Basic Information

Symbol
LACTB
RNA class
mRNA
Alias
Lactamase Beta MRPL56 Serine Beta-Lactamase-Like Protein LACTB, Mitochondrial Serine Beta-Lactamase-Like Protein, Mitochondrial FLJ14902 Mitochondrial 39S Ribosomal Protein L56 Mitochondrial Ribosomal Protein L56 EC 3.4.-.- G24
Location (GRCh38)
15:63121833-63142061
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032857.5
Sequence length
1911.0 nt
GC content
0.4448

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-574.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -613.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 570.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001288585.2 NCBI
GCAGAGACGCCAUGUACCGGCUCAUGUCAGCAGUGACUGCCCGGGCUGC… 2942 nt 0.4256
NM_032857.5 NCBI
GCAGAGACGCCAUGUACCGGCUCAUGUCAGCAGUGACUGCCCGGGCUGC… 1911 nt 0.4448
NM_171846.4 NCBI
GCAGAGACGCCAUGUACCGGCUCAUGUCAGCAGUGACUGCCCGGGCUGC… 2946 nt 0.4257
Summary

This gene encodes a mitochondrially-localized protein that has sequence similarity to prokaryotic beta-lactamases. Many of the residues responsible for beta-lactamase activity are not conserved in this protein, suggesting it may have a different enzymatic function. Increased expression of the related mouse gene was found to be associated with obesity. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different protein isoforms. [provided by RefSeq, Dec 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.