Basic Information

Symbol
LAG3
RNA class
mRNA
Alias
Lymphocyte Activating 3 CD223 Lymphocyte Activation Gene 3 Protein Lymphocyte-Activation Gene 3 CD223 Antigen LAG-3 FDC
Location (GRCh38)
12:6772360-6778455
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002286.6
Sequence length
1976.0 nt
GC content
0.6402

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-850.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -885.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 382.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001414176.1 NCBI
AGAGACCAGCAGAACGGCAUCCCAGCCACGACGGCCACUUUGCUCUGUC… 2062 nt 0.6406
NM_001414177.1 NCBI
AGAGACCAGCAGAACGGCAUCCCAGCCACGACGGCCACUUUGCUCUGUC… 1733 nt 0.6497
NM_002286.6 NCBI
AGAGACCAGCAGAACGGCAUCCCAGCCACGACGGCCACUUUGCUCUGUC… 1976 nt 0.6402
Summary

Lymphocyte-activation protein 3 belongs to Ig superfamily and contains 4 extracellular Ig-like domains. The LAG3 gene contains 8 exons. The sequence data, exon/intron organization, and chromosomal localization all indicate a close relationship of LAG3 to CD4. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for LAG3 Gene

Forensic Context

A systematic review of postmortem human brain studies found that the LAG3 protein staining was increased in the hippocampus of suicidal patients with bipolar disorder [Yamamoto et al. DOI:10.3390/Ijms25115750].