Basic Information

Symbol
KRT8
RNA class
mRNA
Alias
Keratin 8 CK-8 CYK8 K8 CARD2 K2C8 CK8 KO Keratin, Type II Cytoskeletal 8 Type-II Keratin Kb8 Keratin 8, Type II Cytokeratin-8 Keratin-8
Location (GRCh38)
12:52897182-52949954
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002273.4
Sequence length
1784.0 nt
GC content
0.5930

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-725.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -757.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 517.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256282.2 NCBI
AUUCAGCAAAUGUUUGCGGAAUGAAUGGGGUGAGCUGGAGCCAGGACCU… 1793 nt 0.5929
NM_001256293.2 NCBI
CUUUCCUUACCUCCCUCCAUGCUGUCCACUUCCUCUGUAAAGCUCUCAA… 1881 nt 0.5938
NM_002273.4 NCBI
AUUCCUGAGAGCUCUCCUCACCAAGAAGCAGCUUCUCCGCUCCUUCUAG… 1784 nt 0.5930
Summary

This gene is a member of the type II keratin family clustered on the long arm of chromosome 12. Type I and type II keratins heteropolymerize to form intermediate-sized filaments in the cytoplasm of epithelial cells. The product of this gene typically dimerizes with keratin 18 to form an intermediate filament in simple single-layered epithelial cells. This protein plays a role in maintaining cellular structural integrity and also functions in signal transduction and cellular differentiation. Mutations in this gene cause cryptogenic cirrhosis. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

A study in human samples demonstrated that the KRT8 is found exclusively in the epithelial layers of the urogenital tract and rectum, indicating its tissue-specific identification [Schulz et al. DOI:10.1111/J.1556-4029.2009.01071.X].