Basic Information

Symbol
KRT71
RNA class
mRNA
Alias
Keratin 71 KRT6IRS1 K6IRS1 KRT6IRS Type II Inner Root Sheath-Specific Keratin-K6irs1 Keratin, Type II Cytoskeletal 71 Type-II Keratin Kb34 Keratin 71, Type II Cytokeratin-71 Keratin 6 Irs HK6irs1 HK6irs CK-71 K71 Keratin-71 HYPT13 KB34
Location (GRCh38)
12:52543909-52553145
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033448.3
Sequence length
2263.0 nt
GC content
0.5820

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-872.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -907.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 644.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_033448.3 NCBI
AACCAGCAGAACCUUUUGGGAUUUUGCCUUCCUCCCUCCUGCAUCUGAG… 2263 nt 0.5820
Summary

Keratins are intermediate filament proteins responsible for the structural integrity of epithelial cells and are subdivided into epithelial keratins and hair keratins. This gene encodes a protein that is expressed in the inner root sheath of hair follicles. The type II keratins are clustered in a region of chromosome 12q13.[provided by RefSeq, Jun 2009]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.