Basic Information

Symbol
AP3M1
RNA class
mRNA
Alias
Adaptor Related Protein Complex 3 Subunit Mu 1 Adaptor Related Protein Complex 3 Mu 1 Subunit AP-3 Complex Subunit Mu-1 Mu-Adaptin 3A Mu3A-Adaptin Adapter-Related Protein Complex 3 Mu-1 Subunit Adaptor-Related Protein Complex 3 Subunit Mu-1 Clathrin Adaptor Complex AP3, Mu-3A Subunit AP-3 Adapter Complex Mu3A Subunit AP-3 Adaptor Complex Mu3A Subunit
Location (GRCh38)
10:74120255-74151055
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012095.6
Sequence length
4889.0 nt
GC content
0.4095

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1300.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1398.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1124.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001320263.2 NCBI
GCGGCCUUCUCGGCUUCUCCAGCUUCGGUAGGAGAGGAUCCGGCGCCGA… 5176 nt 0.4171
NM_001320264.2 NCBI
GCGGCCUUCUCGGCUUCUCCAGCUUCGGUAGGAGAGGAUCCGGCGCCGA… 5309 nt 0.4257
NM_001320265.2 NCBI
GCGGCCUUCUCGGCUUCUCCAGCUUCGGUAGGAGAGGAUCCGGCGCCGA… 4727 nt 0.4110
NM_012095.6 NCBI
GCGGCCUUCUCGGCUUCUCCAGCUUCGGUAGGAGAGGAUCCGGCGCCGA… 4889 nt 0.4095
NM_207012.4 NCBI
GCGGCCUUCUCGGCUUCUCCAGCUUCGGUAGGAGAGGAUCCGGCGCCGA… 5015 nt 0.4126
Summary

The protein encoded by this gene is the medium subunit of AP-3, which is an adaptor-related protein complex associated with the Golgi region as well as more peripheral intracellular structures. AP-3 facilitates the budding of vesicles from the Golgi membrane, and it may directly function in protein sorting to the endosomal/lysosomal system. AP-3 is a heterotetrameric protein complex composed of two large subunits (delta and beta3), a medium subunit (mu3), and a small subunit (sigma 3). Mutations in one of the large subunits of AP-3 have been associated with the Hermansky-Pudlak syndrome, a genetic disorder characterized by defective lysosome-related organelles. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

A study in human post-mortem blood samples demonstrated that the AP3M1 was included in a post-mortem interval (PMI) prediction model, where it showed a negative coefficient, indicating its down-regulated expression pattern was associated with increasing PMI [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z].