Basic Information

Symbol
AOX1
RNA class
mRNA
Alias
Aldehyde Oxidase 1 AO AOH1 Azaheterocycle Hydroxylase Aldehyde Oxidase EC 1.17.3.- EC 1.2.3.1
Location (GRCh38)
2:200585864-200677064
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001159.4
Sequence length
4928.0 nt
GC content
0.4535

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1485.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1579.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1429.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001159.4 NCBI
ACUCGGCGGGUCGGUGCCGCCGGGUCCCAGGUGCCCGCUACUUCCCAGA… 4928 nt 0.4535
Summary

Aldehyde oxidase produces hydrogen peroxide and, under certain conditions, can catalyze the formation of superoxide. Aldehyde oxidase is a candidate gene for amyotrophic lateral sclerosis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans analyzing heart tissue from patients with various structural heart diseases identified a common 62-gene expression signature, where the AOX1 was significantly down-regulated in diseased samples compared to controls (mean fold change 0.5363, adjusted p-value 6.0757 × 10^-18) [Fajarda et al. DOI:10.1186/s13040-020-00217-8].