))))))))))))).((((((.....))))))..................)))))))..............)))))).....((((((.........))))))))))))).)))))...)))))).)).)))).))...))))))))).))......)).)).....))))..))))))))...))))))..((((((((....))))...(((......)))......((((.(((.....((((((((..((....)))))))...))).....)))))))))))...........((((((((((((((.......(((((((...(((..((((..........))))..))))))))))))))))))..))))))...))).))))))...((((.(((.....))).))))...........((.((((((........)))))).))......(((..(((((.......)))))..)))................)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((........))))).,,.(((((((((.{...,.(((((((((((......)))},))))))).....,.))))))))}.............(((((((.((((((.(((({.((,(((,,,....,|||,||.}|.{(((((.,.((((((((...((((..((.((..,.((.(((((((((..{,.(((({(.,.(((((..(((((.(((((({{{,.....{{,||((,,,{{{{{.||||{((((,{((.......))))))).((((((((((((..((((.((.((.((.....)}.)).))))))...))),......}))))))))...,{{({,{(({.{((,{..((((......((((((({.....,,,,,,..,{|||,||,.((((......))))...}}..}))})))))))).....)))}..|,|}}..}})))}}}........((((((((..(((((({,((((..(((..,..(((((({(...((((((((((..,,((({{{.((.((((....}))).)).)})..))).,||,{|||,,.,.}},,..))))))))))))}})).)))..,..)))..))))))))))).))))))))....}}}}}}}))}....,|||||}},..,|||(((((((....((((((..(((((.((((.,,.,(((((((,,,,.,((({..,{,,,{{{{,.,,,|{{,{{,{{.{{{{....((((((((((.(((....}})...))))))))))......}}}|,(((,,,.,,,,}}|,,,|{{}|.,,.,},|||}||||||||{{{,||||...}}}}.||||,,.}}},{{{{,,,,||||}}.,,||||((((((((((((((((...(((((((((((,((({,{,.,{,{{.{{{((((,,,..,,,,,|||||||,,..,{{,,{({{{.{(((((.{{.{({{({{,{{{|,.{{{({((,,.,,,{{||}.{(({{(((,,(.{((({{,({(((({({,.(((..{{{.((((((........)))))).,}}..)))..)))},,{||||||(((.(((((((....))))))}..}}}..(((({{,.|},,,,...,,{.{(,(((({....})))}.}}|||{{,.(((((,((..,{{{,..{((({.,.,,.,||,|,,|,,((((((((....)))))))),{{(......}}}|((({{{.,.,.,.,,,....,{{||||.{{|||||..,}}.}}},.}}}}}|,|||||,||{|||,|((({.{(((({.....(((((((....,((({..,...,,,,|{{{{{..(((((....)))))..||.}}}..................)))))))..(((((...(((.(({,(((((((((((((...,((({{(......,,}((((.((,...})))))){{((..,,{,.||||{,,.....{{..................{{{.((((((((((.((((...(((((((...{((.((((({((.((((((...((((...(((,((({......)))},,.)))...))))...)))).)).)))((((((((,..((((((((.,,...,{{,,.{{.{|{{{{((,,(((.(((....((..,...(((((((({(((.(((((,,...(((((((..(((((....,,.............,,.{((((((((((...........,,{({{{..{{|,|..{{,,,,,..(((((((({.....,(((.......))))))))))))...,,,.}},}}}||||{,,...,})).......}}},.,.({....))..)))))))},,}}}})}...............{((((......))))})))))..)))))))...,)))))..})),.)))))))).}..))...))).))).}}}},...(((....)))......(((((((....))))))).{|{,.....((((((,...)}}))),,}}},.....,},,,.))))))))..,.)).))))))....))))).))}....)))))))......)))).))))))))))..}}}...............................(((((((..(((....)))..))))))),{(((({(({,{{{{.,,||(,{{|||,,,|}}}.||}|}|}||||||||||,.|{,..,..)))....})))}},|||...,}}...}})))}))))}({{{......))))},,.))))))).))))))))).)))...)))))}))))),},}}},.(((((((..........))))))),.,}}},,,.}}}|{|{||}.,,||||,,,..,..))}),,,})),,))),))}}.}}))})))))},{(((.....))))..,}|||..,,...)))).,,....{(((,..,{|||,,|||,{}|,|||||||,....,.,,,.....,|||||||||||||,,{{|{|||.|||{.{|{,||||,|||{{{(({{{{...,,{,,,,,,||,..,{{{||||,..{{{{.