Basic Information

Symbol
LANCL3
RNA class
mRNA
Alias
LanC Like Family Member 3 LanC-Like Protein 3 LanC Like 3 FLJ42925 LanC Lantibiotic Synthetase Component C-Like 3 (Bacterial) LanC Lantibiotic Synthetase Component C-Like 3
Location (GRCh38)
X:37571569-37684463
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001170331.2
Sequence length
10123.0 nt
GC content
0.3947

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2763.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2961.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2544.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001170331.2 NCBI
ACUCGGGAGCCUCGCGGCAGCCCGGCGCCCCACUUGGCCAUCCGCUCCU… 10123 nt 0.3947
NM_198511.3 NCBI
ACUCGGGAGCCUCGCGGCAGCCCGGCGCCCCACUUGGCCAUCCGCUCCU… 10206 nt 0.3944
Summary

Predicted to be involved in carbohydrate metabolic process and peptide modification. Predicted to be active in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human trauma patients demonstrated that the LANCL3 mRNA was significantly downregulated in circulating CD3+ T cells during the injury stage compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881].