Basic Information
Symbol
KRT17
RNA class
mRNA
Alias
Keratin 17
Keratin, Type I Cytoskeletal 17
Keratin 17, Type I
Cytokeratin-17
CK-17
PCHC1
39.1
K17
Keratin-17
PC2
PC
Location (GRCh38)
17:41619437-41624842
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_000422.3
Sequence length
1517.0 nt
GC content
0.6190
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-633.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-659.33 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
406.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| ACACAACUUGGGGCCCCUCUCCUCUCCAGCCCUUCUCCUGUGUGCCUGC… | 1517 nt | 0.6190 |
Summary
This gene encodes the type I intermediate filament chain keratin 17, expressed in nail bed, hair follicle, sebaceous glands, and other epidermal appendages. Mutations in this gene lead to Jackson-Lawler type pachyonychia congenita and steatocystoma multiplex. [provided by RefSeq, Aug 2008]
Forensic Context
A study in mice and humans demonstrated that the KRT17 is significantly up-regulated in UVB-irradiated skin at the peak of hyperalgesia, with a fold change of 17.9 in human and 19.2 in rat skin [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338]. In a separate investigation of human skin wound healing, the KRT17 was identified as a marker expressed in wound-edge keratinocytes via spatial transcriptomics, contributing to the cellular architecture of the healing margin [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013].