{.{{{..,(((,.((({....}}}}..))))||{|...,....{|{{{{.{{{||||||.,||||{|||,.,,,,,.......,,.)))}}},))},,,,,|}}|||}.,{,,,,,...,,{(({{,(((((...)))))....||,,,,..{{((({,{{{,,.(((((.((((((((.(((((((...............................)))))))))))))))))))).,.)}})))},}},,..,,.|||{{{....{((((((.((((.|(((((((((((,(({{{,....}))))),}},..{{,.,....((((((......)))))).,,......,,,,,.,||,{||.,|||||||,....{{{{{.{{{{.,,,,.}}}}.|||||...,|{|{{(((|{.....{{(((({,(({((,,..{{,{{{||..{{{.{|||||,,..,}}}}|{{(,,,,,}||{..((((((((..(((.....((((((({.....................,(((((((((((....,..((((...(((((((.((((..,....((((((((((...)))))))))).,,.))))..))))))))))).)..)))))))))))).)))))))))))..))))))))....),),,))))),....,((((((({...})))))))|,|||||},|||||.|},,||.{((((....,|||},....},}}|,..((((((((...(((((((......................))))))))))))))){{{,,..{{{...,||}||.||,,..,{{{((({{{{,((({.(((((((.....})))))).}))),)}),,|.})}}}}},.,},.|||,,,,......}})))}},|,,,|||{,.{((((((((.....))))).))))}}}},..,,,,|,(((((((...(((..(((((((((((..{((.....(((((({.((((,,...,.))))})))))))(((.....)))(((((........))))).....((....}}{((((((..((...(((((({,(......})))))))..))..))))).},))}..))))))))))).)))...))))))}.,..,,,}}))),)})}))},.,})))))))}}}}.,}))))))}),,}.)))).))))))}....},,}|{{(((((((({,,..((((((((((({{,.,.,,||||||..,,||}}}},))))))}}.....{{{((,,({(({(,{((,,,.,,,,}}}}})}}}}}}}},,.,|}}}}....,)))))}.,,))))))))))},.((((.....{(({((((...}}}}.}}||.....))))(((((((((......,..)))))))))...,,.)))))}..,}}},}},}}}},..,)))}})))}...,}}}})))))..}}}}..}}}}}})}}),,|.,,.,{(({{.,{{{({..{{{{(((.{{({(,,,}}}}}.}}},,.},})))))))..))))}}}}||||||{{{.((((({{({(,{{{|,,,,,,,,)})})).,.....}))))}|}|},,..,|||||,|||||.,..{{{{....}}},...}))))),},))}}},,},,},,.,))}))},.)}}),,,,||,,...,}})),,.))}})..}}}},)))))))}.})))....))))))))))).,}}}},,}}}.((((((.........)))))).,,,}}}}|||}.,,|,}},}}|||{|,},}}||||.,,|,,,..,,.,,}},,,.....}}))))),}...))))))))),{{{.{{{,....,})),)},,,,,...)))))).,..))))))).{|,{,{{(((((((({{.,,,.........,,.),))))))))))}}.......},,|||{.......|}}}..........,,))))))))).)))))...))))),.}).)))).},...))))))))).))...,..)).)).....))))..))))))))...))))))..{{{{((((....))))...{{{......}}}......{((,{(((.....((((((({..{(....}}))))}..,))).....))))))}||||..,,,,,..,.({{{{{{{{(((({.,,,...((({{.....|||,||.||,.,|},},}}}}})}}))))})))))))}))})}}}))))}),,,))).))))))...((({.,,,.....}}}.})))..,,|,,...,((,((((({........}}}}}),)),,,}.,|||..(((({.......))))}..))},,,.......,,....)))))))

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GAGACACAGAAAUCAGUGUCACUCAGUGACAGAAGCAACAAUAAUUGUG… 4978 nt 0.3895
GAGACACAGAAAUCAGUGUCACUCAGUGACAGAAGCAACAAUAAUUGUG… 5017 nt 0.3899
Summary

This gene encodes a mitochondrion outer membrane protein that catalyzes the hydroxylation of L-tryptophan metabolite, L-kynurenine, to form L-3-hydroxykynurenine. Studies in yeast identified this gene as a therapeutic target for Huntington disease. [provided by RefSeq, Oct 2011]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the KMO gene, involved in amino acid metabolism, was downregulated as part of the metabolism of amino acids and derivatives pathway in the hippocampus and kidney during sepsis [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].