Basic Information

Symbol
LAMP1
RNA class
mRNA
Alias
Lysosomal Associated Membrane Protein 1 CD107a Lysosome-Associated Membrane Glycoprotein 1 Lysosome-Associated Membrane Protein 1 CD107 Antigen-Like Family Member A Lysosomal-Associated Membrane Protein 1 CD107a Antigen LGP120 LAMP-1 LAMPA
Location (GRCh38)
13:113297088-113323674
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Individual identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005561.4
Sequence length
2701.0 nt
GC content
0.5516

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1028.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1077.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 789.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005561.4 NCBI
ACGUGACAAGCGCUGCCGGCCGCGGUGUCUUCUUCGUGCCGGCGUCGCA… 2701 nt 0.5516
Summary

The protein encoded by this gene is a member of a family of membrane glycoproteins. This glycoprotein provides selectins with carbohydrate ligands. It may also play a role in tumor cell metastasis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans using peripheral blood leukocytes from monozygotic twins and unrelated individuals found that the LAMP1 was identified as a housekeeping gene and exhibited differential expression between a specific male twin pair, belonging to the least variable category of random variations [Sharma et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00228.2003].