Basic Information

Symbol
LCLAT1
RNA class
mRNA
Alias
Lysocardiolipin Acyltransferase 1 ALCAT1 AGPAT8 Acyl-CoA:Lysocardiolipin Acyltransferase 1 LPLAT6 LYCAT 1-Acylglycerol-3-Phosphate O-Acyltransferase 8 1ysophospholipid Acyltransferase 6 1-AGP Acyltransferase 8 1-AGPAT 8 FLJ37965 Lysocardiolipin Acyltransferase EC 2.3.1.51 EC 2.3.1.- HSRG1849 1AGPAT8 UNQ1849
Location (GRCh38)
2:30447221-30644225
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001002257.3
Sequence length
4879.0 nt
GC content
0.3909

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1222.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1317.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1451.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001002257.3 NCBI
ACUAGGGCGACGGCCGGACGCCUCCGCGUUACGGGAUGAAUUAACGGCG… 4879 nt 0.3909
NM_001304445.2 NCBI
ACUAGGGCGACGGCCGGACGCCUCCGCGUUACGGGAUGAAUUAACGGCG… 5284 nt 0.3967
NM_001304446.2 NCBI
ACUAGGGCGACGGCCGGACGCCUCCGCGUUACGGGAUGAAUUAACGGCG… 4888 nt 0.3893
NM_182551.5 NCBI
ACUAGGGCGACGGCCGGACGCCUCCGCGUUACGGGAUGAAUUAACGGCG… 5071 nt 0.3936
Summary

Enables 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity. Predicted to be involved in phosphatidylinositol acyl-chain remodeling. Located in cytosol and endoplasmic reticulum. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in pigs demonstrated that the LCLAT1 gene, encoding lysocardiolipin acyltransferase 1, was uniquely upregulated in the biceps femoris of cold-exposed Tibetan pigs compared to Bama pigs, indicating its role in glycerophospholipid metabolism during cold adaptation [Yang et al. DOI:10.3390/ijms24087431].