Basic Information
Symbol
LAPTM4B
RNA class
mRNA
Alias
Lysosomal Protein Transmembrane 4 Beta
LC27
Lysosome-Associated Transmembrane Protein 4-Beta
Lysosomal-Associated Transmembrane Protein 4B
Lysosomal Associated Protein Transmembrane 4 Beta
LAPTM4beta
Location (GRCh38)
8:97775057-97853013
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_018407.6
Sequence length
2442.0 nt
GC content
0.4521
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-750.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-794.71 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
545.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUCCCCGCCGCUGCAGCGGUCGCCUUCGGAGCGAAGGGUACCGACCCGG… | 2442 nt | 0.4521 |
Summary
Enables ceramide binding activity; enzyme binding activity; and phosphatidylinositol bisphosphate binding activity. Involved in several processes, including endosome transport via multivesicular body sorting pathway; negative regulation of macromolecule metabolic process; and regulation of lysosomal membrane permeability. Located in several cellular components, including endosome; lysosomal membrane; and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that the LAPTM4B gene showed the greatest increase (5.66 log2 fold) in juvenile CCI-injured whole blood versus sham and was elevated in juvenile over adult CCI-injured samples, being associated with transport processes [Hazy et al. DOI:10.1038/s41598-019-45089-z]. In severely burned adult humans, the LAPTM4B gene was up-regulated (fold change 1.93) in leukocytes from patients with burn size >40% TBSA, forming part of a 39-gene signature associated with platelet activation and degranulation [Sood et al. DOI:10.0000000000000905].