Basic Information

Symbol
KSR1
RNA class
mRNA
Alias
Kinase Suppressor Of Ras 1 RSU2 KSR Kinase Suppressor Of Ras EC 2.7.11.1
Location (GRCh38)
17:27456448-27626438
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001394583.1
Sequence length
6026.0 nt
GC content
0.5700

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2378.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2476.71 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1331.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001367810.1 NCBI
GUCGCCGCGGCUUUCGCUUUGCUGCCGCGGCUGGGAGGGUGGAAGCGGC… 5945 nt 0.5704
NM_001394583.1 NCBI
GUCGCCGCGGCUUUCGCUUUGCUGCCGCGGCUGGGAGGGUGGAAGCGGC… 6026 nt 0.5700
NM_001394584.1 NCBI
AGUUCUAGCUGGGAGAGGUGGGUGCUGCAGAGUCUGGGAUUCCAGGGUG… 5491 nt 0.5556
NM_001394585.1 NCBI
AGUUCUAGCUGGGAGAGGUGGGUGCUGCAGAGUCUGGGAUUCCAGGGUG… 5449 nt 0.5568
NM_014238.2 NCBI
AGUUCUCUGAUGUAAAGCCUGGCAGUCCCGGCCUGCUUGGGGGCACCUG… 7280 nt 0.5489
Summary

Enables 14-3-3 protein binding activity and ATP binding activity. Involved in positive regulation of MAPK cascade. Located in cytosol; endoplasmic reticulum; and membrane. Part of protein-containing complex. Implicated in breast adenocarcinoma. Biomarker of breast cancer. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly downregulated the KSR1 in oligodendrocytes, implicating it within the Ras signaling pathway dysregulation associated with methamphetamine-induced glial dysfunction [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].