Basic Information

Symbol
LDHA
RNA class
mRNA
Alias
Lactate Dehydrogenase A Cell Proliferation-Inducing Gene 19 Protein Renal Carcinoma Antigen NY-REN-59 L-Lactate Dehydrogenase A Chain LDH Muscle Subunit EC 1.1.1.27 LDH-A LDH-M Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Li 133P Proliferation-Inducing Gene 19 Lactate Dehydrogenase M HEL-S-133P EC 1.1.1 GSD11 PIG19 LDHM
Location (GRCh38)
11:18394347-18408425
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005566.4
Sequence length
2241.0 nt
GC content
0.4181

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-608.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -653.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 705.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135239.2 NCBI
GUGCUGCAGCCGCUGCCGCCGAUUCCGGAUCUCAUUGCCACGCGCCCCC… 2067 nt 0.4180
NM_001165414.2 NCBI
ACAAAGCGCGCAUGCGCGCGGAUCACCGCAGGCUCCUGUGCCUUGGGCU… 2427 nt 0.4215
NM_001165415.2 NCBI
GUGCUGCAGCCGCUGCCGCCGAUUCCGGAUCUCAUUGCCACGCGCCCCC… 1762 nt 0.4081
NM_001165416.2 NCBI
GUGCUGCAGCCGCUGCCGCCGAUUCCGGAUCUCAUUGCCACGCGCCCCC… 2117 nt 0.4162
NM_005566.4 NCBI
GUGCUGCAGCCGCUGCCGCCGAUUCCGGAUCUCAUUGCCACGCGCCCCC… 2241 nt 0.4181
Summary

This gene encodes the A subunit of lactate dehydrogenase enzyme which catalyzes the reversible conversion of pyruvate to lactate with the concomitant oxidation of NADH to NAD in anaerobic glycolysis. The protein is found predominantly in skeletal muscle and belongs to the lactate dehydrogenase family. Mutations in this gene have been linked to exertional myoglobinuria. The human genome contains several non-transcribed pseudogenes of this gene. [provided by RefSeq, Sep 2023]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the LDHA protein, which converts pyruvate to lactate, was found to be higher in expression in the skeletal muscle of heavier co-twins within BMI-discordant monozygotic twin pairs, indicating its involvement in glycolysis and redox stress in acquired obesity [van der Kolk et al. DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100226]. In a separate human study, the LDHA gene was identified as a potential biomarker for sepsis diagnosis, with its mRNA expression pattern found to be consistent with its corresponding protein level in a multi-omics analysis of patient serum [Wang et al. DOI:10.2147/IDR.S380137].