Basic Information

Symbol
KMT2E
RNA class
mRNA
Alias
Lysine Methyltransferase 2E (Inactive) HDCMC04P SETD5B MLL5 Myeloid/Lymphoid Or Mixed-Lineage Leukemia 5 (Trithorax Homolog, Drosophila) Myeloid/Lymphoid Or Mixed-Lineage Leukemia Protein 5 Inactive Histone-Lysine N-Methyltransferase 2E Lysine (K)-Specific Methyltransferase 2E Inactive Lysine N-Methyltransferase 2E Histone-Lysine N-Methyltransferase MLL5 Histone-Lysine N-Methyltransferase 2E Lysine Methyltransferase 2E NKp44L ODLURO
Location (GRCh38)
7:104940943-105115019
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_182931.3
Sequence length
7782.0 nt
GC content
0.4194

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1953.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2102.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1833.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001410908.1 NCBI
AGAGCGAGAGGCAGUGACACUGAGCGGGCGCAGGGGGCCGAGUCGGAGA… 7582 nt 0.4190
NM_018682.4 NCBI
AGAGCGAGAGGCAGUGACACUGAGCGGGCGCAGGGGGCCGAGUCGGAGA… 7634 nt 0.4192
NM_182931.3 NCBI
AGAGCGAGAGGCAGUGACACUGAGCGGGCGCAGGGGGCCGAGUCGGAGA… 7782 nt 0.4194
Summary

This gene is a member of the myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (MLL) family and encodes a protein with an N-terminal PHD zinc finger and a central SET domain. Overexpression of the protein inhibits cell cycle progression. Alternate transcriptional splice variants have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the KMT2E transcript is one of 13 downregulated transcripts identified as a potential time-marker for estimating the time since deposition of bloodstains [Zhang et al. DOI:10.1016/j.forsciint.2024.111930]. In a separate human study, the KMT2E gene was identified as a differentially expressed gene upregulated in female obesity but downregulated in males, indicating a sex-specific transcriptional response to obesity in adipose tissue [Haltia et al. DOI:10.1002/oby.70078].